[发明专利]肝癌早期的预警方法、及预警用检测试剂盒、检测方法在审
申请号: | 202011361755.6 | 申请日: | 2020-11-27 |
公开(公告)号: | CN112280867A | 公开(公告)日: | 2021-01-29 |
发明(设计)人: | 苗保刚;韩文;孙瑶;罗淑芬 | 申请(专利权)人: | 西安天隆科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6858 |
代理公司: | 成都九鼎天元知识产权代理有限公司 51214 | 代理人: | 刘小彬 |
地址: | 710018 陕西省*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 肝癌 早期 预警 方法 检测 试剂盒 | ||
1.一种肝癌早期的预警方法,其特征在于,通过PCR法检测外周血样本中RASSF1A、ELF、p16和GSTP1基因的DNA甲基化水平,计算罹患肝癌的风险值,并根据计算结果进行预警;计算公式为:
Y=1.208163-0.00653×Ct(RASSF1A)-0.00751×Ct(ELF)-0.00555×Ct(p16)-0.00457×Ct(GSTP1);
当Y≥0.3177时,判断为罹患肝癌高风险,当Y0.3177时,则判断为罹患肝癌低风险。
2.根据权利要求1所述的一种肝癌早期的预警方法,其特征在于,所述Ct(RASSF1A)表示RASSF1A经过内源参照的校准后的扩增水平,
所述Ct(ELF)表示ELF经过内源参照的校准后的扩增水平,
所述Ct(p16)表示p16经过内源参照的校准后的扩增水平,
所述Ct(GSTP1)表示GSTP1经过内源参照的校准后的扩增水平。
3.肝癌早期预警用多基因甲基化联合检测试剂盒,其特征在于,包括特异性检测外周血样本中RASSF1A、ELF、p16和GSTP1基因的DNA甲基化检测试剂。
4.根据权利要求3所的检测试剂盒,其特征在于,还包括内源性基因和内源性基因检测试剂;;优选地,所述内源性基因为β-actin或RPPH;优选地,所述检测试剂盒为荧光PCR检测试剂盒。
5.根据权利要求3或4所述的检测试剂盒,其特征在于,所述DNA甲基化检测试剂包括用于RASSF1A、ELF、p16和GSTP1基因启动子区域进行甲基化特异性PCR(MSP)扩增的DNA引物对及探针。
6.根据权利要求5所述的R检测试剂盒,其特征在于,RASSF1A的扩增引物对的核苷酸序列为:
正向引物GGGTTTTGCGAGAGCGCG;
反向引物GCTAACAAACGCGAACCG;
针对RASSF1A的探针核苷酸序列为GCTCTTCCCAGCGCGCTCA;优选地,针对RASSF1A的探针连接有荧光基团;更优选地针对RASSF1A的探针标记FAM荧光素。
7.根据权利要求5所述的检测试剂盒,其特征在于,ELF的扩增引物对的核苷酸序列为:
正向引物GGCGAGTGGTTTTTGATAAAATTATAAAT;
反向引物ACATACCACGATTACCGAACCCGAA;
针对ELF的探针核苷酸序列为CGGCACTCGTACGTCAACCGCG;优选地,针对ELF的探针连接有荧光基团;更优选地针对ELF的探针标记HEX荧光素。
8.根据权利要求5所述的PCR检测试剂盒,其特征在于,p16的扩增引物对的核苷酸序列为:
正向引物TTATTAGAGGGTGGGGCGGATCGC;
反向引物GACCCCGAACCGCGACCGTAA:
针对p16的探针核苷酸序列为ACCGCGTAGCTCAGTCCTTA;优选地,针对p16的探针连接有荧光基团;更优选地针对p16F的探针标记CY5荧光素。
9.根据权利要求5所述的PCR检测试剂盒,其特征在于,GSTP1的扩增引物对的核苷酸序列为:
正向引物TTCGGGGTGTAGCGGTCGTC;
反向引物GCCCCAATACTAAATCACGACG:
针对GSTP1的探针的核苷酸序列为ACCGGGTCGCATGGGCCAATCG;优选地,针对GSTP1的探针连接有荧光基团;更优选地针对GSTP1的探针标记ROX荧光素。
10.一种非诊疗目的检测人RASSF1A、ELF、p16和GSTP1基因的DNA甲基化的方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1.将待测样品进行重亚硫酸氢盐处理,得到重亚硫酸盐修饰的待测样品;
S2.采用权利要求2-9任意一项所述的PCR检测试剂盒对S1得到的待测样品进行检测,获得人RASSF1A、ELF、p16和GSTP1基因的DNA甲基化水平。
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