[发明专利]一种鉴定瓦氏黄颡鱼低溶氧耐受性和肥满度的SNP分子标记及其应用有效
申请号: | 201811294276.X | 申请日: | 2018-11-01 |
公开(公告)号: | CN109182557B | 公开(公告)日: | 2021-11-19 |
发明(设计)人: | 尹绍武;李杰;张国松;王涛 | 申请(专利权)人: | 南京师范大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 | 代理人: | 柏尚春 |
地址: | 210024 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴定 瓦氏黄颡鱼低溶氧 耐受 肥满度 snp 分子 标记 及其 应用 | ||
1.一种检测SNP分子标记的方法在鉴定瓦氏黄颡鱼低溶氧耐受性和肥满度的应用,其特征在于,通过对待测瓦氏黄颡鱼进行SNP分子标记的检测,鉴定所述待测瓦氏黄颡鱼的低溶氧耐受性和肥满度大小,所述SNP分子标记位于SEQ ID NO:1所述 核苷酸序列的第68位,其碱基为G或A,SNP分子标记的位点基因型为GA、GG或AA的情况下,三种基因型的瓦氏黄颡鱼低溶氧耐受性能力为GAGGAA,肥满度大小为AAGGGA。
2.一种用于检测权利要求1所述的SNP分子标记的KASP引物组,其特征在于,所述KASP引物组由FAM正向引物、VIC正向引物、COM反向引物组成;所述FAM正向引物如SEQ ID NO:2所示;所述VIC正向引物如SEQ ID NO:3所示;所述COM反向引物如SEQ ID NO:4所示。
3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述的检测SNP分子标记的方法包括以下步骤:
(1)取瓦氏黄颡鱼尾鳍,提取其基因组DNA;
(2)采用权利要求2所述的KASP引物组进行PCR扩增,将所得扩增产物进行荧光信号扫描;
(3)根据所述荧光信号判断瓦氏黄颡鱼的SNP位点基因型是GA还是GG还是AA;
(4)不同基因型与瓦氏黄颡鱼低溶氧耐受性和肥满度的相关性分析;
所述GA、GG和AA三种基因型的瓦氏黄颡鱼低溶氧耐受性能力为GAGGAA,肥满度大小为AAGGGA。
4.一种用于检测权利要求1所述的SNP分子标记的试剂盒,其特征在于,包含权利要求2所述的KASP引物组。
5.权利要求2所述的KASP引物组或权利要求4所述的试剂盒在鉴定瓦氏黄颡鱼低溶氧耐受性和肥满度中的应用。
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