[发明专利]一种微卫星不稳定状态的检测试剂盒及其检测方法在审
申请号: | 201911337689.6 | 申请日: | 2019-12-23 |
公开(公告)号: | CN110904236A | 公开(公告)日: | 2020-03-24 |
发明(设计)人: | 熊慧;陶慧清;谢立群;吴琼;肖樊;周丹丹;高峰英 | 申请(专利权)人: | 武汉百泰基因工程有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 武汉红观专利代理事务所(普通合伙) 42247 | 代理人: | 张文俊 |
地址: | 430000 湖北省武汉市东湖开发区高新大道*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 卫星 不稳定 状态 检测 试剂盒 及其 方法 | ||
1.一种用于检测微卫星不稳定状态的引物组,其特征在于,包括针对微卫星位点NR21、D5S346、NR24、BAT25、D17S250、MONO27、BAT26、D2S123和Penta D设计的上下游引物,具体如下:
NR21上游引物NR21-F1的碱基序列如序列表中SEQ ID NO.1所示,
NR21上游引物NR21-R1的碱基序列如序列表中SEQ ID NO.2所示,
D5S346上游引物D5S346-F2的碱基序列如序列表中SEQ ID NO.3所示,
D5S346下游引物D5S346-R3的碱基序列如序列表中SEQ ID NO.4所示,
NR24上游引物NR24-F2的碱基序列如序列表中SEQ ID NO.5所示,
NR24下游引物NR24-R1的碱基序列如序列表中SEQ ID NO.6所示,
BAT25上游引物BAT25-F1的碱基序列如序列表中SEQ ID NO.7所示,
BAT25下游引物BAT25-R2的碱基序列如序列表中SEQ ID NO.8所示,
D17S250上游引物D17S250-F3的碱基序列如序列表中SEQ ID NO.9所示,
D17S250下游引物D17S250-R的碱基序列如序列表中SEQ ID NO.10所示,
MONO27上游引物MONO27-F2的碱基序列如序列表中SEQ ID NO.11所示,
MONO27下游引物MONO27-R1的碱基序列如序列表中SEQ ID NO.12所示,
BAT26上游引物BAT26-F3的碱基序列如序列表中SEQ ID NO.13所示,
BAT26下游引物BAT26-R2的碱基序列如序列表中SEQ ID NO.14所示,
D2S123上游引物D2S123-F的碱基序列如序列表中SEQ ID NO.15所示,
D2S123下游引物D2S123-R2的碱基序列如序列表中SEQ ID NO.16所示,
Penta D上游引物Penta D-F2的碱基序列如序列表中SEQ ID NO.17所示,
Penta D下游引物Penta D-R4的碱基序列如序列表中SEQ ID NO.18所示;
所述上游引物NR21-F1、上游引物BAT25-F1、上游引物BAT26-F3和上游引物Penta D-F2均标记有第一荧光基团,所述上游引物D5S346-F2和上游引物D17S250-F3均标记有第二荧光基团,所述上游引物NR24-F2、上游引物MONO27-F2和上游引物D2S123-F均标记有第三荧光基团,所述第一荧光基团、第二荧光基团和第三荧光基团的荧光检测波长互不相同。
2.如权利要求1所述的用于检测微卫星不稳定状态的引物组,其特征在于:还包括针对微卫星位点TPOX设计的上游引物TPOX-F1和下游引物TPOX-R1,所述上游引物TPOX-F1的碱基序列如序列表中SEQ ID NO.19所示,所述下游引物TPOX-R1的碱基序列如序列表中SEQID NO.20所示,所述上游引物TPOX-F1标记有第二荧光基团。
3.如权利要求2所述的用于检测微卫星不稳定状态的引物组,其特征在于:所述上游引物NR21-F1的5’端、上游引物BAT25-F1的5’端、上游引物BAT26-F3的5’端和上游引物PentaD-F2的5’端均标记有第一荧光基团,所述上游引物D5S346-F2的5’端、上游引物D17S250-F3的5’端和上游引物TPOX-F1的5’端均标记有第二荧光基团,所述上游引物NR24-F2的5’端、上游引物MONO27-F2的5’端和上游引物D2S123-F的5’端均标记有第三荧光基团。
4.如权利要求2所述的用于检测微卫星不稳定状态的引物组,其特征在于:所述第一荧光基团为荧光基团FAM、VIC、NED、ROX和CY5中的任意一种,所述第二荧光基团为荧光基团FAM、VIC、NED、ROX和CY5中的任意一种,所述第三荧光基团为荧光基团FAM、VIC、NED、ROX和CY5中的任意一种。
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