[发明专利]微泡核酸和/或蛋白及其作为肾移植排斥的标志物的应用

说明书

本发明一般涉及微泡生物标志物用于在患者中评估肾移植排斥的用途，所述生物标志物例如核酸(包括mRNA标记)和/或蛋白。本发明进一步涉及在已接受肾移植的患者中评估和/或监测肾移植排斥。本发明还涉及通过从改良的收集杯的上室采集尿样，或通过从标准杯采集30 ml，改进来自尿液外来体标志物的信号的方法。

相关申请

本申请要求2017年5月17日提交的美国临时申请号62/507,433的权益，其内容通过引用以其整体结合到本文中。

发明领域

本发明一般涉及微泡生物标志物用于在患者中评估肾移植排斥的用途，所述生物标志物例如核酸(包括核酸标记)和/或蛋白。本发明还涉及在已接受肾移植的患者中评估和/或监测肾移植排斥。

背景

对细胞中发生的遗传和表观遗传变化的日益增加的了解，为通过分析疾病特异性核酸和蛋白序列和特征来检测、表征和监测疾病和病症提供了机会。这些变化可以通过检测各种疾病相关的生物标志物的任何一种来观察。各种分子诊断分析被用来检测这些生物标志物并为患者、医生、临床医生和研究人员提供有价值的信息。

使用体液样品进行这些测试的能力在患者福利、进行纵向疾病监测的能力、和甚至在组织细胞不易获得的情况下获得表达特征的能力方面，具有广泛的意义。

因此，需要检测生物标志物，例如微泡中的生物标志物的新的、非侵入性的方法，以帮助对于疾病或其它医学病症的表征、诊断、监测或疗法选择。

发明简述

在一个方面，本发明涉及一种用于在患者中评估肾排斥的方法，该方法包括以下步骤：

a) 从患者的生物样品中分离微泡部分；

b) 从微泡部分中提取多种生物标志物；

c) 从患者样品的多种生物标志物中确定至少一种生物标志物的表达水平；

d) 任选地使至少一种生物标志物的表达水平标准化；和

e) 测量至少一种生物标志物的表达水平，以确定患者正在经受肾排斥还是非排斥。

在一个优选的实施方案中，肾排斥是肾移植排斥。

在一些实施方案中，本文公开的任何一种方法所识别的多种生物标志物包括RNA，而在其它实施方案中，多种生物标志物包括蛋白。在一些实施方案中，多种生物标志物包括RNA和蛋白的组合。

在一个实施方案中，本文的受试者是已接受肾移植的患者。在一些实施方案中，评估受试者中的肾排斥为患者提供了预后因子。

在一个相关的方面，本发明涉及使用微泡RNA标记来评估、分析、确定、测量、表征、识别或诊断受试者中的肾移植排斥的方法，其中在一些实施方案中，受试者是成人。在其它实施方案中，受试者是儿童。在一些实施方案中，所述方法用来纵向监测治疗功效。

本文提供的方法和组合物可用于测量从微泡获得的核酸，例如微泡RNA (本文也称为外来体RNA或外来体的RNA)，以及从微泡获得的蛋白(如微泡或外来体蛋白)，作为移植排斥，例如肾移植排斥的诊断。