[发明专利]一种用于检测JAK2基因的引物组合物和探针、试剂盒以及方法有效

专利信息
申请号: 202011449097.6 申请日: 2020-12-09
公开(公告)号: CN112481382B 公开(公告)日: 2023-04-07
发明(设计)人: 彭进;黄絮;赵秀铭;李思琪 申请(专利权)人: 凯杰生物工程(深圳)有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 代理人: 彭家恩;彭愿洁
地址: 518000 广东省深圳市坪*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 一种 用于 检测 jak2 基因 引物 组合 探针 试剂盒 以及 方法
【权利要求书】:

1.一种用于检测JAK2基因的引物组合物和探针,其特征在于,所述用于检测JAK2基因的引物组合物包括用于检测突变型基因的引物对,以及用于检测野生型基因的引物对;所述用于检测突变型基因的引物对含有Seq ID No.1所示序列的上游引物和Seq ID No.2所示序列的下游引物;所述用于检测野生型基因的引物对含有Seq ID No.1所示序列的上游引物和Seq ID No.3所示序列的下游引物;所述用于检测JAK2基因的探针为Seq ID No.4所示序列;

Seq ID No.1:5’- M-TGTGATCCTGAAACTGAATTT -3’

Seq ID No.2:5’- M-TGGTTTTAAATTATGGAGTATGTG -3’

Seq ID No.3:5’- M-TGGTTTTAAATTATGGAGTATGTT -3’

Seq ID No.4:5’- TGTGGAGACGAGAGTAAGTAAAACTACAGG -3’;

其中,各引物5’端的M为不与JAK2基因互补的核酸序列,用于增加各引物的GC含量;所述探针的5’端标记荧光报告基团,3’端标记荧光猝灭基团;

所述M为CGCG。

2.一种用于检测JAK2基因的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1所述的引物组合物和探针。

3.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括质控品,所述质控品含有野生型基因组DNA和突变型基因组DNA。

4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述质控品含有浓度为3×103copies/µL野生型基因组DNA和浓度为3×103 copies/µL突变型基因组DNA。

5.根据权利要求3所述的试剂盒,所述试剂盒包括内参引物对和内参探针,所述内参引物对含有Seq ID No.5所示序列的上游引物和Seq ID No.6所示序列的下游引物,所述内参探针为Seq ID No.7所示序列;

Seq ID No.5:5’- CACTGGGTCCAGCGAGAAG -3’

Seq ID No.6:5’- TCTTCCAGAAGCCCTTCAGC -3’

Seq ID No.7:5’- CCAGTAGCATCTGACTTTGAGCCTCAGGGT -3’;

所述内参探针的5’端标记荧光报告基团,3’端标记荧光猝灭基团,所述内参探针和所述用于检测JAK2基因的探针5’端标记的荧光报告基团不同。

6.根据权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,用于检测JAK2基因的内标探针的5’端采用HEX荧光基团修饰,3’端采用BHQ1荧光淬灭基团修饰;用于检测JAK2基因的探针的5’端采用FAM荧光基团修饰,3’端采用BHQ1荧光淬灭基团修饰。

7.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括定量标准品,所述定量标准品含有野生型质粒和突变型质粒。

8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述定量标准品含有浓度为1×101copies/µL、1×102copies/µL、1×103 copies/µL、1×10copies/µL野生型质粒和浓度为1×101 copies/µL、1×102copies/µL、1×103 copies/µL、1×10copies/µL突变型质粒。

9.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括用于实时荧光PCR反应的试剂。

10.根据权利要求2所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒的PCR扩增程序为:95℃预变性10分钟,然后进入45个循环:94℃变性15秒、60℃退火与延伸60秒,在退火与延伸时进行荧光收集。

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