[发明专利]可控自催化切割介导荧光恢复检测hAAG的传感器及方法有效

专利信息
申请号: 201910343592.X 申请日: 2019-04-26
公开(公告)号: CN109988822B 公开(公告)日: 2023-06-02
发明(设计)人: 张春阳;王黎娟;罗明丽 申请(专利权)人: 山东师范大学
主分类号: C12Q1/682 分类号: C12Q1/682;C12Q1/34
代理公司: 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 代理人: 王磊
地址: 250014 山*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 可控 催化 切割 荧光 恢复 检测 haag 传感器 方法
【说明书】:

本公开提供了可控自催化切割介导荧光恢复检测hAAG的传感器及方法,传感器包括发夹探针1、发夹探针2、信号探针、APE1和T7核酸外切酶;发夹探针1、发夹探针2均为5'端凸出的茎环结构的DNA,发夹探针1的5端茎修饰一个能够被hAAG识别的2'‑脱氧肌苷,发夹探针1含有触发探针1,触发探针1含有能够和第二DNA序列互补的第一DNA序列;发夹探针2由触发探针2和第二DNA序列组成,触发探针2含有能够与信号探针互补的第三DNA序列;信号探针为单链DNA,信号探针两端分别修饰荧光团和淬灭剂。本公开利用该传感器的检测方法能够高效、灵敏地检测hAAG的活性。

技术领域

本公开属于生物分析技术,涉及可控自催化切割介导荧光恢复检测hAAG的传感器及方法。

背景技术

这里的陈述仅提供与本公开有关的背景信息,而不必然构成现有技术。

沃森-克里克碱基配对的DNA双螺旋结构是生物体中重要的遗传密码。在现实中,由于杂环碱基(即A,T,G和C)含有大量的亲核或氧化活性位点,因此容易与细胞外和内源性产生的亲电子或活性氧反应产生大量DNA烷基化和氧化损伤(例如3-烷基腺嘌呤,7-烷基鸟嘌呤,1-N2-乙烯鸟嘌呤,1-N6-乙烯基腺嘌呤,次黄嘌呤等)。最近研究表明,烷基化和氧化损伤可通过阻碍聚合酶而抑制DNA复制或产生DNA突变,最终导致癌症的发生。迄今为止,在人类细胞中,人烷基腺嘌呤DNA糖基化酶(hAAG)是唯一能够特异性识别和切除多种DNA烷基化和氧化损伤的糖基化酶,其功能的异常将导致烷基化DNA损伤修复机制的失灵,从而引发多种人类疾病(如慢性炎症,克罗恩病和威尔森氏病)和癌症(如结肠癌,肝癌,肺癌,子宫颈癌,胶质母细胞瘤,淋巴瘤,黑色素瘤和白血病)。

据本公开发明人所知,到目前为止,开发的用于hAAG测定的方法仅有基于放射磷(γ-32P)标记DNA底物的凝胶电泳法,基于辣根过氧化物酶偶联的免疫球蛋白介导的免疫印迹分析法,以及基于修复反应分子信标介导的单分子计数法。但是,经本公开发明人研究,这些方法具有放射性污染,耗时耗力的操作,严格的反应条件、低准确性以及需要昂贵的抗体和精密的仪器等缺点。

发明内容

为了解决现有技术的不足,本公开的目的是提供可控自催化切割介导荧光恢复检测hAAG的传感器及方法,可用于高效、灵敏地检测人烷基腺嘌呤DNA糖基化酶(hAAG)的活性。

为了实现上述目的,本公开的技术方案为:

一方面,一种基于可控自催化切割介导的荧光恢复检测hAAG的传感器,包括发夹探针1、发夹探针2、信号探针、人脱嘌呤/脱嘧啶核酸内切酶(APE1)和T7核酸外切酶;

发夹探针1为5'-OH末端凸出的茎环结构的DNA,发夹探针1的5'-OH末端的茎修饰一个能够被hAAG识别的2'-脱氧肌苷(I),2'-脱氧肌苷位于距离环3个碱基的位点处,发夹探针1含有触发探针1,触发探针1为2'-脱氧肌苷至3'末端的DNA序列,触发探针1含有能够和发夹探针2的第二DNA序列互补的第一DNA序列,第一DNA序列为2'-脱氧肌苷和与2'-脱氧肌苷配对的碱基位点之间的DNA序列;

发夹探针2为5'-OH末端凸出的茎环结构的DNA,发夹探针2由触发探针2和第二DNA序列组成,第二DNA序列为5'-OH末端凸出的DNA序列,触发探针2含有能够与信号探针互补的第三DNA序列,第三DNA序列的一部分位于茎上,第三DNA序列的另一部分位于环上;

信号探针为单链DNA,信号探针两端分别修饰荧光团和淬灭剂。

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