[发明专利]一种体外检测CYP11B1基因外显子拷贝数变异的方法有效

专利信息
申请号: 201910068681.8 申请日: 2019-01-24
公开(公告)号: CN109609619B 公开(公告)日: 2022-05-03
发明(设计)人: 刘刚;许争峰;马定远 申请(专利权)人: 南京市妇幼保健院
主分类号: C12Q1/6883 分类号: C12Q1/6883;C12Q1/6858
代理公司: 南京禾易知识产权代理有限公司 32320 代理人: 徐莉芳
地址: 210004 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 体外 检测 cyp11b1 基因 外显子 拷贝 变异 方法
【权利要求书】:

1.一种非诊断目的的体外检测CYP11B1基因外显子拷贝数变异的方法,其特征在于:包括以下步骤:

步骤1:将13对探针在试剂盒中进行稀释以形成后续实验需要的自设探针混合液;

其中,所述13对探针具体为:

用于互补配对结合CYP11B1基因1号外显子及其邻近区域的探针对,其左探针为SEQ IDNO:1,右探针为SEQ ID NO:2;

用于互补配对结合CYP11B1基因2号外显子及其邻近区域的探针对,其左探针为SEQ IDNO:3,右探针为SEQ ID NO:4;

用于互补配对结合CYP11B1基因3号外显子及其邻近区域的探针对,其左探针为SEQ IDNO:5,右探针为SEQ ID NO:6;

用于互补配对结合CYP11B1基因4号外显子及其邻近区域的探针对,其左探针为SEQ IDNO:7,右探针为SEQ ID NO:8;

用于互补配对结合CYP11B1基因5号外显子及其邻近区域的探针对,其左探针为SEQ IDNO:9,右探针为SEQ ID NO:10;

用于互补配对结合CYP11B1基因6号外显子及其邻近区域的探针对,其左探针为SEQ IDNO:11,右探针为SEQ ID NO:12;

用于互补配对结合CYP11B1基因7号外显子及其邻近区域的探针对,其左探针为SEQ IDNO:13,右探针为SEQ ID NO:14;

用于互补配对结合CYP11B1基因8号外显子及其邻近区域的探针对,其左探针为SEQ IDNO:15,右探针为SEQ ID NO:16;

用于互补配对结合CYP11B1基因9号外显子及其邻近区域的探针对,其左探针为SEQ IDNO:17,右探针为SEQ ID NO: 18;

用于互补配对结合CYP11B1基因3’端约2kb序列区域的探针对,其左探针为SEQ ID NO:19,右探针为SEQ ID NO:20;

用于互补配对结合CYP11B1基因5’端约15kb序列区域的探针对,其左探针为SEQ IDNO:21,右探针为SEQ ID NO:22;

用于互补配对结合CYP11B2基因3’端约3kb序列区域的探针对,其左探针为SEQ ID NO:23,右探针为SEQ ID NO:24;

用于互补配对结合CYP11B2基因5’端约4kb序列区域的探针对,其左探针为SEQ ID NO:25,右探针为SEQ ID NO:26;

步骤2:采集受检者标本,如外周血,提取基因组DNA;

步骤3:高温变性基因组DNA;

步骤4:将上述自设探针混合液联合或不联合参考探针混合液,与变性后的基因组DNA进行杂交反应;

步骤5:用连接酶将完全配对杂交并紧邻的左探针3’端与右探针5’相连接而形成一条完整的探针,该探针两端包含后续PCR引物结合序列;

步骤6:使用PCR混合液和DNA聚合酶进行PCR扩增;

步骤7:将PCR产物进行毛细管电泳;

步骤8:每对探针所扩增产物长度是唯一的,通过片段分析软件可计算得出待测样品DNA的CYP11B1基因全部9个外显子的片段相对拷贝数变异信息。

2.根据权利要求1所述的一种非诊断目的的体外检测CYP11B1基因外显子拷贝数变异的方法,其特征在于,所述试剂盒包含步骤1中所述的13对探针,所述SEQ ID NO:2,SEQ IDNO:4,SEQ ID NO:6,SEQ ID NO:8,SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:12,SEQ ID NO:14,SEQ IDNO:16,SEQ ID NO:18,SEQ ID NO:20,SEQ ID NO:22,SEQ ID NO:24,SEQ ID NO:26的5’端的第1个碱基需要磷酸化修饰。

3.根据权利要求1所述的一种非诊断目的的体外检测CYP11B1基因外显子拷贝数变异的方法,其特征在于,所述试剂盒还包含以下一种或多种试剂:

用于从样品提取基因组DNA的试剂;

用于所述探针进行多重连接依赖探针扩增反应的试剂;

用于处理扩增产物以使得扩增产物能用于毛细管电泳的试剂;

连接酶链反应试剂,如杂交反应液、连接酶、连接缓冲液A、连接缓冲液B、PCR混合液和DNA聚合酶。

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