[发明专利]扩增方法在审
申请号: | 201980047190.3 | 申请日: | 2019-06-07 |
公开(公告)号: | CN112424374A | 公开(公告)日: | 2021-02-26 |
发明(设计)人: | A·A·莫利 | 申请(专利权)人: | 莫诺匡特私人有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6848 | 分类号: | C12Q1/6848;C12Q1/6858 |
代理公司: | 永新专利商标代理有限公司 72002 | 代理人: | 左路;区斌 |
地址: | 澳大利亚南*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 扩增 方法 | ||
1.一种扩增Ig或TCR核酸区的方法,所述Ig或TCR核酸区的特征在于两个或更多个V、D或J基因片段的重排,所述方法包含使感兴趣的核酸样品与针对所述重排的Ig或TCR核酸区的正向引物和反向引物接触,并使用以下扩增所述核酸样品:
(i)Tm为至少67℃的至少一种引物和/或
(ii)退火温度为至少70℃。
2.根据权利要求1所述的方法,其中使用Tm为至少67℃的至少一种引物且退火温度为至少70℃进行所述方法。
3.根据权利要求1或2中任一项所述的方法,其中所述至少一种引物是ASO引物。
4.根据权利要求3的方法,其中所述ASO引物是正向引物。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的方法,其中所述核酸区是DNA区。
6.根据权利要求1至5中任一项所述的方法,其中所述主题引物的Tm为67-80℃、68-76℃或69-74℃。
7.根据权利要求1至5中任一项所述的方法,其中所述退火温度是为70℃、71℃、72℃、73℃、74℃、75℃、76℃、77℃、78℃、79℃、80℃、81℃、82℃或83℃。
8.根据权利要求1至5中任一项所述的方法,其中所述退火温度为70℃-83℃、71℃-80℃、70℃-77℃、71℃-77℃或72℃-75℃。
9.根据权利要求1至5中任一项所述的方法,其中所述至少一种引物的Tm为67℃-80℃和/或所述退火温度为70℃-83℃。
10.根据权利要求1至5中任一项所述的方法,其中所述至少一种引物的Tm为69℃至76℃,并且所述退火温度是70℃至78℃。
11.根据权利要求1至5中任一项所述的方法,其中所述至少一种引物的Tm为69℃至76℃,并且所述退火温度是72℃至75℃。
12.根据权利要求1至5中任一项所述的方法,其中所述至少一种引物的Tm为69℃至72℃,并且所述退火温度是72℃。
13.根据权利要求1至5中任一项所述的方法,其中所述至少一种引物的Tm为72℃或更高,并且所述退火温度为75℃。
14.根据权利要求1至5中任一项所述的方法,其中在所述引物的3’端包括一个或多个A和/或T核苷酸。
15.根据权利要求14的方法,其中将所述正向或反向引物之一或两者设计成包括所述A和/或T核苷酸。
16.根据权利要求14所述的方法,其中仅将所述反向引物设计成包括所述A和/或T核苷酸。
17.根据权利要求1至16中任一项或多项所述的方法,其中所述引物中的至少一个包含针对所述重排的V、D和J基因片段的至少两个N基因片段的杂交亚区。
18.根据权利要求17所述的方法,其中所述V、D、J重排是部分重排。
19.根据权利要求18所述的方法,其中所述部分V、D、J重排是DNJ或VNJ重排,其还包含所述D、J或V基因片段内的至少一个N区。
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