[发明专利]一种从临床血液中检测金黄色葡萄球菌病原菌的方法在审
| 申请号: | 201910861067.7 | 申请日: | 2019-09-12 |
| 公开(公告)号: | CN110512016A | 公开(公告)日: | 2019-11-29 |
| 发明(设计)人: | 李敬;王旭;孙宝林;郭建;吴谨 | 申请(专利权)人: | 卓源健康科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/14;C12R1/445 |
| 代理公司: | 34120 合肥顺超知识产权代理事务所(特殊普通合伙) | 代理人: | 张芳<国际申请>=<国际公布>=<进入国 |
| 地址: | 230088 安徽省合肥市高新区望*** | 国省代码: | 安徽;34 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 金黄色葡萄球菌 金黄色葡萄球菌基因组DNA 检测 临床血液 血液 病原菌 琼脂糖凝胶电泳 反向引物 扩增片段 序列设计 正向引物 扩增 引物 判定 感染 | ||
1.一种从临床血液中检测金黄色葡萄球菌病原菌的方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1、血液中金黄色葡萄球菌基因组DNA的提取;
S2、血液中金黄色葡萄球菌PCR检测:
S2.1、利用金黄色葡萄球菌基因组DNA序列设计一段特异性的PCR引物,所述PCR引物包括正向引物和反向引物;
所述正向引物如SEQ ID NO.1所示:5’-ATCGCACGCTTCGCCTAT-3’;
所述反向引物如SEQ ID NO.2所示:5’-CGTCCGCTCTGGGTTAGT-3’;
引物的扩增片段长度为135bp;
S2.2、以步骤S1中从血液中提取的金黄色葡萄球菌基因组DNA为模板,采用步骤S2.1中的特异性的PCR引物进行PCR扩增;
S2.3、对PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳及检测,扩增出长度为135bp的片段则判定为检测出金黄色葡萄球菌。
2.根据权利要求1所述的从临床血液中检测金黄色葡萄球菌病原菌的方法,其特征在于,步骤S1中,血液样品中金黄色葡萄球菌基因组DNA的提取具体包括以下步骤:
S1.1、血液样品与酶裂解液等体积混合混匀,37℃孵育15分钟;
S1.2、步骤S1.1中酶裂解液处理的血液样品与碱裂解液等体积混合,轻轻混匀,室温静置裂解5分钟;
S1.3、步骤S1.2中裂解处理后的血液样品与去杂液体按积比为2:1混合,加入去杂液后立即混匀直至出现沉淀,放置离心机中室温12000转/分钟离心10分钟;
S1.4、轻轻吸取上层悬液至DNA吸附柱中,并将DNA吸附柱套在2mL离心管内;12000转/分钟离心1分钟,去除离心管内的废液,将2mL离心管重新套入DNA吸附柱;
S1.5、向DNA吸附柱内加入500μL的0.4M KI与异丙醇混合液;12000转/分钟离心1分钟,去除离心管内的废液,将2mL离心管重新套入DNA吸附柱;
S1.6、再向DNA吸附柱内加入700μL的80%v/v无水乙醇和10mM pH8.0的Tris-HCl混合液;12000转/分钟离心1分钟,去除离心管内的废液,将2mL离心管重新套入DNA吸附柱;
S1.7、重复步骤S1.6 1次;
S1.8、空DNA吸附柱12000转/分钟离心5分钟,并将DNA吸附柱转移至1.5mL离心管内;
S1.9、向空DNA吸附柱膜中央加入30μL 10mM Tris-HCl和1mM EDTA混合液,pH为8.0-8.5;12000转/分钟离心2分钟,收集洗脱下来的基因组DNA。
3.根据权利要求2所述的从临床血液中检测金黄色葡萄球菌病原菌的方法,其特征在于,步骤S1.1中,酶裂解液中含有:0.1mg/mL核糖核酸酶A、1mg/mL蛋白酶K、0.05mg/mL广谱裂解酶、10mg/mL溶菌酶、25mM Tris-HCl、10mM EDTA,pH 8.0-8.5。
4.根据权利要求2所述的从临床血液中检测金黄色葡萄球菌病原菌的方法,其特征在于,步骤S1.2中,碱裂解液中含有:0.2M NaOH,1%SDS,pH 12-14。
5.根据权利要求2所述的从临床血液中检测金黄色葡萄球菌病原菌的方法,其特征在于,步骤S1.3中,去杂液中含有:4M NH4Ac-HAc,pH 4.5-4.8。
6.根据权利要求1所述的从临床血液中检测金黄色葡萄球菌病原菌的方法,其特征在于,步骤S2.2中,PCR扩增时PCR的反应体系为:2倍Flash Hot Start Master Mix 5μL,2μmol/L的正向引物1μL,2μmol/L的反向引物1μL,基因组DNA模板1μL,双蒸水补足至10μL;
PCR的反应程序为:98℃预变性2min;98℃变性5s,50℃退火10s,72℃延伸5s,30次循环;最后72℃延伸7min,16℃保存。
7.根据权利要求1所述的从临床血液中检测金黄色葡萄球菌病原菌的方法,其特征在于,步骤S2中,提供金黄色葡萄球菌基因组DNA提取的菌含量≥10CFU/mL。
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