[发明专利]抗ALS抑制剂类除草剂鼠尾看麦娘的检测方法及试剂盒在审
申请号: | 201910116392.0 | 申请日: | 2019-02-15 |
公开(公告)号: | CN109750119A | 公开(公告)日: | 2019-05-14 |
发明(设计)人: | 黄兆峰;魏守辉;黄红娟;张朝贤;周欣欣;姜翠兰 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王文君;陈征 |
地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 鼠尾看麦娘 除草剂 检测 特异性DNA 丙氨酸 试剂盒 丝氨酸 苏氨酸 谷氨酸 除草剂抗性 特异性引物 天冬氨酸 天冬酰胺 准确度 脯氨酸 酪氨酸 亮氨酸 色氨酸 缬氨酸 | ||
1.与鼠尾看麦娘ALS抑制剂类除草剂抗药性相关的特异性DNA片段,其特征在于,所述特异性DNA片段包括核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的DNA片段编码的氨基酸的第122位由丙氨酸突变为苏氨酸,或在197位由脯氨酸突变为苏氨酸,或在205位由丙氨酸突变为缬氨酸,或在376位由天冬氨酸突变为谷氨酸,或在574位由色氨酸突变为亮氨酸,或在653位由丝氨酸突变为天冬酰胺,或在654位由丝氨酸突变为酪氨酸。
2.用于检测抗ALS抑制剂类除草剂鼠尾看麦娘的特异性引物对,其特征在于,包括引物对1和/或引物对2;所述引物对1的核苷酸序列如SEQ ID NO.3~4所示,所述引物对2的核苷酸序列如SEQ ID NO.5~6所示。
3.包含权利要求2所述特异性引物对的试剂盒。
4.根据权利要求3所述的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括PCR反应缓冲液、dNTPs、标准阳性模板、Mg2+、DNA聚合酶中的一种或多种。
5.权利要求2所述特异性引物对或权利要求3或4所述试剂盒在检测抗ALS抑制剂类除草剂鼠尾看麦娘或指导农田除草用药中的应用。
6.一种抗ALS抑制剂类除草剂鼠尾看麦娘的检测方法,其特征在于,以待测鼠尾看麦娘样品的基因组DNA为模板,利用权利要求2所述的特异性引物对或权利要求3或4所述的试剂盒进行PCR扩增,分析扩增产物的序列。
7.根据权利要求6所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增的反应条件为:94~98℃预变性2~5min,94~98℃变性10~30s,55~60℃退火10~30s,72℃延伸10~60s,循环25~40次,72℃延伸2~10min。
8.根据权利要求6或7所述的方法,其特征在于,当采用所述引物对1进行PCR扩增时,所述PCR扩增的反应条件为:95℃预变性4min,95℃变性30s,56℃退火30s,72℃延伸1min,循环30次,72℃延伸5min;
当采用所述引物对2进行PCR扩增时,所述PCR扩增的反应条件为:95℃预变性4min,95℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸30s,循环30次,72℃延伸5min。
9.根据权利要求6~8任一项所述的方法,其特征在于,所述PCR扩增的50μL反应体系如下:10×PCR反应缓冲液5μL,2.5mM dNTPs 2μL,引物混合液2μL,Taq DNA聚合酶1U,模板DNA2μL,双蒸水补至50μL;
所述引物混合液包括引物对1和/或引物对2;所述引物混合液中,各引物对的正向引物和反向引物的摩尔比为1:1。
10.根据权利要求6~9任一项所述的方法,其特征在于,所述分析扩增产物的序列为采用测序分析,所述抗ALS抑制剂类除草剂鼠尾看麦娘的判断标准如下:若所述待测鼠尾看麦娘样品的扩增片段的第122位由丙氨酸突变为苏氨酸,或在197位由脯氨酸突变为苏氨酸,或在205位由丙氨酸突变为缬氨酸,或在376位由天冬氨酸突变为谷氨酸,或在574位由色氨酸突变为亮氨酸,或在653位由丝氨酸突变为天冬酰胺,或在654位由丝氨酸突变为酪氨酸(以拟南芥ALS氨基酸序列为标准),则所述待测鼠尾看麦娘为抗ALS抑制剂类除草剂鼠尾看麦娘。
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