[发明专利]结直肠癌标志物及其应用有效
申请号: | 201810961360.6 | 申请日: | 2018-08-22 |
公开(公告)号: | CN110857450B | 公开(公告)日: | 2023-04-07 |
发明(设计)人: | 李南南;揭著业;易吉;吴逵;朱师达;贾慧珏;仝欣;罗慧娟;陈小芳 | 申请(专利权)人: | 深圳华大生命科学研究院 |
主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851;C12Q1/6886;C12N15/85;C12N15/11;C12M1/34 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 赵天月 |
地址: | 518083 广东省深*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 直肠癌 标志 及其 应用 | ||
本发明涉及基因检测领域,具体涉及一种结直肠癌标志物及其应用。所述标志物包括选自下列中的至少一种:SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:5;来源于具核梭杆菌且与所述SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:5中的任意一种具有95%以上同源性的核酸序列。同时还提供了引物对、核酸探针、构建体以及试剂盒以及对待测者进行结直肠癌检测的系统。通过本发明提供的标志物可以实现结直肠癌的快速检测。
技术领域
本发明涉及基因检测领域,具体涉及一种结直肠癌生物标志物及其应用,尤其涉及一种结直肠癌标志物、引物对、核酸探针、试剂盒以及结直肠癌的检测方法。
背景技术
据统计,结直肠癌(colorectal cancer,CRC)在各类癌症中发病率排名第三,致死率排名第四,近55%的发病案例发生在较发达国家。在年龄小于40岁的人中发生率较低,但随着年龄增加发生率亦逐渐增高。结直肠癌也是目前最可预防的肿瘤之一,医学界认为如果及早发现,肠癌是最易治愈的癌症。传统的结直肠癌筛选方法主要是结肠镜检查,另外还有活体组织检查和脱落细胞学检查,这几种检查方法都是侵入式的,尤其是脱落细胞学检查取材繁琐,不易获得满意的标本,临床应用少。所以如果没有表现出相关症状,很多人并不愿意去做结直肠癌的早期筛查。
因此,针对结直肠癌的早期诊断和筛查,还需要进一步改进。
发明内容
本发明旨在至少在一定程度上解决相关技术中的技术问题之一。为此,本发明的一个目的在于提出一种结直肠癌肿瘤标志物、引物对、试剂盒以及结直肠癌的检测方法。本发明提供的结直肠癌肿瘤标志物能够用于结直肠癌病人的早期筛查和诊断。
本发明是基于发明人的如下发现所获得的:
人体肠道微生物组包含了数量巨大的微生物,它们参与食物药物代谢、人体免疫调节,在保持人体健康中起着极其重要的作用。有大量文献报道具核梭杆菌与结直肠癌有很强的相关性,研究疾病的不同阶段中微生物组成分的改变能够作为一种新的用于癌症诊断及预后效果测试的手段:因此本发明想通过测定肠道中具核梭杆菌的特定基因,来对结直肠癌的发生与发展进行早期检测和及时干预治疗。
本发明在有case-control的人群中对具核梭杆菌的特异性基因进行定量PCR(qPCR)检测,确定基因的量,分析并验证这些基因预测结直肠癌的概率。以开发结直肠癌患者的肠道微生物基因检测试剂盒,为广大人群提供快速简便的结肠癌早期筛查、诊断的有效措施。为实现结直肠癌的早期预警、诊断和干预提供依据。
具体而言,本发明提供了如下技术方案:
根据本发明的第一方面,本发明提供了一种结直肠癌标志物,所述标志物包括选自下列中的至少一种:SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:5,来源于具核梭杆菌且与所述SEQ IDNO:1~SEQ ID NO:5中的任意一种具有95%以上同源性的核酸序列。研究表明,具核梭杆菌与结直肠癌有着很强的相关性,本发明通过利用宏基因组测序研究,筛选了具核梭杆菌中与结直肠癌相关性强的特定核酸序列,作为结直肠癌检测的标志物,能够用于结直肠癌的早期诊断和筛查。所述结直肠癌标志物可以为SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:5中的任意一种,也可以是来源于具核酸杆菌且与所述SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:5中的任意一种具有95%以上同源性的核酸序列,优选为具有99%以上同源性的核酸序列。通过这些标志物可以用来反映结直肠癌的情况。
根据本发明的第二方面,本发明提供了一组引物对,所述引物对能够特异性扩增本发明第一方面所述的标志物中的至少之一,所述引物对选自SEQ ID NO:6~SEQ ID NO:35中的任意一对。其中SEQ ID NO:6~SEQ ID NO:35中每两个相邻编号的核酸序列为一对。通过这些引物对,能够特异性扩增SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:5中的任意一种,从而可以用作结直肠癌的早期诊断和检测。
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