[发明专利]一种DNA的文库定量及测序方法在审
申请号: | 201810484121.6 | 申请日: | 2018-05-19 |
公开(公告)号: | CN108504724A | 公开(公告)日: | 2018-09-07 |
发明(设计)人: | 张青;何媛 | 申请(专利权)人: | 长沙金域医学检验所有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851;C12Q1/6869 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 410000 湖南省长沙市高新开发区麓天路*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 测序 样本 核对 冰盒 上机 文库 定量检测结果 劳动效率 振荡混合 振荡混匀 乳液PCR 低吸附 稀释 分装 耗材 水中 融化 金属 便利 检测 灵活 制作 申请 | ||
1.一种DNA的文库定量及测序方法,其特征在于,包括:
步骤一:做处理表单、样本和试剂耗材准备;
步骤二:根据定量表找出对应的样本,按顺序排列;准备1.5ml低吸附管,加入499uINF水,核对编号及NF水量;融化的样本振荡混合均匀,瞬离至管底,加1uL样本至499uLNF水中,核对管号,振荡混匀稀释完的样本,瞬时离心;在冰盒上配MIX,并分装18uLMIX到放置在金属冰盒上的0.2mlPCR板中;核对好编号,吸取2uL样本到18ulMIX中;封好膜后离心2min,放入荧光定量PCR仪中进行检测;
步骤三:根据所述步骤二中的定量检测结果,制作上机表单,同一个pooling表上不能存在相同标签,选择合适的pooling混合体积,进行pooling;乳液PCR1平衡融化后振荡离心,依次加入80uLNF水,乳液PCR酶120uL,振荡1min混匀的微珠溶液100uL,稀释混匀后的pooling文库100uL;混匀乳液PCR混合溶液,枪调800ul,分三次加入FILTER中,剩余样本离心后用200ul枪加入到FILTER中,加200ul隔离油;选择好程序PROTON-HQ-200KIT程序,进行乳液PCR;
步骤四:OT下机处理,首先进行10分钟钟离心;2C1磁珠室温平衡30min,水洗测序仪,0T下机处理,OT下机离心好的样本对着非沉淀处吸至剩余150ul样本,把剩余样本吹匀转到1.5ml低吸附管中;加入200uNF水至收集管中,冲洗管壁,重复冲洗次,振荡收集到的样本,15500rcf离心8分钟;观察是否有沉淀,留100ul样本,加900uINF水,振荡,15500rcf离心8分钟;留20ul样本加80ul模板垂悬液,振荡并瞬时离心;
步骤五:将样本模板和试剂等按照操作流程表依次加入八连管中;下ES后15500rcf5min,留10uL,加200uLNF水,振荡混匀,15500rcf5min,留10uL加90uLNF水,振荡4℃保存备用;
步骤六:加5uL质控微珠,混匀15500rcf5min,留10uL加15uL退火缓冲液,20uL测序引物振荡瞬离,退火;加10uL上样缓冲,混匀,瞬离;清洗芯片,使用NF水清洗3次,异丙醇清洗3次,清洗进样孔,N2吹干;Loading样本,离心10min,按照操作流程表进行配液,吹泡泡、清洗后加酶65UL孵育5min,选择对应的plan,进行上机测序。
2.根据权利要求1所述的DNA的文库定量及测序方法,其特征在于,所述步骤二中还包括:①表单处理核对样本编号和标签号,重复标签样本高亮显示;NF水加过后对比每管的液体体积,液面高度一致;分装液体体积为每孔18uL,加模板时注意核对每管样本的重复孔数;定量结果复孔差异大的需要重定量。
3.根据权利要求2所述的DNA的文库定量及测序方法,其特征在于,还包括以下注意事项:OT下机处理时珠子在有柄柄的一侧,吸取残液时注意枪头位置;
ES时观察枪头是否有C1和珠子络合的现象;
ES时注意八连排管的方向,检查是否放置收集用的离心管;
Loading时注意观察是否有气泡残留,如有需要多冲洗一次。
4.根据权利要求3所述的DNA的文库定量及测序方法,其特征在于,所述步骤四还包括:离心的8miin需要准备ES富集需要的试剂和耗材,清洗C1磁珠,开启ES仪。
5.根据权利要求1所述的DNA的文库定量及测序方法,其特征在于,所述步骤一具体包括:选取已建库未定量样本,重上机样本,需重定量的样本加入定量表,原则上一张定量表上不能出现超过两个的标签重复;找出待定量的样本,融化备用;定量试剂放置4℃C冰箱融化。
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