[发明专利]DNA纳米技术与液相色谱联用的转录因子多通路检测方法有效
申请号: | 202010015149.2 | 申请日: | 2020-01-07 |
公开(公告)号: | CN111206074B | 公开(公告)日: | 2022-10-04 |
发明(设计)人: | 周学敏;李昺之;陈月;严孝强;朱婉莹;王晶;卢巧云;洪俊丽 | 申请(专利权)人: | 南京医科大学 |
主分类号: | C12Q1/6844 | 分类号: | C12Q1/6844 |
代理公司: | 北京思创大成知识产权代理有限公司 11614 | 代理人: | 尹慧晶 |
地址: | 210029 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | dna 纳米技术 色谱 联用 转录 因子 通路 检测 方法 | ||
1.一种DNA纳米技术与液相色谱技术联用的转录因子多通路检测方法,
其特征在于,该方法为:先用捕获有待测转录因子的探针修饰的磁珠捕获待测转录因子,将捕获的待测转录因子与对应掩蔽链序列结合,将待测转录因子的信号转化为核酸信号的释放;然后核酸信号在对应扩增模板、Bst 2.0 DNA聚合酶、Nt.BstNBI核酸内切酶的作用下触发多通路等温扩增,产生具有多种编码的寡核苷酸作为信号DNA;最后采用高效液相色谱检测信号DNA,得到待测转录因子的浓度;所述待测转录因子为p50、p53、AP-1、MITF、c-Myc中的任意一种或多种;所述探针、掩蔽链,扩增模板的序列如下所示:
。
2.根据权利要求1所述的DNA纳米技术与液相色谱技术联用的转录因子多通路检测方法,其特征在于,该方法包括以下步骤:
(1)掩蔽链信号转导:将捕获有待测转录因子的探针用柠檬酸缓冲液溶解至5μM,并加热至95℃,冷却至室温后,与磁珠进行孵育,得到捕获有待测转录因子的探针修饰的磁珠;用捕获有待测转录因子的探针修饰的磁珠捕获待测转录因子,并添加45 nM待测转录因子对应的掩蔽链,孵育混匀,磁分离悬浮液,收集上清液;
(2)等温扩增:将上述上清液与待测转录因子对应的扩增模板、Nt.BstNBI核酸内切酶、Bst 2.0 DNA聚合酶、dNTPs混合物和1×恒温扩增缓冲液混合,在60℃下反应80-100分钟,然后再加热至85℃反应5-15分钟,终止后离心,保留上清液,得到具有多种编码寡核苷酸的信号DNA;
(3)HPLC分析:将上述得到的信号DNA进行高效液相色谱检测;高效液相色谱检测的条件为:流动相A为醋酸己铵溶液,固定相B为乙腈;梯度洗脱条件为:梯度从31%B开始,B以体积百分比匀速增加,在14分钟时到达33%B,15-20分钟为38%B,21-24分钟为41%B。
3.根据权利要求2所述的DNA纳米技术与液相色谱技术联用的转录因子多通路检测方法,其特征在于,步骤(1)中,孵育的条件为:温度为30-45℃,时间为20-40分钟;孵育混匀的条件为:温度为30-45℃,时间为20-40分钟。
4.根据权利要求2所述的DNA纳米技术与液相色谱技术联用的转录因子多通路检测方法,其特征在于,步骤(2)中,所述对应DNA信号的扩增模板为100nm。
5.根据权利要求2所述的DNA纳米技术与液相色谱技术联用的转录因子多通路检测方法,其特征在于,步骤(2)中,所述的Nt.BstNBI核酸内切酶浓度为2-8 u/μL,Bst 2.0 DNA聚合酶浓度为0.5-1.5 u/μL,dNTPs混合物浓度为50-150μM。
6.根据权利要求2所述的DNA纳米技术与液相色谱技术联用的转录因子多通路检测方法,其特征在于,步骤(2)中,离心条件为以8000-15000转/分离心1-5分钟。
7.根据权利要求2所述的DNA纳米技术与液相色谱技术联用的转录因子多通路检测方法,其特征在于,步骤(3)中,所述高效液相色谱分析的色谱柱为C18柱,采用的色谱温度为60℃;紫外检测波长为260nm。
8.根据权利要求2所述的DNA纳米技术与液相色谱技术联用的转录因子多通路检测方法,其特征在于,步骤(3)中,所述醋酸己铵的浓度为100 mM,pH值为7.0。
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