[发明专利]检测SLC25A13基因突变的方法、引物及探针组合物、试剂盒在审
申请号: | 202010052765.5 | 申请日: | 2020-01-17 |
公开(公告)号: | CN111073959A | 公开(公告)日: | 2020-04-28 |
发明(设计)人: | 郑建权;刘晶晶;刘福平 | 申请(专利权)人: | 深圳会众生物技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 深圳市博锐专利事务所 44275 | 代理人: | 汤星星 |
地址: | 518000 广东省深圳市宝安区航*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 slc25a13 基因突变 方法 引物 探针 组合 试剂盒 | ||
1.一种检测SLC25A13基因高频突变位点的引物及探针组合物,其特征在于,包括以下至少一对引物及探针组合物:用于检测c.851_854del4突变位点的第一引物和第一探针;用于检测c.1638_1660dup突变位点的第二引物和第二探针;用于检测IVS6+5G﹥A突变位点的第三引物和第三探针;以及用于检测IVS16ins3kb突变位点的第四引物和第四探针;
其中,第一引物的核苷酸序列如SEQ ID No.1-2所示,第一探针的核苷酸序列如SEQ IDNo.3所示;第二引物的核苷酸序列如SEQ ID No.4-5所示,第二探针的核苷酸序列如SEQ IDNo.6所示;第三引物的核苷酸序列如SEQ ID No.7-8所示,第三探针的核苷酸序列如SEQ IDNo.9所示;第四引物的核苷酸序列如SEQ ID No.10-12所示,第四探针的核苷酸序列如SEQID No.13所示。
2.根据权利要求1所述的检测SLC25A13基因高频突变位点的引物及探针组合物,其特征在于,所述第一探针、第二探针、第三探针和第四探针的3’和5’端分别进行荧光标记。
3.根据权利要求1所述的检测SLC25A13基因高频突变位点的引物及探针组合物,其特征在于,包括:用于检测c.851_854del4突变位点的第一引物和第一探针;用于检测c.1638_1660dup突变位点的第二引物和第二探针;用于检测IVS6+5G﹥A突变位点的第三引物和第三探针;以及用于检测IVS16ins3kb突变位点的第四引物和第四探针。
4.一种检测SLC25A13基因高频突变位点的试剂盒,其特征在于,包括权利要求1-3中任意一项所述的检测SLC25A13基因高频突变位点的引物及探针组合物。
5.根据权利要求4所述的检测SLC25A13基因高频突变位点的试剂盒,其特征在于,包括权利要求3所述的检测SLC25A13基因高频突变位点的引物及探针组合物、PCR缓冲液、dNTPs和DNA聚合酶;
所述PCR缓冲液包括10mmol/L的Tris-HCl、50nmol/L的KCl和5mmol/L的Mg2+;所述dNTPs的浓度为2-5mmol/L;所述DNA聚合酶为1-2U。
6.一种检测SLC25A13基因高频突变位点的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)提取样品DNA;
(2)采用PCR溶解曲线法,利用权利要求4或5所述的检测SLC25A13基因高频突变位点的试剂盒对样品DNA进行PCR扩增;
(3)通过监测整个溶解过程当中的信号值随温度的变化规律,区分靶序列的基因型。
7.根据权利要求6所述的检测SLC25A13基因高频突变位点的方法,其特征在于,步骤(2)中,利用权利要求5所述的检测SLC25A13基因高频突变位点的试剂盒对样品DNA进行PCR扩增;采用PCR溶解曲线法进行PCR扩增的反应条件为:
第一阶段:90-98℃,5-10min,1个循环;
第二阶段:90-98℃,10-15s;60-65℃,30-60s;68-72℃,30-60s;40个循环;
第三阶段:90-98℃,1-10s;40-50℃,1-10s;1个循环;
第四阶段:由40-50℃至80-90℃,升温速率为0.1/s,并收集荧光信号;1个循环。
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