[发明专利]HLA-DPA1基因分型试剂盒在审
| 申请号: | 202010608677.9 | 申请日: | 2020-06-29 |
| 公开(公告)号: | CN111662967A | 公开(公告)日: | 2020-09-15 |
| 发明(设计)人: | 王燕;张倩;刘克瑶;王林林;王连水;杜昭励;杨海燕 | 申请(专利权)人: | 银丰基因科技有限公司;银丰生物工程集团有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12N15/11 |
| 代理公司: | 山东舜天律师事务所 37226 | 代理人: | 李新海 |
| 地址: | 250101 山东省济南市高*** | 国省代码: | 山东;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | hla dpa1 基因 试剂盒 | ||
1.一种HLA-DPA1基因分型试剂盒,其特征在于:包括2条扩增引物和4条测序引物,具体如下:
扩增引物:
AMP-DPA1-F3:5’-CTCGGGAGAAGGAACATAAT-3’;如SEQ ID NO.3所示;
AMP-DPA1-R1:5’-TAGAAGATCAATGAACACTTATCAG-3’;如SEQ ID NO.4所示;
测序引物:
CX-DPA1-2F:5’-AAGTCTTTATTCATTCTCTA-3’;如SEQ ID NO.8所示;
CX-DPA1-2R:5’-GGCGACGMCGCTCACCTC-3’;如SEQ ID NO.9所示;
CX-DPA1-3F:5’-GGAGCCCACAGTGACCATCTC-3’;如SEQ ID NO.10所示;
CX-DPA1-3R:5’-CCCATAGTAACAGAAACTCAA-3’;如SEQ ID NO.11所示。
2.权利要求1所述的HLA-DPA1基因分型试剂盒在检测基因分型中的应用。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于:具体应用时,检测方法如下:
(1)提取样本DNA;
(2)利用扩增引物进行PCR扩增,完成目的基因扩增;
(3)对扩增产物进行双酶切纯化;
(4)利用测序引物,对纯化后的产物进行测序PCR反应;
(5)将上述得到的测序产物进行醋酸钠-乙醇沉淀法纯化,进行毛细管电泳测序;
(6)将上述获得的序列通过分型软件分析,确定HLA-DPA1等位基因型别。
4.根据权利要求3所述的应用,其特征在于:所述扩增的反应体系为:模板DNA(30ng/μl),2μl;正向引物(10pM),1μl;反向引物(10pM),1μl;dNTP,1.6μl;10x LA Taq buffer(Mg2+),2μl;增强剂,2μl;10x LA Taq,0.2μl;补ddH2O至总体积20μl。
5.根据权利要求3所述的应用,其特征在于:所述扩增的程序为:94℃变性2min;98℃变性10s,60℃退火30s,72℃延伸5min30 s,共进行30次循环;72℃延伸9min;4℃,∞。
6.根据权利要求3所述的应用,其特征在于:所述测序反应程序为:96℃变性10s;96℃变性10s,50℃退火10s,60℃延伸4min,共进行25次循环,12℃,∞。
7.一种利用权利要求1所述的HLA-DPA1基因分型试剂盒进行HLA-DPA1基因分型的检测方法,其特征在于:包括以下步骤:
(1)提取样本DNA;
(2)利用扩增引物进行PCR扩增,完成目的基因扩增;
(3)对扩增产物进行双酶切纯化;
(4)利用测序引物,对纯化后的产物进行测序PCR反应;
(5)将上述得到的测序产物进行醋酸钠-乙醇沉淀法纯化,进行毛细管电泳测序;
(6)将上述获得的序列通过分型软件分析,确定HLA-DPA1等位基因型别。
8.根据权利要求7所述的检测方法,其特征在于:所述扩增的反应体系为:模板DNA(30ng/μl),2μl;正向引物(10pM),1μl;反向引物(10pM),1μl;dNTP,1.6μl;10x LA Taqbuffer(Mg2+),2μl;增强剂,2μl;10x LA Taq,0.2μl;补ddH2O至总体积20μl。
9.根据权利要求7所述的检测方法,其特征在于:所述扩增的程序为:94℃变性2min;98℃变性10s,60℃退火30s,72℃延伸5min30 s,共进行30次循环;72℃延伸9min;4℃,∞。
10.根据权利要求7所述的检测方法,其特征在于:所述测序反应程序为:96℃变性10s;96℃变性10s,50℃退火10s,60℃延伸4min,共进行25次循环,12℃,∞。
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