[发明专利]一种动物卵母细胞极体的视觉自动检测方法在审
申请号: | 201811282194.3 | 申请日: | 2018-10-31 |
公开(公告)号: | CN109584211A | 公开(公告)日: | 2019-04-05 |
发明(设计)人: | 孙明竹;赵新;王钰晴 | 申请(专利权)人: | 南开大学 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T7/11;G06T7/73;G06T7/62 |
代理公司: | 天津睿勤专利代理事务所(普通合伙) 12225 | 代理人: | 孟福成 |
地址: | 300071*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 极体 卵母细胞 自动检测 动物卵母细胞 卷积神经网络 视觉 训练数据集 后处理 生物结构 生物实验 图像变换 图像分割 返回 卷积核 数据集 检测 显微镜 准确率 离焦 变形 采集 图像 分割 改进 | ||
1.一种动物卵母细胞极体的视觉自动检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)建立并训练卷积神经网络;
(2)将采集的图像输入到训练好的卷积神经网络,并利用卷积神经网络进行图像分割;
(3)选取分割图像中的最可能的极体区域;
(4)根据极体区域进行极体判断。
2.按照权利要求1所述的动物卵母细胞极体的视觉自动检测方法,其特征在于,所述步骤(1)包含如下步骤:
(a)采集动物卵母细胞极体实验图像,进行标记和扩充,建立图像训练数据集;
(b)对卷积神经网络进行改进,并利用卷积神经网络进行图像分割;
(c)利用分割的损失函数进行卷积神经网络的训练。
3.按照权利要求2所述的动物卵母细胞极体的视觉自动检测方法,其特征在于,所述步骤(a)中的标记主要针对极体区域进行,标记的过程为:将生物细胞极体实验过程中显微镜下摄取的图像,按照图像分割的方式进行人工标记;标记方法为:极体所在的位置为前景(用白色表示),其他为背景(用黑色表示)。
4.按照权利要求2所述的动物卵母细胞极体的视觉自动检测方法,其特征在于,所述步骤(a)中的扩充主要目的是增加训练数据量;扩充的主要方法是细胞极体实验图像的旋转、镜像和变形。
5.按照权利要求2所述的动物卵母细胞极体的视觉自动检测方法,其特征在于,所述步骤(b)中卷积神经网络的改进过程为:将不同大小的卷积核引入卷积层,并将网络较低层次的输出输入到较高层次,实现跨越连接,融合图像低层次的纹理信息和高层次的语义信息;最终使卷积神经网络输入的生物细胞图像输出为分割图像。
6.按照权利要求1所述的动物卵母细胞极体的视觉自动检测方法,其特征在于,所述步骤(3)中极体区域的选取方法采用非最大抑制方法,针对图像训练数据集,同时设置面积阈值和概率阈值,去除低于阈值的连通域,选出概率最大且面积最符合的区域作为最可能的极体区域。
7.按照权利要求6所述的动物卵母细胞极体的视觉自动检测方法,其特征在于,所述面积阈值为整张图像的面积的0.01,所述概率阈值为0.8。
8.按照权利要求1所述的动物卵母细胞极体的视觉自动检测方法,其特征在于,所述步骤(4)中的极体判断包括极体存在与否判断和存在极体的位置判断,判断过程为:如果存在最可能的极体区域,计算其区域中心,作为极体的位置返回;如果不存在最可能的极体区域,返回不存在极体。
9.按照权利要求8所述的动物卵母细胞极体的视觉自动检测方法,其特征在于,所述区域中心的计算过程为:对于最可能的极体区域,用二值图像表示,得到此区域所有像素点的坐标,计算坐标之和的均值,即为区域中心。
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