[发明专利]DNA纳米技术与液相色谱联用的转录因子多通路检测方法有效
申请号: | 202010015149.2 | 申请日: | 2020-01-07 |
公开(公告)号: | CN111206074B | 公开(公告)日: | 2022-10-04 |
发明(设计)人: | 周学敏;李昺之;陈月;严孝强;朱婉莹;王晶;卢巧云;洪俊丽 | 申请(专利权)人: | 南京医科大学 |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844 |
代理公司: | 北京思创大成知识产权代理有限公司 11614 | 代理人: | 尹慧晶 |
地址: | 210029 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | dna 纳米技术 色谱 联用 转录 因子 通路 检测 方法 | ||
本发明公开了一种DNA纳米技术与液相色谱技术联用的转录因子多通路检测方法,该方法为:先用捕获有待测转录因子的探针修饰的磁珠捕获待测转录因子,将捕获的待测转录因子与对应掩蔽链序列结合,将待测转录因子的信号转化为核酸信号的释放;然后核酸信号在对应扩增模板、Bst 2.0 DNA聚合酶、Nt.BstNBI核酸内切酶的作用下触发多通路等温扩增,产生具有多种编码的寡核苷酸作为信号DNA;最后采用高效液相色谱检测信号DNA,得到待测转录因子的浓度。本发明检测方法过程简单,能够一次性同时检测多种待测转录因子,实现了多目标检测,在多通路检测中获得良好的检测结果,本发明检测方法方便、可靠地对不同保留行为的DNA报告进行定量定性分析,提高了检测效率。
技术领域
本发明涉及分析技术检测领域,更具体地,涉及一种DNA纳米技术与液相色谱技术联用的转录因子多通路检测方法。
背景技术
转录因子(Transcription factors,TFs)是细胞中的一种调控蛋白,通过与基因中的DNA顺式作用元件结合,来启动和调节基因的转录过程。与此同时,也有大量研究指出,转录因子的非正常表达与活化,广泛的存在于人体的病理过程,这些病理过程包括癌症的产生与转移、病毒感染、自身免疫疾病等。因此转录因子既可以作为一种潜在的诊断标志物,又可以成为临床治疗的靶点。然而,对TFs传统的检测技术通常为免疫印迹法、DNA足迹法、核染色质免疫共沉淀等方法,这些方法存在检测过程较为繁琐、效率低下,应用面窄,无法实现多目标检测的技术问题,导致TFs作为诊断指标在临床上的应用尚不成熟。综上所述,实现快速、灵敏、低成本、多重检测转录因子是现在的研究热点之一。
发明内容
本发明的目的是针对上述不足,提出一种DNA纳米技术与液相色谱技术联用的转录因子多通路检测方法。本发明检测方法过程简单,能够一次性同时检测多种待测转录因子,实现了多目标检测,在多通路检测中获得良好的检测结果,本发明检测方法方便、可靠地对不同保留行为的DNA报告进行定量定性分析,有效的提高了检测效率。
本发明的技术方案是:
本发明提供一种DNA纳米技术与液相色谱技术联用的转录因子多通路检测方法,该方法为:先用捕获有待测转录因子的探针修饰的磁珠捕获待测转录因子,将捕获的待测转录因子与对应掩蔽链序列结合,将待测转录因子的信号转化为核酸信号的释放;然后核酸信号在对应扩增模板、Bst 2.0DNA聚合酶、Nt.BstNBI核酸内切酶的作用下触发多通路等温扩增,产生具有多种编码的寡核苷酸作为信号DNA;最后采用高效液相色谱检测信号DNA,得到待测转录因子的浓度。
所述待测转录因子为p50、p53、AP-1、MITF、c-Myc中的任意一种或多种。
该方法包括以下步骤:
(1)掩蔽链信号转导:将捕获有待测转录因子的探针用柠檬酸缓冲液溶解至5μM,并加热至95℃,冷却至室温后,与磁珠进行孵育,得到捕获有待测转录因子的探针修饰的磁珠;用捕获有待测转录因子的探针修饰的磁珠捕获待测转录因子,并添加45nM待测转录因子对应的掩蔽链,孵育混匀,磁分离悬浮液,收集上清液;所述柠檬酸缓冲液的PH为7.4,待测转录因子对应的掩蔽链的添加量为100uL;
(2)等温扩增:将上述上清液与待测转录因子对应的扩增模板、Nt.BstNBI核酸内切酶、Bst 2.0DNA聚合酶、dNTPs混合物和1×恒温扩增缓冲液混合,在60℃下反应80-100分钟,然后再加热至85℃反应5-15分钟,终止后离心,保留上清液,得到具有多种编码寡核苷酸的信号DNA;其中,Nt.BstNBI核酸内切酶、Bst 2.0DNA聚合酶、dNTPs混合物和1×恒温扩增缓冲液体积均为10uL;
(3)HPLC分析:将上述得到的信号DNA进行高效液相色谱检测;高效液相色谱检测的条件为:流动相A为醋酸己铵溶液,固定相B为乙腈;梯度洗脱条件为:梯度从31%B开始,B以体积百分比匀速增加,在14分钟时到达33%B,15-20分钟为38%B,21-24分钟为41%B。
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