[发明专利]lmo2733作为靶点在制备检测、鉴别或诊断单增李斯特菌的试剂中的应用在审

专利信息
申请号: 202110048682.3 申请日: 2021-01-14
公开(公告)号: CN112662792A 公开(公告)日: 2021-04-16
发明(设计)人: 王菊芳;张旭;孙秋丽;马毅 申请(专利权)人: 华南理工大学
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/6844;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/01
代理公司: 广州市华学知识产权代理有限公司 44245 代理人: 崔红丽
地址: 510640 广*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: lmo2733 作为 制备 检测 鉴别 诊断 李斯特 试剂 中的 应用
【说明书】:

发明公开一种lmo2733作为靶点在制备检测、鉴别或诊断单增李斯特菌的试剂中的应用,属于致病微生物检测领域。本发明利用基因组数据库中的数据,采用比较基因组学的方法,挖掘到单增李斯特菌特异性基因靶点lmo2733,丰富单增李斯特菌检测靶标,并以lmo2733筛选稳定可靠的引物组合,包括PCR引物组和LAMP引物组,并分别建立稳定可靠的PCR和LAMP检测方法;PCR检测特异性、灵敏度良好,检测下限可达200pg;LAMP检测特异性、灵敏度良好,肉眼可视化的检测限可达2pg;满足了不同环境下的需求。

技术领域

本发明属于致病微生物检测领域,特别涉及一种lmo2733作为靶点在制备检测、鉴别或诊断单增李斯特菌的试剂中的应用。

背景技术

单增李斯特菌是一种人畜共患致病菌,常引起严重的食品安全问题,人类受感染后可造成脑膜炎、败血症、流产等症状,对老人、孕妇、儿童等免疫低下者会造成严重的后果,致死率达20%~30%。近几年随着我国饮食结构的变化,生食、快餐的大规模食用也会增加单增李斯特菌的爆发风险,因此对单增李斯特菌的检测十分必要。

核酸检测是一种稳定可靠的检测方法,已经大规模运用于致病微生物的检测领域。聚合酶链式反应(PCR)是最常用的一种方法,该方法稳定性好、特异性高,但需要仪器设备,无法在实验室外的环境开展。环介导等温扩增(LAMP)是一种在恒温条件下快速扩增的技术,该方法针对检测靶点序列设计4至6条特异性引物,可在65℃左右、60分钟完成扩增反应,反应过程中会产生大量焦磷酸根离子,该离子会与体系中的镁离子形成沉淀,导致镁离子浓度降低,羟基萘酚蓝(HNB)会随着体系中的镁离子浓度改变显示不同颜色,从而可以肉眼鉴别阴阳性结果。目前常用的单增李斯特菌检测靶点如hlyA、prfA、iap、16S等,亟待挖掘其他检测靶点基因,以满足不同环境下的需求。

发明内容

为了克服现有技术的缺点与不足,本发明的目的在于提供一种lmo2733作为靶点在制备检测、鉴别或诊断单增李斯特菌的试剂中的应用。

本发明的目的通过下述技术方案实现:

lmo2733作为靶点在制备检测、鉴别或诊断单增李斯特菌的试剂中的应用。

优选的,所述的lmo2733来自单增李斯特菌,GenBank:NC_003210.1(2805440..2807398)。

一种用于检测单增李斯特菌的试剂,包含能够检测lmo2733的引物;

具体的,以PCR为基础的检测技术,是实验室条件下最常用的检测方法,该方法稳定性好,特异性好、通量高。为评估lmo2733靶点的可靠性,决定首先建立PCR检测体系。使用的PCR引物组包括:

上游引物F:5′-GCAGCATTGATCCAACAAATG-3′;

下游引物R:5′-CGTAGCGTACGAAGATATTCG-3′。

PCR反应体系及条件:

PCR反应的体系采用25μL反应体系,包括1.5U taq酶(无3′外切酶活性),2.5μL10Xtaq酶Buffer,0.2mM的dNTP,2mM MgCl2,各0.2μM的引物F和引物R,2μL的DNA模板,再用ddH2O补齐到25μL。

反应条件为,95℃预变性3min;循环反应为95℃变性15s,53℃退火30s,72℃延伸110s,30个循环;最后72℃延伸10min,4℃保存。最后1.5%琼脂糖电泳20min。阳性样本会有1653bp的扩增条带。

在实际运用中,尤其是偏远地区和欠发展地区,常常没有复杂的实验室仪器设备,因此本发明在LAMP体系中加入HNB染料,可实现对检测结果的肉眼判断。所使用的LAMP引物组包括:

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