[发明专利]一种马氏珠母贝生长性状相关的MIP基因SNP分子标记及其应用有效
| 申请号: | 202010654428.3 | 申请日: | 2020-07-09 |
| 公开(公告)号: | CN111705142B | 公开(公告)日: | 2023-04-11 |
| 发明(设计)人: | 邓岳文;郝瑞娟;杨创业;杜晓东;郑哲;王庆恒 | 申请(专利权)人: | 广东海洋大学 |
| 主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司: | 广州市南锋专利事务所有限公司 44228 | 代理人: | 李慧 |
| 地址: | 524000 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 种马 珠母 生长 性状 相关 mip 基因 snp 分子 标记 及其 应用 | ||
1. 一种马氏珠母贝生长性状相关的MIP基因SNP分子标记的应用,其特征在于:所述的SNP分子标记位于马氏珠母贝胰岛素相关基因的g.38363939 AG和g.38364205 CT位点;
SNP分子标记位点的基因型对马氏珠母贝壳型性状进行早期选育;
其包括如下步骤:
(1)提取待测马氏珠母贝的基因组DNA;
(2)设计特异性扩增含有马氏珠母贝MIP基因所在3号染色体上38363939-38364205位点的基因片段的引物对;
(3)以步骤(2)设计的引物对马氏珠母贝基因组DNA进行PCR扩增,检测扩增所得基因片段的SNP位点的基因型;其中,SNP位点g.38363939为AG、GG基因型的个体的性状均值,壳长、壳宽、壳高、总重与壳重显著大于AA基因型;SNP位点g.38364205为TT、CT基因型的个体的性状均值,壳长、壳宽、壳高、总重及壳重显著大于CC基因型;
(4)基于SNP位点的基因型对马氏珠母贝壳型性状进行早期选育;
所述PCR扩增的引物对的序列如SEQ IDNo.1-2。
2.根据权利要求1所述一种马氏珠母贝生长性状相关的MIP基因SNP分子标记的应用,其特征在于:步骤(1)所述的提取待测马氏珠母贝的基因组DNA的步骤如下:使用试剂盒提取基因组DNA,具体步骤包括:
(1)取0.05g闭壳肌,放入装有200μL缓冲液的高压灭菌过的1.5mL离心管;
(2)剪碎肌肉组织,加入4μL100 mg/mL核糖核酸酶A溶液,振荡15sec,室温放置5min;
(3)加入20μL 20mg/mL蛋白酶K溶液,涡旋混匀,简短离心,56℃放置3h,每小时振荡混合样品2-3次,每次振荡混匀15sec;
(4)加入200μL缓冲液,充分颠倒混匀,70℃放置10min,离心;
(5)加人200μL无水乙醇,充分颠倒混匀,简短离心;
(6)将步骤(5)所得溶液和絮状沉淀都加入一个吸附柱中,12,000rpm离心30sec,倒掉废液,将吸附柱放回收集管中;
(7)向吸附柱中加入500μL缓冲液,12,000rpm离心30sec,倒掉废液,将吸附柱放入收集管中;
(8)向吸附柱中加入600μL漂洗液,12,000rpm离心30sec,倒掉废液,将吸附柱放入收集管中;
(9)重复操作步骤(7);
(10)将吸附柱放回收集管中,12,000rpm离心2min,倒掉废液,将吸附柱CB3置于室温放置10分钟;
(11)将吸附柱转入一个干净的离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加100μL洗脱缓冲液,室温放置5min,12,000rpm离心2min,将溶液收集到离心管中。
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