[发明专利]人类四个泛素基因mRNA表达水平荧光定量PCR的检测方法在审
申请号: | 201811330190.8 | 申请日: | 2018-11-09 |
公开(公告)号: | CN109439736A | 公开(公告)日: | 2019-03-08 |
发明(设计)人: | 陈琦;杨丽婷;雷薇;万亮华;吴决连;范丽;杨媚;廖琳玉;覃萍;马珊珊 | 申请(专利权)人: | 南宁国拓生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/686 | 分类号: | C12Q1/686;C12Q1/6883;C12N15/11 |
代理公司: | 桂林市持衡专利商标事务所有限公司 45107 | 代理人: | 汤凌志 |
地址: | 530002 广西壮族*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 泛素基因 荧光定量PCR 核苷酸差异 特异引物 表达量 检测 基因 分析 | ||
1.人类四个泛素基因mRNA表达水平荧光定量PCR的检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
1)引物设计:设计人基因组中四个泛素基因UBB、UBC、UBA52、RPS27A的mRNA表达量的引物以及作为内参基因的GAPDH基因特异性引物;
2)细胞总RNA的提取纯化:从培养细胞中提取总RNA,并消化DNA;
3)反转录合成cDNA第一链:取1ug总RNA作为模板,反转录合成cDNA第一链;
4)荧光定量PCR反应:使用SYBR Green I染料法,分别在每个反应管中加入荧光定量PCR预混合液,相应基因的上游及下游引物,在AnalytikJena qTOWER 2.0荧光定量PCR仪上进行;
5)溶解曲线分析:
所叙步骤5)中溶解曲线的反应条件:扩增温度以0.5℃的增幅从60℃缓慢递增到95℃,升温的同时连续测定样品的荧光强度以获取溶解曲线;
步骤5)溶解曲线分析中,UBB、UBC、UBA52和RPS27A基因均只有一个特异性溶解曲线峰,溶解温度分别为82.67℃、85.35℃、86.93℃和80.25℃,说明所设计的引物具有较好的特异性,可以用于基因表达量分析;
步骤5)溶解曲线分析中,GAPDH基因只有一个特异性溶解曲线峰,溶解温度为85.2℃,说明所设计的引物具有较好的特异性,可以用于基因表达量分析;
步骤1)所述的人基因组中四个泛素基因UBB、UBC、UBA52、RPS27A的mRNA表达量的引物,是一套用于检测人基因组中四个泛素基因UBB、UBC、UBA52、RPS27A的表达量的引物,保证四个泛素基因的引物都是特异检测该基因的mRNA表达量,不受泛素序列高度保守的影响:
UBB基因特异性上游引物的序列:
UBB F:5’-CTGAGGGGTGGCTGTTAATT-3’,
UBB基因特异性下游引物的序列:
UBB R:5’-CATTTTGAACAGGTTCAGCT-3’;
UBC基因特异性上游引物的序列:
UBC F:5’-AAGGCATCCCTCCTGATCAG-3’,
UBC基因特异性下游引物的序列:
UBC R:5’-AGGGGAAACTTAGACACCCC-3’;
UBA52基因特异性上游引物的序列:
UBA52 F:5’-AGGAGGGTATCCCACCTGAC-3’,
UBA52基因特异性下游引物的序列:
UBA52 R:5’-CAATAATGCCACCTCGCAGG-3’;
RPS27A基因特异性上游引物的序列:
RPS27A F:5’-GGAAGATGGACGTACTTTGT-3’,
RPS27A基因特异性下游引物的序列:
RPS27A R:5’-TTCTTGGGAGTGGTGTAAGA-3’;
步骤1)所述的作为内参基因的GAPDH基因特异性引物,是一对用于校正样品之间的上样量差异、个体差异的内参引物,
内参基因GAPDH基因特异性上游引物的序列:
GAPDH F:5’-CCTGCACCACCAACTGCTTA-3’,
内参基因GAPDH基因特异性下游引物的序列:
GAPDH R:5’-GGCCATCCACAGTCTTCTGAG-3’。
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