[发明专利]ES标志物及其应用

说明书

本发明提供一种ES标志物及其应用。该ES标志物包括以下至少一种：ESRRA、MYBL1、PBX1、TEAD1、TEAD2、TEAD4、FOS::JUNB、FOSL2::JUN、HOXC12、SREBF1、Twist2、ZNF410、TBX20、SREBF2。发明人借助scATAC‑seq技术发现ES患者与健康对照组人群的样本中，多个转录因子的表达水平存在显著差异，因此，可以将这些差异表达的转录因子作为标志物用于ES的诊断、预后评估或筛药。

技术领域

本发明涉及三体综合征技术领域，尤其是涉及一种ES标志物及其应用。

背景技术

18-三体综合征又称爱德华兹综合征(Edwards Syndrome，ES)，是常见的染色体异常疾病之一。具体而言，ES是由于存在额外的18号染色体而导致的一系列不同器官和系统异常的疾病，根据患者核型的不同可分为游离型(症状典型，占90％以上)、嵌合型和易位型。ES是染色体异常疾病，尚无根治方法，只能通过产前筛查进行预防。筛查因素包括孕妇年龄、超声指标、游离胎儿核酸等。然而，上述这些技术的高风险结果最终都需要通过核型分析来确诊，具有一定的感染风险。Fitz Patrick等基于cDNA阵列分析技术对三体综合征的研究结果显示，三体染色体的基因的平均转录水平相比正常细胞仅提高了1.1倍，而且能够检测到染色体间存在表达水平差异，这暗示着一个染色体的增加可能会影响其他染色体基因的转录水平。该研究的数据支持着这样一个模型：三体染色体上基因的略微上调导致了继发性的、广泛的、更极端的转录失调，这种转录失调的程度可能决定了表型的严重程度。这些结果暗示可以从表观遗传学角度进一步对ES进行研究。

ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with highthroughput sequencing)是以高通量测序为基础的从表观遗传角度研究染色质开放性(或称染色质可进入性)的新兴科研技术，原理是利用转座酶Tn5容易与开放染色质进行特异结合的特性，对Tn5酶所捕获到的DNA序列片段进行测序，将测序结果与人类基因组信息比对，分析DNA的开放区域，通过进一步的motif分析，在全基因组范围预测转录因子结合位点(Transciption Factor Binding Site，TFBS)。与传统的DNase-Seq及FAIRE-seq等研究开放染色质的方法相比，ATAC-seq以细胞量要求少、低成本、短周期、大数据、无需抗体富集、可以在全基因组范围内检测染色质的开放状态等优势。目前单细胞ATAC-Seq在染色体开放性图谱分析、表观修饰差异研究、胚胎发育表观遗传修饰、肿瘤发生表观机制研究、肿瘤异质性与分型研究、疾病潜在标志物预测等领域已有较为广泛的应用。因此，有必要借助ATAC-seq技术发现ES的特异性生物标志物。

发明内容

本发明旨在至少解决现有技术中存在的技术问题之一。为此，本发明提出一种ES标志物及其应用。

第一方面，本发明的一个实施例提供了一种ES标志物，包括以下至少一种：ESRRA、MYBL1、PBX1、TEAD1、TEAD2、TEAD4、FOS::JUNB、FOSL2::JUN、HOXC12、SREBF1、Twist2、ZNF410、TBX20、SREBF2。

本发明实施例的肠道菌群标志物至少具有如下有益效果：

发明人借助scATAC-seq技术发现ES患者与健康对照组人群的样本中，多个转录因子的表达水平存在显著差异，因此，可以将这些差异表达的转录因子作为标志物用于ES的诊断、预后评估或筛药。

第二方面，本发明的一个实施例提供了上述ES标志物在制备ES诊断和/或预后试剂中的应用。上述ES标志物在ES患者与健康对照组人群中存在差异表达，因此，可以通过定量检测受试者样本中的上述ES标志物来实现对ES的诊断或对其预后的评估。