[发明专利]鉴定辣椒青果紫色基因的分子标记及其开发方法与应用

说明书

本发明公开了一种鉴定辣椒青果紫色基因的分子标记及其开发方法与应用，鉴定辣椒青果紫色基因的分子标记IndelP146，以辣椒为物种，分子标记IndelP146的正向引物为：AGAATCCATTACTTTTGCATCCACC，分子标记IndelP146的反向引物为：GTTGACCTTTTTATAGTTTGTTGTGGG。该分子标记IndelP146适用性较强，在育种实际应用中可以利用该分子标记对辣椒青果紫色性状进行快速鉴定筛选。

技术领域

本发明涉及农业生物技术领域，具体来说，涉及一种鉴定辣椒青果紫色基因的分子标记及其开发方法与应用。

背景技术

辣椒（Capsicum annuum L.），是世界上重要的农艺作物，因其独特的口味和营养现已成为世界上广泛栽培的蔬菜之一。辣椒果实中的叶绿素和类胡萝卜素使其呈现绿色、黄色、橙色及红色等颜色果实。在栽培辣椒种质资源中，存在几个紫果基因型，可能是一个花青素的重要来源。然而，紫色的色素沉着只出现在未成熟的果实中。紫色辣椒因富含花青素而呈现紫色，是我国比较稀有的种质资源，紫色辣椒体内含有丰富的花青素。

花青素（anthocyanins）是一类重要的水溶次生代谢物，广泛的存在于自然界中，主要分布于作物的花和果实当中，但在作物的叶、茎和种子中也都普遍存在。花青素是一种很强的抗氧化物质，能有效地阻止人和动物体内活性氧对饼心、脂类、蛋白质和其它大分子物质的氧化损害，具有预防和治疗多种疾病的作用。花青素作为一种重要的抗氧化性物质，不仅可以延长辣椒果实的耐储运性，提高其对病害的抵抗能力，同时还可提高辣椒果实的营养品质；在营养器官中，花青素则可提高辣椒对环境胁迫的抵抗能力。

近年来，提高辣椒的抗逆性及其果实营养品质一直是辣椒育种的重要目标，品质育种逐渐成为热点。紫色基因的遗传很复杂，不同植物、不同遗传背景下其显隐性和基因间的互相作用也不同，有的还存在微效基因作用。目前针对辣椒紫色性状遗传的研究很少，因此有必要分析辣椒紫色性状的遗传规律，为培育优质的紫色辣椒新品种、紫色基因的挖掘、特色农业及都市农业辣椒品种的培育奠定基础。

利用同源克隆及表达分析，在辣椒中存在多个与花青素合成相关的基因，位于不同的染色体，这些基因在不同组织中，不同程度的影响辣椒中花青素的含量。2005年，Yelena Borovsky 等通过番茄EST标签对An2基因同源克隆获得辣椒MYB_A基因，该基因编码R2R3 MYB型转录因子，为调控花青素合成过程的调控型基因，位于辣椒10号染色体，并获得一个与A基因共分离的分子标记，但未应用在花青素含量或紫色性状的鉴定及筛选中。2018年中国农业大学发表以鉴定辣椒青果期的颜色，检测辣椒基因组的SNP-78-708分子标记，准确性高，但该标记为dCAPS标记，PCR产物需要酶切后进行检测，鉴定成本较高。

目前，分子标记辅助育种仍是育种工作中一项重要辅助手段，其关键就是开发出高效的分子标记。与目标性状紧密连锁并且稳定、检测方便快捷的分子标记直接对基因型进行选择, 能极大的提高育种中选择的准确性和效率，显著缩短育种周期。因此，开发高效的分子标记对于品种改良及新品种选育具有重要意义。

发明内容

针对相关技术中的上述技术问题，本发明提出一种鉴定辣椒青果紫色基因的分子标记及其开发方法与应用，能够克服现有技术的上述不足。

为实现上述技术目的，本发明的技术方案是这样实现的：

根据本发明的第一方面，提供了一种鉴定辣椒青果紫色基因的分子标记IndelP146，以辣椒为物种，所述分子标记IndelP146的正向引物为：AGAATCCATTACTTTTGCATCCACC，所述分子标记IndelP146的反向引物为：GTTGACCTTTTTATAGTTTGTTGTGGG。