[发明专利]用于选择性扩增核酸的寡核苷酸在审
申请号: | 201880075337.5 | 申请日: | 2018-10-18 |
公开(公告)号: | CN111373042A | 公开(公告)日: | 2020-07-03 |
发明(设计)人: | D·A·阿莫雷塞;B·G·施罗德;N·库伦;A·萨莱亚 | 申请(专利权)人: | 纽亘技术公司 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12P19/34;C12Q1/6874;C12Q1/6844;C12Q1/6848;C12Q1/686 |
代理公司: | 北京律盟知识产权代理有限责任公司 11287 | 代理人: | 范海云 |
地址: | 美国加利*** | 国省代码: | 暂无信息 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 选择性 扩增 核酸 寡核苷酸 | ||
1.一种识别核酸分子的混合物中的靶点的方法,所述方法包含:
提供所述核酸分子的混合物;
向所述混合物中添加非天然存在的寡核苷酸,其包含:
包含至少一个胞嘧啶的5'区;
与所述靶点的一部分互补的中心区;以及
3'区,
使得所述寡核苷酸粘合于所述靶点;
将所述混合物中的未配对胞嘧啶转化成尿嘧啶;并且
检测所述寡核苷酸,由此识别所述混合物中的所述靶点。
2.根据权利要求1所述的方法,其进一步包含:
使用所述寡核苷酸的5'区作为模板延伸所述经粘合靶点的3'端。
3.根据权利要求1所述的方法,其中转化步骤选自由以下组成的群组:将亚硫酸氢根离子添加到所述混合物和使所述混合物暴露于胞嘧啶脱氨酶。
4.根据权利要求1所述的方法,其中所述寡核苷酸为DNA。
5.根据权利要求4所述的方法,其中检测步骤包含扩增不含尿嘧啶的DNA分子。
6.根据权利要求4所述的方法,其中检测步骤包含降解含有尿嘧啶的DNA分子。
7.根据权利要求1所述的方法,其中所述核酸分子为miRNA。
8.一种由RNA分子的混合物制成靶点库的方法,所述方法包含:
提供所述RNA分子的混合物;
向所述混合物中添加多个非天然存在的寡核苷酸,每一寡核苷酸包含:
包含至少一个胞嘧啶的共同5'区;
与所述靶点的一部分互补的独特中心区;以及
共同3'区,
使得所述多个寡核苷酸中的至少一个与至少一个靶点粘合;
将所述混合物中的未配对胞嘧啶转化成尿嘧啶;并且
选择不含尿嘧啶的寡核苷酸以用于制成所述库。
9.根据权利要求8所述的方法,其进一步包含∶
使用所述多个寡核苷酸中的至少一个的5'区作为模板延伸所述经粘合靶点的3'端。
10.根据权利要求8所述的方法,其中转化步骤选自将亚硫酸氢根离子添加到所述混合物和使所述混合物暴露于胞嘧啶脱氨酶。
11.根据权利要求8所述的方法,其中所述寡核苷酸为DNA。
12.根据权利要求11所述的方法,其中选择包含扩增不含尿嘧啶的DNA分子。
13.根据权利要求11所述的方法,其中选择步骤包含降解含有尿嘧啶的DNA分子。
14.根据权利要求8所述的方法,其中所述RNA分子为miRNA。
15.一种识别核酸分子的混合物中的靶点的方法,所述方法包含:
提供所述核酸分子的混合物;
向所述混合物中添加非天然存在的寡核苷酸,其包含:
不含胞嘧啶的5'区;
包含至少一个胞嘧啶并且与所述靶点的一部分互补的中心区;以及
不含胞嘧啶的3'区,
使得所述寡核苷酸粘合于所述靶点,由此在所述至少一个胞嘧啶与所述靶点中的至少一个鸟嘌呤之间形成碱基对;
将所述混合物中的未配对胞嘧啶转化成尿嘧啶;并且
检测所述寡核苷酸,由此识别所述混合物中的所述靶点。
16.根据权利要求15所述的方法,其中转化步骤选自将亚硫酸氢根离子添加到所述混合物和使所述混合物暴露于胞嘧啶脱氨酶。
17.根据权利要求15所述的方法,其中所述寡核苷酸为DNA。
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