[发明专利]用于荧光PCR检测的DNA快速提取方法和亚甲基四氢叶酸还原酶基因多态性的检测方法在审
申请号: | 201810561497.2 | 申请日: | 2018-06-04 |
公开(公告)号: | CN108715887A | 公开(公告)日: | 2018-10-30 |
发明(设计)人: | 陈雯雯;郑佳莹;刘晓蕾;陈永欣 | 申请(专利权)人: | 深圳大学 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12Q1/6858;C12Q1/6883 |
代理公司: | 厦门市精诚新创知识产权代理有限公司 35218 | 代理人: | 秦华 |
地址: | 518060 广东省深*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 荧光PCR检测 快速提取 亚甲基四氢叶酸还原酶基因 次孵育 多态性 检测 荧光定量PCR检测 临床应用 省时高效 裂解液 灵敏度 特异型 全血 样本 | ||
本发明公开了用于荧光PCR检测的DNA快速提取方法和亚甲基四氢叶酸还原酶基因多态性的检测方法。用于荧光PCR检测的DNA的快速提取方法为取检测样本全血加入裂解液;52‑57℃下第一次孵育;92‑98℃下第二次孵育;然后离心即得到待检DNA;然后进行荧光定量PCR检测即可。本发明方法操作简单,省时高效,特异型强、灵敏度高、稳定性好,适用于大规模的临床应用。
技术领域
本发明涉及多态性检测领域,尤其涉及用于荧光PCR检测的DNA快速提取方法和亚甲基四氢叶酸还原酶基因多态性的检测方法。
背景技术
亚甲基四氢叶酸还原酶(5,10-methylenetetrahydrofolate reductase,MTHFR),是叶酸-甲硫氨酸代谢过程中的重要酶之一,它能使血液中的同型半胱氨酸(Hcy)维持在较低的水平。MTHFR在677位点有三种基因分型:野生型CC、杂合突变型CT和纯合突变型TT。该位点发生突变,可能会使酶活性降低,影响叶酸代谢,导致血液中Hcy水平升高,从而引发心血管疾病、脑血管疾病等。因此对于高危人群,如原发性高血压患者、伴有同型半胱氨酸升高的高血压患者、伴有高血脂和高血糖等危险因素的高血压患者、已经发生心脑血管疾病的患者、有心脑血管疾病家族史的人群、孕妇等进行MTHFR C677T基因多态性的检测,能够预防心血管疾病、脑血管疾病的发生,对于判断高血压种类以及后续用药指导都具有重要意义。也可指导孕妇合理补充叶酸,预测唇腭裂、唐氏综合症、神经管缺陷等新生儿出生缺陷,适用于正常夫妇生育前预防性检测。然而,传统的MTHFR检测方法都需要对DNA进行纯化,而DNA纯化过程又十分繁琐,耗费的人力、物力、资源巨大,而且会有样本间交叉污染的问题。
发明内容
本发明的目的在于提供一种省时高效,特异型强、灵敏度高、稳定性好,适用于大规模的临床应用的亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因多态性的检测方法。
为实现上述目的,本发明提供一种用于荧光PCR检测的DNA的快速提取方法,其特征在于,取检测样本全血加入裂解液;52-57℃下第一次孵育;92-98℃下第二次孵育;然后离心即可。
进一步,所述裂解液配方为5~100mM的Tris-HCl,1~50mM的EDTA,0.01~0.5%w/v的表面活性剂,50~250μg的蛋白酶K,20~200mM的氯化铵,10~200mM的氯化钠,pH值为6.5~8.5;优选的,表面活性剂为SDS或NP-40或Brj-35;
任选的,检测样本全血与裂解液的体积比为1:(8~15);优选的,检测样本全血与裂解液的体积比为1:(8~12);更优选的,检测样本全血与裂解液的体积比为1:11。
进一步,所述第一次孵育的温度为53~56℃;优选的,第一次孵育的温度为55℃;
任选的,所述第一次孵育的时间为8~12分钟;优选的,第一次孵育的时间为10分钟;
所述第一次孵育的温度为93~97℃;优选的,第一次孵育的温度为95℃;
任选的,第二次孵育的时间为3~8分钟;优选的,第二次孵育的时间为5分钟;
任选的,离心的时间为0.5~2分钟;优选的,离心的时间为1分钟。
本发明还提供一种亚甲基四氢叶酸还原酶基因多态性的检测方法,其特征在于,采用上述方法提取DNA后进行荧光定量PCR检测。
进一步,所述荧光定量PCR的引物和探针为SEQ ID NO:1-4所示序列;
任选的,所述荧光定量PCR的20μL反应体系为:10μL的2×TaqMan Fast AdvancedMaster Mix、浓度为300nM的引物、浓度为250nM的探针、2μL待测样本,余量为无菌水;
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