[发明专利]一种体外检测CYP11B1基因外显子拷贝数变异的方法有效
申请号: | 201910068681.8 | 申请日: | 2019-01-24 |
公开(公告)号: | CN109609619B | 公开(公告)日: | 2022-05-03 |
发明(设计)人: | 刘刚;许争峰;马定远 | 申请(专利权)人: | 南京市妇幼保健院 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12Q1/6858 |
代理公司: | 南京禾易知识产权代理有限公司 32320 | 代理人: | 徐莉芳 |
地址: | 210004 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 体外 检测 cyp11b1 基因 外显子 拷贝 变异 方法 | ||
1.一种非诊断目的的体外检测CYP11B1基因外显子拷贝数变异的方法,其特征在于:包括以下步骤:
步骤1:将13对探针在试剂盒中进行稀释以形成后续实验需要的自设探针混合液;
其中,所述13对探针具体为:
用于互补配对结合CYP11B1基因1号外显子及其邻近区域的探针对,其左探针为SEQ IDNO:1,右探针为SEQ ID NO:2;
用于互补配对结合CYP11B1基因2号外显子及其邻近区域的探针对,其左探针为SEQ IDNO:3,右探针为SEQ ID NO:4;
用于互补配对结合CYP11B1基因3号外显子及其邻近区域的探针对,其左探针为SEQ IDNO:5,右探针为SEQ ID NO:6;
用于互补配对结合CYP11B1基因4号外显子及其邻近区域的探针对,其左探针为SEQ IDNO:7,右探针为SEQ ID NO:8;
用于互补配对结合CYP11B1基因5号外显子及其邻近区域的探针对,其左探针为SEQ IDNO:9,右探针为SEQ ID NO:10;
用于互补配对结合CYP11B1基因6号外显子及其邻近区域的探针对,其左探针为SEQ IDNO:11,右探针为SEQ ID NO:12;
用于互补配对结合CYP11B1基因7号外显子及其邻近区域的探针对,其左探针为SEQ IDNO:13,右探针为SEQ ID NO:14;
用于互补配对结合CYP11B1基因8号外显子及其邻近区域的探针对,其左探针为SEQ IDNO:15,右探针为SEQ ID NO:16;
用于互补配对结合CYP11B1基因9号外显子及其邻近区域的探针对,其左探针为SEQ IDNO:17,右探针为SEQ ID NO: 18;
用于互补配对结合CYP11B1基因3’端约2kb序列区域的探针对,其左探针为SEQ ID NO:19,右探针为SEQ ID NO:20;
用于互补配对结合CYP11B1基因5’端约15kb序列区域的探针对,其左探针为SEQ IDNO:21,右探针为SEQ ID NO:22;
用于互补配对结合CYP11B2基因3’端约3kb序列区域的探针对,其左探针为SEQ ID NO:23,右探针为SEQ ID NO:24;
用于互补配对结合CYP11B2基因5’端约4kb序列区域的探针对,其左探针为SEQ ID NO:25,右探针为SEQ ID NO:26;
步骤2:采集受检者标本,如外周血,提取基因组DNA;
步骤3:高温变性基因组DNA;
步骤4:将上述自设探针混合液联合或不联合参考探针混合液,与变性后的基因组DNA进行杂交反应;
步骤5:用连接酶将完全配对杂交并紧邻的左探针3’端与右探针5’相连接而形成一条完整的探针,该探针两端包含后续PCR引物结合序列;
步骤6:使用PCR混合液和DNA聚合酶进行PCR扩增;
步骤7:将PCR产物进行毛细管电泳;
步骤8:每对探针所扩增产物长度是唯一的,通过片段分析软件可计算得出待测样品DNA的CYP11B1基因全部9个外显子的片段相对拷贝数变异信息。
2.根据权利要求1所述的一种非诊断目的的体外检测CYP11B1基因外显子拷贝数变异的方法,其特征在于,所述试剂盒包含步骤1中所述的13对探针,所述SEQ ID NO:2,SEQ IDNO:4,SEQ ID NO:6,SEQ ID NO:8,SEQ ID NO:10,SEQ ID NO:12,SEQ ID NO:14,SEQ IDNO:16,SEQ ID NO:18,SEQ ID NO:20,SEQ ID NO:22,SEQ ID NO:24,SEQ ID NO:26的5’端的第1个碱基需要磷酸化修饰。
3.根据权利要求1所述的一种非诊断目的的体外检测CYP11B1基因外显子拷贝数变异的方法,其特征在于,所述试剂盒还包含以下一种或多种试剂:
用于从样品提取基因组DNA的试剂;
用于所述探针进行多重连接依赖探针扩增反应的试剂;
用于处理扩增产物以使得扩增产物能用于毛细管电泳的试剂;
连接酶链反应试剂,如杂交反应液、连接酶、连接缓冲液A、连接缓冲液B、PCR混合液和DNA聚合酶。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于南京市妇幼保健院,未经南京市妇幼保健院许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/pat/books/201910068681.8/1.html,转载请声明来源钻瓜专利网。