[发明专利]一种检测探针、其制备方法及应用有效
申请号: | 202010867470.3 | 申请日: | 2020-08-25 |
公开(公告)号: | CN111996235B | 公开(公告)日: | 2023-06-02 |
发明(设计)人: | 程欢欢;陈莹;谢红娴;兰凯;黄龙 | 申请(专利权)人: | 广州鼓润医疗科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6811 | 分类号: | C12Q1/6811;C12Q1/6874;C12N15/11 |
代理公司: | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人: | 颜希文 |
地址: | 510000 广东省广州市黄埔区*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 探针 制备 方法 应用 | ||
1.一种检测探针的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)、克隆目标基因片段,片段化minicircle质粒,得到minicircle质粒片段,所述minicircle质粒的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示;
所述片段化的步骤包括:使用如核苷酸系列为SEQ ID NO.5~6的引物序列对minicircle质粒进行PCR扩增,扩增得到的片段为minicircle质粒片段;
(2)、将步骤(1)中的目标基因片段与minicircle质粒片段连接,并将连接产物转化至菌中,挑取相应的含有所述质粒片段的转化菌,扩大培养并提取质粒;
(3)、使用带有纯化标签的原料,以步骤(2)得到质粒为模板进行滚环扩增;
(4)、纯化回收步骤(3)的扩增产物,进行超声。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(3)中所述带有纯化标签的原料为带有生物素标签的dNTP或生物素标签的NTP。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,若制备DNA探针,步骤(3)中所述滚环扩增使用Phi29DNA聚合酶;若制备RNA探针,步骤(3)中所述滚环扩增使用T7 RNA聚合酶。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(3)中所述滚环扩增的引物的序列为如SEQ ID NO.2所示的核苷酸序列。
5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,步骤(4)中所述超声为将扩增产物打断至100-300bp。
6.如权利要求5所述的方法,其特征在于,所述超声的参数设置为:超声30秒,停30s,共45个循环。
7.如权利要求1~6任一项所述方法制备的检测探针。
8.如权利要求7所述检测探针在制备液相捕获试剂盒中的用途。
9.一种非诊断和治疗目的的液相捕获试剂盒的使用方法,其特征在于,方法如下:
(a)、基因组DNA超声打断,加入接头,构建相应的DNA文库;
(b)、扩增步骤(a)所述的DNA文库;
(c)、使用如权利要求7所述检测探针与步骤(b)中的文库进行杂交;
(d)、通过对应纯化标签的纯化方法进行杂交产物纯化;
(e)、扩增步骤(d)中的纯化产物并上机测序。
10.如权利要求9所述的非诊断和治疗目的的液相捕获试剂盒的使用方法,其特征在于,所述探针含有生物素标签,所述纯化方法为通过链霉亲和素进行纯化。
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