[发明专利]一种自制探针检测肿瘤11基因的技术在审
| 申请号： | 201811426675.7 | 申请日： | 2018-11-27 |
| 公开（公告）号： | CN109486925A | 公开（公告）日： | 2019-03-19 |
| 发明（设计）人： | 张明航;吴卫卫;苏雪峰;郭向前;季少平;赵晓芳;葛斌文;王宇峰 | 申请（专利权）人： | 江苏苏博生物医学科技南京有限公司;江苏苏博生物医学股份有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 210032 江苏省南京市高新区新锦湖*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 制备 合成探针 时间周期 探针合成 探针检测 肿瘤 捕获 基因 自制 链霉亲和素磁珠 生物信息学分析 杂交捕获探针 目的片段 探针制备 生物素 节约 测序 超声 构建 扩增 上机 探针 文库 打断 | ||
1.一种自制探针检测肿瘤11基因的技术，其特征在于：包括如下步骤：扩增肿瘤11基因的目的片段，物理超声随机打断，生物素进行标记，链霉亲和素磁珠纯化，获得的捕获探针对构建好的文库进行捕获，上机测序，生物信息学分析。
2.根据权利要求1所述的一种自制探针检测肿瘤11基因的技术，其特征在于：所述扩增肿瘤11基因时选用67对特异性引物，将肿瘤11基因扩增出来。
3.根据权利要求1所述的一种自制探针检测肿瘤11基因的技术，其特征在于：所述物理超声随机打断是采用物理方法将其扩增好的产物超声打断为90-250bp的片段，然后切取100-200bp片段进行胶回收，以获得目的条带。
4.根据权利要求1所述的一种自制探针检测肿瘤11基因的技术，其特征在于：所述生物素标记是对目的条带进行生物素标记，进而用链霉亲和素磁珠进行纯化，以获得生物素标记的肿瘤11基因捕获探针。
5.根据权利要求1所述的一种自制探针检测肿瘤11基因的技术，其特征在于：所述捕获是用制备好的肿瘤11基因捕获探针对基因组文库进行捕获，并上机测序，进行生物信息学分析。
6.根据权利要求1所述的一种自制探针检测肿瘤11基因的技术，其特征在于：所述制备好的探针用于高通量测序中肿瘤11基因进行检测，检测方法包括如下步骤：
（1）提取基因组DNA或血液游离cfDNA；
（2）将提取好的DNA进行随机打断；
（3）利用相关文库构建试剂盒进行文库构建；
（4）对构建好的文库进行质控；
（5）用制备好的肿瘤11基因探针对质控好的文库进行捕获；
（6）采用二代测序仪，如IonTorrent平台或Illμmina平台的相关测序仪进行上机测序；
（7）采用相关软件对测序结果进行生物信息学分析。
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