[发明专利]用于鉴定甘蓝根肿病抗性的分子标记、引物及其应用有效
申请号: | 201810585638.4 | 申请日: | 2018-06-08 |
公开(公告)号: | CN108588264B | 公开(公告)日: | 2021-05-28 |
发明(设计)人: | 宋洪元;司军;何海燕;李勤菲;任雪松 | 申请(专利权)人: | 西南大学 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 重庆华科专利事务所 50123 | 代理人: | 康海燕 |
地址: | 400715*** | 国省代码: | 重庆;50 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 鉴定 甘蓝 根肿病 抗性 分子 标记 引物 及其 应用 | ||
1.用于鉴定甘蓝根肿病抗性的分子标记CCR-SCAR1,其特征在于,CCR-SCAR1的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示。
2.权利要求1所述分子标记的PCR特异性扩增引物对CCR1,其特征在于,CCR1的上游引物F-CCR1的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示,CCR1的下游引物R-CCR1的核苷酸序列如SEQID No.4所示。
3.用于鉴定甘蓝根肿病抗性的分子标记CCR-SCAR2,其特征在于,CCR-SCAR2的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示。
4.权利要求3所述分子标记的PCR特异性扩增引物对CCR2,其特征在于,CCR2的上游引物F-CCR2的核苷酸序列如SEQ ID No.5所示,CCR2的下游引物R-CCR2的核苷酸序列如SEQID No.6所示。
5.鉴定甘蓝根肿病抗性中的方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
(1)以待鉴定材料的基因组DNA为模板,利用引物对CCR1或引物对CCR2进行PCR扩增获得扩增产物;引物对CCR1的核苷酸序列如SEQ ID No.3和SEQ ID No.4所示;引物对CCR2的核苷酸序列如SEQ ID No.5和SEQ ID No.6所示;
(2)将扩增产物进行电泳分离,若存在401bp或355bp条带,则待鉴定材料具有根肿病抗性,若不存在条带,则待鉴定材料不具有根肿病抗性;所述401bp的条带为引物对CCR1扩增得到的分子标记CCR-SCAR1,CCR-SCAR1的核苷酸序列如SEQ ID No.1所示;所述355bp的条带为引物对CCR2扩增得到的分子标记CCR-SCAR2,CCR-SCAR2的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示。
6.如权利要求5所述方法,其特征在于,利用引物对CCR1或引物对CCR2进行PCR扩增的反应体系如下所示:所述反应体系总体积25μL,其中,浓度100 ng/μL的模板3.0 μL;浓度10μM的引物对CCR1或CCR2 1.0 μL;浓度100 mM的dNTP 0.5 μL;含Mg2+ 的10×Taq 缓冲液2.5μL;浓度5 U/μL的Taq DNA 聚合酶0.2 μL;dd H2O补足25 μL。
7.如权利要求6所述方法,其特征在于,利用引物对CCR1进行PCR扩增的程序为:95℃3min;95℃ 30s、62℃ 30s、72℃ 30s,循环7次;95℃ 30s 、58.5℃ 30s、72℃ 30s,循环22次;72℃ 10min;扩增完成后4℃保存。
8.如权利要求6所述方法,其特征在于,利用引物对CCR2进行PCR扩增的程序为:95℃3min;95℃ 30s、55℃ 30s、72℃ 30s,循环28次;72℃ 10min;扩增完成后保存在4℃条件下。
9.权利要求1所述分子标记CCR-SCAR1或/和权利要求2所述引物对CCR1在鉴定甘蓝根肿病抗性中的应用。
10.权利要求3所述分子标记CCR-SCAR2或/和权利要求4所述引物对CCR2在鉴定甘蓝根肿病抗性中的应用。
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