[发明专利]杉木EST-SSR分子标记组合

说明书

本发明涉及一种杉木EST‑SSR分子标记组合，所开发的EST‑SSR均为多态性标记，其编号分别为CLESTSSR08、CLESTSSR16、CLESTSSR22、CLESTSSR33、CLESTSSR76、CLESTSSR97、CLESTSSR193、CLESTSSR201、CLESTSSR 286。本发明开发的EST‑SSR分子标记重复好，可靠性高，适用于杉木种质资源评价及其分子标记辅助育种等研究。

技术领域

本发明涉及分子生物学标记技术领域，特别涉及一种杉木EST-SSR分子标记组合。

背景技术

分子标记是以个体间遗传物质内核苷酸序列变异为基础的遗传标记，能在DNA水平上反应植物遗传基础的差异。简单重复序列(SSR)广泛分布于各类真核生物基因组的不同位置，由于SSR的重复次数不同，使其呈现高度的多态性。与其它分子标记相比，SSR标记具有可靠性强、多态信息含量高、共显性遗传、操作简单等优点，广泛用于遗传多样性分析、遗传图谱构建、基因定位和标记辅助育种中。

SSR标记可分为基因组SSR(gSSR)和表达序列标签SSR(EST-SSR)，EST-SSR标记源于基因的转录区，与gSSR标记相比，其免去了文库构建和大量的序列测定，具有开发耗时短，花费低，效率高等优点。同时，EST作为基因转录本的一部分，更易获得基因表达的信息，可为功能基因的直接鉴定提供重要依据。杉木(Cunninghamia lanceolata)是我国南方重要的速生用材树种，广泛分布于我国长江流域以及珠江流域的17个省区。杉木由于其生长快，材质好，易繁殖，易栽培，适应性强，深受广大南方杉木产区人民的喜爱。

然而，杉木尚无全基因组序列信息，杉木SSR标记开发滞后，目前仅开发出少量SSR引物，分子标记数量不足，限制了杉木分子遗传学研究。

发明内容

基于此，本发明的目的是为杉木分子遗传学研究提供更多的多态性分子标记。

本发明提出一种杉木EST-SSR分子标记组合，其中，所述EST-SSR分子标记均为多态性标记，其编号分别为CLESTSSR08、CLESTSSR16、CLESTSSR22、CLESTSSR33、CLESTSSR76、CLESTSSR97、CLESTSSR193、CLESTSSR201或CLESTSSR 286，各分子标记对应的核苷酸序列分别为：

SEQCLESTSSR08：

GTGGCCAATTCTGCAAGCAATGGAGGGAGTTGCTGTGGCGGCAGTGGCAGTAGCAGTAGCAGTAGCAGTAGCAGTAGCAGTGGAGGAAGCTGCAGCAGTCATGGCAAGTCTTCTGATCTTTCTAATGTTGGGAAAGAGTTTGAAGCCATGGTTGCCAGAGCCACATTGACT；

SEQCLESTSSR16：

TGTTGCTTCAGTCGGGGTTTGCGGCAGAGGAAGCGGTTGTCCAGCGAATTGATCCACAGACCTCCTGGGCGCTAGAGCCGACGGAGACGGAGACGGAGACGGAGACGGATGTTGCTTCAGTCGGGGTTTGAATCGCCCAGCACGAAATCAACACTTCGCCTTGCTAAATCGTCGTTAGAACTTCGCCTCAATTTCGTAGGCGACGGAGACGGAGATCCAAAGCCGCTTCT；

SEQCLESTSSR22：