[发明专利]抗ALS抑制剂类除草剂鼠尾看麦娘的检测方法及试剂盒在审

专利信息
申请号: 201910116392.0 申请日: 2019-02-15
公开(公告)号: CN109750119A 公开(公告)日: 2019-05-14
发明(设计)人: 黄兆峰;魏守辉;黄红娟;张朝贤;周欣欣;姜翠兰 申请(专利权)人: 中国农业科学院植物保护研究所
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 代理人: 王文君;陈征
地址: 100193 *** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 鼠尾看麦娘 除草剂 检测 特异性DNA 丙氨酸 试剂盒 丝氨酸 苏氨酸 谷氨酸 除草剂抗性 特异性引物 天冬氨酸 天冬酰胺 准确度 脯氨酸 酪氨酸 亮氨酸 色氨酸 缬氨酸
【权利要求书】:

1.与鼠尾看麦娘ALS抑制剂类除草剂抗药性相关的特异性DNA片段,其特征在于,所述特异性DNA片段包括核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的DNA片段编码的氨基酸的第122位由丙氨酸突变为苏氨酸,或在197位由脯氨酸突变为苏氨酸,或在205位由丙氨酸突变为缬氨酸,或在376位由天冬氨酸突变为谷氨酸,或在574位由色氨酸突变为亮氨酸,或在653位由丝氨酸突变为天冬酰胺,或在654位由丝氨酸突变为酪氨酸。

2.用于检测抗ALS抑制剂类除草剂鼠尾看麦娘的特异性引物对,其特征在于,包括引物对1和/或引物对2;所述引物对1的核苷酸序列如SEQ ID NO.3~4所示,所述引物对2的核苷酸序列如SEQ ID NO.5~6所示。

3.包含权利要求2所述特异性引物对的试剂盒。

4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括PCR反应缓冲液、dNTPs、标准阳性模板、Mg2+、DNA聚合酶中的一种或多种。

5.权利要求2所述特异性引物对或权利要求3或4所述试剂盒在检测抗ALS抑制剂类除草剂鼠尾看麦娘或指导农田除草用药中的应用。

6.一种抗ALS抑制剂类除草剂鼠尾看麦娘的检测方法,其特征在于,以待测鼠尾看麦娘样品的基因组DNA为模板,利用权利要求2所述的特异性引物对或权利要求3或4所述的试剂盒进行PCR扩增,分析扩增产物的序列。

7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增的反应条件为:94~98℃预变性2~5min,94~98℃变性10~30s,55~60℃退火10~30s,72℃延伸10~60s,循环25~40次,72℃延伸2~10min。

8.根据权利要求6或7所述的方法,其特征在于,当采用所述引物对1进行PCR扩增时,所述PCR扩增的反应条件为:95℃预变性4min,95℃变性30s,56℃退火30s,72℃延伸1min,循环30次,72℃延伸5min;

当采用所述引物对2进行PCR扩增时,所述PCR扩增的反应条件为:95℃预变性4min,95℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸30s,循环30次,72℃延伸5min。

9.根据权利要求6~8任一项所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增的50μL反应体系如下:10×PCR反应缓冲液5μL,2.5mM dNTPs 2μL,引物混合液2μL,Taq DNA聚合酶1U,模板DNA2μL,双蒸水补至50μL;

所述引物混合液包括引物对1和/或引物对2;所述引物混合液中,各引物对的正向引物和反向引物的摩尔比为1:1。

10.根据权利要求6~9任一项所述的方法,其特征在于,所述分析扩增产物的序列为采用测序分析,所述抗ALS抑制剂类除草剂鼠尾看麦娘的判断标准如下:若所述待测鼠尾看麦娘样品的扩增片段的第122位由丙氨酸突变为苏氨酸,或在197位由脯氨酸突变为苏氨酸,或在205位由丙氨酸突变为缬氨酸,或在376位由天冬氨酸突变为谷氨酸,或在574位由色氨酸突变为亮氨酸,或在653位由丝氨酸突变为天冬酰胺,或在654位由丝氨酸突变为酪氨酸(以拟南芥ALS氨基酸序列为标准),则所述待测鼠尾看麦娘为抗ALS抑制剂类除草剂鼠尾看麦娘。

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