[发明专利]用于α-地中海贫血多重实时荧光PCR检测的引物、探针和反应缓冲液组合及试剂盒有效
申请号: | 202010552793.3 | 申请日: | 2020-06-17 |
公开(公告)号: | CN111471763B | 公开(公告)日: | 2023-06-02 |
发明(设计)人: | 魏劭;林培蕊;雷彩霞;魏超 | 申请(专利权)人: | 厦门安普利生物工程有限公司;南京安浦精准医学检验有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6858;C12Q1/6834;C12N15/11 |
代理公司: | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人: | 董大媛 |
地址: | 361028 福*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 地中海贫血 多重 实时 荧光 pcr 检测 引物 探针 反应 缓冲液 组合 试剂盒 | ||
1.用于α-地中海贫血多重实时荧光PCR检测的试剂盒,由用于α-地中海贫血多重实时荧光PCR检测的引物、探针和反应缓冲液组合而成,所述组合包括8组引物和探针组合以及4种反应缓冲液;所述4种反应缓冲液包括B-4反应缓冲液、B-2反应缓冲液、J-1反应缓冲液和H-1反应缓冲液;所述8组引物和探针组合包括第1组引物和探针组合~第8组引物和探针组合;所述第1组引物和探针组合~第8组引物和探针组合分别单独包装;所述B-4反应缓冲液、B-2反应缓冲液、J-1反应缓冲液和H-1反应缓冲液分别单独包装;
所述第1组引物和探针组合包括:SEA上游引物、SEA下游引物、SEA探针、内标01上游引物、内标01下游引物和内标01探针;所述SEA上游引物、SEA下游引物和SEA探针的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.3所示;所述内标01上游引物、内标01下游引物和内标01探针的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.28~SEQ ID NO.30所示;
第2组引物和探针组合包括:THAI上游引物、THAI下游引物、THAI探针、内标01上游引物、内标01下游引物和内标01探针;所述THAI上游引物、THAI下游引物和THAI探针的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.4~SEQ ID NO.6所示;所述内标01上游引物、内标01下游引物和内标01探针的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.28~SEQ ID NO.30所示;
第3组引物和探针组合包括:4.2A上游引物、4.2A下游引物、4.2A探针、内标03上游引物、内标03下游引物和内标03探针;所述4.2A上游引物、4.2A下游引物和4.2A探针的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.7~SEQ ID NO.9所示;所述内标03上游引物、内标03下游引物和内标03探针的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.34~SEQ ID NO.36所示;
第4组引物和探针组合包括:4.2B上游引物、4.2B下游引物、4.2B探针、内标02上游引物、内标02下游引物和内标02探针;所述4.2B上游引物、4.2B下游引物和4.2B探针的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.10~SEQ ID NO.12所示;所述内标02上游引物、内标02下游引物和内标02探针的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.31~SEQ ID NO.33所示;
第5组引物和探针组合包括:3.7上游引物、3.7下游引物、3.7探针、内标02上游引物、内标02下游引物和内标02探针;所述3.7上游引物、3.7下游引物和3.7探针的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.13~SEQ ID NO.15所示;所述内标02上游引物、内标02下游引物和内标02探针的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.31~SEQ ID NO.33所示;
第6组引物和探针组合包括:WS上游引物、WS下游引物、第一WS探针、第二WS探针、内标01上游引物、内标01下游引物和内标01探针;所述WS上游引物、WS下游引物、第一WS探针和第二WS探针的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.16~SEQ ID NO.19所示;所述内标01上游引物、内标01下游引物和内标01探针的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.28~SEQ ID NO.30所示;
第7组引物和探针组合包括:QS上游引物、QS下游引物、第一QS探针、第二QS探针、内标01上游引物、内标01下游引物和内标01探针;所述QS上游引物、QS下游引物、第一QS探针和第二QS探针的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.20~SEQ ID NO.23所示;所述内标01上游引物、内标01下游引物和内标01探针的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.28~SEQ ID NO.30所示;
第8组引物和探针组合包括:CS上游引物、CS下游引物、第一CS探针、第二CS探针、内标01上游引物、内标01下游引物和内标01探针;所述CS上游引物、CS下游引物、第一CS探针和第二CS探针的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.24~SEQ ID NO.27所示;所述内标01上游引物、内标01下游引物和内标01探针的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.28~SEQ ID NO.30所示;
所述SEA探针、THAI探针、4.2A探针、4.2B探针、3.7探针、第二WS探针、第二QS探针和第二CS探针的5’端分别标记有荧光报告基团FAM,3’端分别标记有淬灭基因BHQ1;
所述第一WS探针、第一QS探针和第一CS探针的5’端分别标记有荧光报告基团ROX,3’端分别标记有淬灭基因BHQ2;
所述内标01探针、内标02探针和内标03探针的5’端分别标记有荧光报告基团HEX,3’端分别标记有淬灭基因BHQ1;
所述B-4反应缓冲液包括以下浓度的组分:三羟甲基氨基甲烷盐酸盐3.8mM、三羟甲基氨基甲烷32.2mM、氯化钾150mM、氯化镁6.25mM、曲拉通0.25%、硫酸铵12.5mM、脱氧核糖核苷三磷酸0.75mM和脱氧尿苷三磷酸1.5mM;
所述B-2反应缓冲液包括以下浓度的组分:三羟甲基氨基甲烷盐酸盐3.8mM、三羟甲基氨基甲烷32.2mM、氯化钾150mM、氯化镁6.25mM、曲拉通0.25%、硫酸铵12.5mM、四甲基氯化铵20mM、脱氧核糖核苷三磷酸0.75mM和脱氧尿苷三磷酸1.5mM;
所述J-1反应缓冲液包括以下浓度的组分:三羟甲基氨基甲烷盐酸盐3.8mM、三羟甲基氨基甲烷32.2mM、氯化钾125mM、氯化镁6.25mM、硫酸铵25mM、体积百分含量为12.50%的二甲基亚砜、甜菜碱2.5M、7-deaza-dGTP0.075mM、脱氧核糖核苷三磷酸1mM和脱氧尿苷三磷酸2mM;
所述H-1反应缓冲液包括以下浓度的组分:4-羟乙基哌嗪乙磺酸50mM、硫酸铵25mM、氯化钾125mM、氯化镁7.5mM、体积百分含量为2.50%的甲酰胺、脱氧核糖核苷三磷酸0.4mM和脱氧尿苷三磷酸0.8mM;
所述第1引物和探针组合~第3引物和探针组合分别和B-4反应缓冲液联用;
所述第4引物和探针组合和B-2反应缓冲液联用;
所述第5引物和探针组合和J-1反应缓冲液联用;
所述第6引物和探针组合~第8引物和探针组合分别和H-1反应缓冲液联用;
所述试剂盒还包括酶混合液、稀释缓冲液、TE缓冲液和石蜡油;
所述试剂盒的每组引物和探针组合中,每种引物或者每种探针的使用母液浓度分别为50μM。
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