[发明专利]细胞图像分割的用户辅助迭代在审
| 申请号: | 202080062375.4 | 申请日: | 2020-09-02 |
| 公开(公告)号: | CN114341937A | 公开(公告)日: | 2022-04-12 |
| 发明(设计)人: | C·鲁那;C·里昂 | 申请(专利权)人: | 徕卡生物系统成像股份有限公司 |
| 主分类号: | G06T7/11 | 分类号: | G06T7/11;G06T7/00 |
| 代理公司: | 北京市金杜律师事务所 11256 | 代理人: | 酆迅 |
| 地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 细胞 图像 分割 用户 辅助 | ||
1.一种处理表示细胞的图像数据的方法,所述方法包括:
通过找到存在于所述图像数据中的多个细胞核中的每个细胞核并且确定它们的空间范围以获取核分割数据来执行对所述图像数据的分割以获取细胞分割数据,并且然后基于所述核分割数据,确定细胞质分割数据和细胞膜分割数据;
在显示器上显示图像窗格以及数据窗格,所述图像窗格包括根据所述图像数据的组织图像和所述细胞分割数据的分割图像的选择,所述数据窗格包括行和列的表格,所述行特定于在所述细胞分割数据中标识的细胞,所述列特定于细胞属性;
在编辑会话中通过与所述显示器的用户交互从所述分割数据中选择用于删除的多个细胞,其中通过在所述表格中选择针对细胞的所述行,所述细胞从所述数据窗格中可选择,并且通过在所述图像中通过其分割数据选择所述细胞,所述细胞从所述图像窗格中可选择;
响应于经由所述数据窗格的选择,相应地更新所述图像窗格以示出所述选择,并且响应于经由所述图像窗格的选择,相应地更新所述数据窗格以示出所述选择;
响应于用户命令,执行重新分割,所述重新分割考虑选择的用于删除的多个细胞,所述重新分割通过以下来进行:编辑所述核分割数据以移除与所述选择的用于删除的细胞相关的数据部分,并且然后基于编辑后的核分割数据,重新确定细胞质分割数据和细胞膜分割数据;以及
基于所述重新分割在所述显示器上重新显示所述图像窗格和所述数据窗格。
2.根据权利要求1所述的方法,其中所述编辑会话还包括:接收所述图像窗格中的用户输入,以标识用于添加到所述分割数据的多个细胞,并且其中所述重新分割通过以下来考虑标识的用于添加的多个细胞:编辑所述核分割数据以添加与所述标识的用于添加的多个细胞相关的另外的数据部分。
3.根据权利要求2所述的方法,其中在所述编辑会话中,响应于标识用于添加的细胞,通过在所述表格中添加针对所述细胞的行,所述数据窗格被更新。
4.根据权利要求2或权利要求3所述的方法,其中在所述编辑会话中,所述组织图像的特定区域中的一个或多个细胞被选择以用于删除,并且然后在相同区域中一个或多个细胞被标识用于添加。
5.根据任何前述权利要求所述的方法,其中针对所述图像窗格,所述用户被提供有用户界面控件,所述用户界面控件提供对以下每项的所述显示的独立控制:所述核分割数据、所述细胞质分割数据和所述细胞膜分割数据。
6.根据任何前述权利要求所述的方法,其中所述图像数据包括多个通道图像,每个通道图像与不同的染色剂相关联,并且所述组织图像是所述通道图像中的一个通道图像,或者融合在一起的至少两个通道图像的组合,并且针对所述组织图像,所述用户被提供有用户界面控件,所述用户界面控件提供对哪些通道图像将要被包括在所述组织图像中的独立控制。
7.根据任何前述权利要求所述的方法,其中在重新分割和重新显示之后,执行另外的编辑会话和另外的重新分割和重新显示。
8.根据任何前述权利要求所述的方法,其中所述重新分割被限制在所述组织图像中受所述编辑会话影响的多个细胞所在的特定区域。
9.根据任何前述权利要求所述的方法,其中在所述编辑会话中,所述表格利用用户界面控件逐列可排序,从而按照特定细胞属性的值对所述表格中的行的所述显示进行排序。
10.一种承载机器可读指令的计算机程序产品,所述机器可读指令当在计算机装置上加载和执行时,使所述计算机装置执行任何前述权利要求的方法。
11.一种加载有根据权利要求10所述的机器可读指令的计算机装置。
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