[发明专利]基于深度卷积神经网络自动分割肺结节的辅助检测方法在审
| 申请号: | 201811353550.6 | 申请日: | 2018-11-14 |
| 公开(公告)号: | CN109727253A | 公开(公告)日: | 2019-05-07 |
| 发明(设计)人: | 孔德兴;杜维伟;徐宗本;靖稳峰 | 申请(专利权)人: | 西安大数据与人工智能研究院 |
| 主分类号: | G06T7/11 | 分类号: | G06T7/11;G06N3/04;G06N3/08;G16H50/20 |
| 代理公司: | 西安弘理专利事务所 61214 | 代理人: | 韩玙 |
| 地址: | 710054 陕西省西安市碑林*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 卷积神经网络 候选区域 肺结节 预处理图像 结节 肺部CT图像 辅助检测 血管区域 自动分割 分割 预处理 读取 归一化处理 有效探测 类似物 去噪 微调 剔除 三维 探测 图像 | ||
1.一种基于深度卷积神经网络自动分割肺结节的辅助检测方法,其特征在于,具体包括以下步骤:
步骤1、读取肺部CT图像数据;
步骤2、对肺部CT图像数据进行预处理,依次包括图像插值、去噪及归一化处理,进而获得预处理图像;
步骤3、对所述步骤2得到的预处理图像提取肺实质区域和血管区域,然后剔除所述预处理图像中肺实质区域外的数据和血管区域数据,获得候选区域;然后使用深度卷积神经网络探测并分割所述候选区域,获得若干个独立候选区域;
步骤4、使用深度卷积神经网络对所述独立候选区域进行识别,获得结节区域;
步骤5、对结节区域的边界进行微调,得到精确分割的三维肺结节模型。
2.根据权利要求1所述的一种基于深度卷积神经网络自动分割肺结节的辅助检测方法,其特征在于,所述步骤1中CT图像数据为层厚不大于2.5mm的原始薄层数据。
3.根据权利要求1所述的一种基于深度卷积神经网络自动分割肺结节的辅助检测方法,其特征在于,所述步骤2中图像插值时将体素间隔拉伸为正方体,提取肺实质区域时使用深度卷积神经网络分割肺实质,提取血管区域时使用Frangi血管增强滤波方法,所述图像的去噪及归一化时采用各项异性滤波方法。
4.根据权利要求1所述的一种基于深度卷积神经网络自动分割肺结节的辅助检测方法,其特征在于,所述步骤3中提取肺实质区域具体按以下步骤实施:
步骤3.1、获取经所述步骤2插值、去噪、归一化后得到的CT数据,以及标记出的肺实质区域和非肺实质区域的标准分割结果;
步骤3.2、构建深度卷积神经网络模型,该模型的输入层为一组CT数据,后续为一系列的dense net block,每个block为卷积层与batch normalization层的组合,相邻两个block之间以池化层连接;多个dense net blocks之后使用Upsampling层与卷积层逐步将提取到的特征还原到原图像大小;
卷积层数学表达为:
其中,为l-1层的输出,为卷积核,为卷积运算,如图像A与卷积核k的卷积运算定义为:为偏置项,f(x)为激活函数,通常取relu函数:f(x)=max(x,0);
Dense net block为卷积层和Batch normalization层的组合,并且将其每个Batchnormalization层的输出与其后的每一个卷积层输入相连接;
Batch normalization层用来正则化输入该层的数据,数学表达为:
其中
Pooling层和Upsampling层用来调整特征图像的维度,Pooling缩小图像维度,Upsampling放大图像维度;
步骤3.3、选取与所述卷积层相匹配的损失函数,并使用反向传播算法更新模型的参数,具体为:
通过残差公式把残差传播到每层参数上,具体通过如下公式完成:
卷积层反向传播函数:
其中,rot180()表示矩阵旋转180度操作,以残差作为计算卷积核的梯度的中间变量,把l+1层的所有与卷积核有影响的节点对该卷积核求取梯度,再以的梯度更新参数;
池化层反向传播函数:
其中,kron()积意为将残差传播到上一层的对应位置的小区域,从而实现残差的上采样;Upsampling层的反向传播与其相反,每次Upsampling之后的残差需要累加到对应Unet的dense net block上;
Batch normalization层的反向传播函数为:
通过残差求出相应参数γ,β的梯度,Batch normalization层的残差再往前传播需要累加到之前所有dense net block的残差上;
步骤3.4、将步骤3.1获得的CT图像数据和标准分割结果分为k组,每次选择k-1组数据做如步骤3.2~步骤3.3所述的卷积神经网络的训练,余下一组做测试,如此重复多次选取最佳参数,获得候选区域;
步骤3.5、以所述步骤3.2~步骤3.4的深度卷积神经网络探测方法获得若干个独立候选区域。
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