[发明专利]一种基于COI基因序列的*和贝氏*的分子鉴别方法在审
申请号: | 201910907879.0 | 申请日: | 2019-09-25 |
公开(公告)号: | CN110616270A | 公开(公告)日: | 2019-12-27 |
发明(设计)人: | 李大命;张彤晴;唐晟凯;钟立强;刘燕山;谷先坤;殷稼雯;蒋琦辰;刘小维 | 申请(专利权)人: | 江苏省淡水水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 32218 南京天华专利代理有限责任公司 | 代理人: | 傅婷婷;瞿网兰 |
地址: | 210017 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 扩增产物 位点 鉴别 细胞色素氧化酶 遗传多样性研究 分子生物学 结果稳定性 物种多样性 基因组DNA 分子鉴别 有效地 重复率 测序 碱基 填补 基因 | ||
1.一种和贝氏的分子鉴别方法,其特征在于包含以下步骤:
(1)分别提取待鉴定的和贝氏基因组DNA;
(2)以提取的基因组DNA为模板,PCR扩增与贝氏的细胞色素氧化酶亚基I基因,PCR扩增使用的上游引物为F:SEQ ID NO.1,下游引物为R:SEQ ID NO.2;
(3)扩增产物纯化后,直接测序,的COI基因扩增产物如SEQ ID NO.3所示,贝氏的COI基因扩增产物如SEQ ID NO.4所示;COI基因第18位点碱基是T的为贝氏,若该位点是C的为。
2.根据权利要求1所述的分子遗传方法,其特征在于所述的PCR反应体系为50μL:80ng/μL的模板DNA 1μL,PCR缓冲液5μL,dNTP混合液4μL,每种dNTP 0.1mmol/L,10μmol/L的上、下游引物各1μL,2μL 2.5IU的Taq酶;双蒸水36μL;所述的PCR缓冲液由10mmol/L Tris-HCl,pH9.0,0.5mmol/L KCl,30mmol/L MgCl2,0.01%(g/100ml)明胶组成;PCR扩增反应程序为:94℃预变性3min,94℃变性30s,55℃退火40s,72℃延伸60s,经30个循环后再72℃延伸10min。
3.一种用于与贝氏的分子鉴别的引物对,其特征在于上游引物为F:SEQ ID NO.1,下游引物为R:SEQ ID NO.2。
4.权利要求3所述的引物对在分子鉴别与贝氏中的应用。
5.权利要求3所述的引物对在制备与贝氏分子鉴别试剂中的应用。
6.一种与贝氏分子鉴别试剂,其特征在于包含权利要求3所述的引物对。
7.根据权利要求6所述的与贝氏分子鉴别试剂,其特征在于还包括PCR缓冲液和dNTP混合液,所述的PCR缓冲液由10mmol/L Tris-HCl,pH9.0,0.5mmol/L KCl,30mmol/LMgCl2,0.01%明胶组成。
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