[发明专利]一种非洲猪瘟病毒LAMP-CRISPR检测用组合物、检测试剂盒和检测方法在审
申请号: | 202011529612.1 | 申请日: | 2020-12-22 |
公开(公告)号: | CN112522444A | 公开(公告)日: | 2021-03-19 |
发明(设计)人: | 郑海学;杨波;田宏;石正旺;李攀;王丽娟;麻园;罗俊聪;万颖;宋锐;付辉;袁克湖;朱海 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院兰州兽医研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 郑州大通专利商标代理有限公司 41111 | 代理人: | 张立强 |
地址: | 730046 *** | 国省代码: | 甘肃;62 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 非洲 猪瘟 病毒 lamp crispr 检测 组合 试剂盒 方法 | ||
1.一种非洲猪瘟病毒LAMP-CRISPR检测用组合物,其特征在于,包括LAMP扩增引物、crRNA和ssDNA探针;
LAMP扩增引物由内引物和外引物组成:
外引物:
2F3:5’-CTATAAACATATATTCAATGGGCC-3’;
2B3:5’-GCAATATACGCTTTAAACCATG-3’;
内引物:
2FIP:5’-ACGTGTCCATAAAACGCAGGTTTTTCAGACATTAGTTTTTCAT
CGTG-3’;
2BIP:5’-AGGTTGTGTATTTCAGGGGTTACTTTTTCATTAATGAAATCTCG
CTCAC-3’;
crRNA:AAUUUCUACUAAGUGUAGAUAUCGUGGUGGUUAUUGUUGGUGU;
ssDNA探针:FAM:5’-(FAM)CCACGGGAGGAATACCAACCCAGTG(BHQ1)-3’。
2.根据权利要求1所述的一种非洲猪瘟病毒LAMP-CRISPR检测用组合物,其特征在于,LAMP扩增引物中内引物和外引物浓度比为12 pmol/μL:2pmol/μL。
3.一种非洲猪瘟病毒LAMP-CRISPR检测用试剂盒,其特征在于,包含权利要求1~2任一项所述的组合物。
4.根据权利要求3所述的一种非洲猪瘟病毒LAMP-CRISPR检测用试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括用于LAMP扩增的LAMP反应缓冲液、Bst DNA聚合酶和荧光试剂,以及用于CRISPR Cas12a 检测体系的CRISPR反应缓冲液、LbCas12a和RNase抑制剂。
5.根据权利要求4所述的一种非洲猪瘟病毒LAMP-CRISPR检测用试剂盒,其特征在于,所述LAMP反应缓冲液由40 mM Tris-HCl,pH 8.8、20 mM KCl, 16 mM MgSO4,20 mM (NH4)2SO4,0.2% Tween 20,1.6 M Betaine和2.8 mM dNTP组成。
6.根据权利要求4所述的一种非洲猪瘟病毒LAMP-CRISPR检测用试剂盒,其特征在于,所述crRNA和LbCas12a的摩尔浓度比为1:1。
7.权利要求1~2任一项所述的一种非洲猪瘟病毒LAMP-CRISPR检测用组合物在非诊断治疗目的的非洲猪瘟病毒检测中的应用。
8.权利要求3~6任一项所述的一种非洲猪瘟病毒LAMP-CRISPR检测用试剂盒在非诊断治疗目的的非洲猪瘟病毒检测中的应用。
9.一种非诊断治疗目的非洲猪瘟病毒LAMP-CRISPR检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)使用DNA提取试剂盒提取样品中的核酸或对样品进行裂解释放核酸;
(2)将LAMP反应混合液共18.5 μl和提取的核酸2 μl 共20.5 μl加入到PCR管底部;
(3)将CRISPR反应混合液共4.5 μl加入到PCR管盖部;
(4)将PCR管置于63℃的反应器中进行30min LMAP扩增;
(5)瞬时离心后将CRISPR反应混合液离心到管底部,并与LAMP扩增产物充分混合;
(6)将PCR管置于37℃进行CRISPR荧光检测;
(7)将PCR管置于激发波长为485nm的透射光源下观察颜色变化确定检测结果。
10.根据权利要求9所述的一种非诊断治疗目的非洲猪瘟病毒LAMP-CRISPR检测方法,其特征在于,所述LAMP反应混合液由以下成分组成:LAMP反应缓冲液、内引物、外引物、BstDNA聚合酶、p72质粒模板、荧光试剂和DEPC水,所述的p72质粒模板中p72的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示。
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