[发明专利]人类肠道病毒71型实时荧光恒温扩增核酸检测方法在审

专利信息
申请号: 201810018560.8 申请日: 2018-01-09
公开(公告)号: CN108103244A 公开(公告)日: 2018-06-01
发明(设计)人: 杨帆;徐建军;阮伟;孙艳丽;曹丙春;李晋;刘万建 申请(专利权)人: 青岛汉唐生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/6844;C12R1/93
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 266000 山东省青*** 国省代码: 山东;37
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摘要:
搜索关键词: 人类肠道病毒71型 预处理 核酸检测 恒温扩增 实时荧光 荧光定量PCR仪 粪便样本 恒温反应 判读结果 引物序列 荧光信号 测样液 核酸 分装 混匀 时长 引物 配制 采集 检测 重复
【权利要求书】:

1.一种人类肠道病毒71型实时荧光恒温扩增核酸检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

S1、采集粪便样本并进行预处理,其间加入RNA提取液,且预处理完成获得待测样液;

S2、设定引物序列,并使用对应的引物配制反应体系,充分混匀后分装并顺序加入RNA样本核酸2μL,盖紧反应管管盖,瞬离使液体集中在管底;

S3、使用荧光定量PCR仪进行恒温反应,并设置反应温度为60-65℃,时长1min,重复30-60个循环,于60-65℃每分钟末收集荧光信号,并判读结果。

2.根据权利要求1所述的人类肠道病毒71型实时荧光恒温扩增核酸检测方法,其特征在于,步骤S1分解为以下步骤:

S11、取液态样本各100μL放置于1.5mL灭菌离心管,加入100-800μL TrizoL试剂及50-200μL氯仿,用振荡器震荡20s后静置3min,12000rpm离心1-5min;

S12、吸取上层液体转移至新的1.5mL离心管中,加入10-100μL RNA提取液,振荡混匀后8000rpm离心1min,沉淀并去除液体;

S13、加入100-400μL75%无水乙醇,振荡混匀后以8000rpm离心1min,沉淀并去除液体;

S14、将装有沉淀颗粒的离心管风干5-30min后,加入50μL DEPC H2O,移液器吹打混匀所述沉淀颗粒,得到白色的混悬液待用。

3.根据权利要求1或2所述的人类肠道病毒71型实时荧光恒温扩增核酸检测方法,其特征在于,所述RNA提取液包含酸性二氧化硅。

4.根据权利要求2所述的人类肠道病毒71型实时荧光恒温扩增核酸检测方法,其特征在于,在步骤S11中,液态样本是由水样粪便样本混匀,或较干粪便样本加入生理盐水得到,且不足100μL时补加生理盐水重悬。

5.根据权利要求2所述的人类肠道病毒71型实时荧光恒温扩增核酸检测方法,其特征在于,在步骤S14中,将装有沉淀颗粒的离心管风干5-30min,或用开放式加热器于60℃干燥5min。

6.根据权利要求2所述的人类肠道病毒71型实时荧光恒温扩增核酸检测方法,其特征在于,在步骤S14中,白色的混悬液直接用于检测,或存于-70℃待用。

7.根据权利要求1所述的人类肠道病毒71型实时荧光恒温扩增核酸检测方法,其特征在于,在步骤S2中,反应体系对应配比为:10X IsothermaL AmpLication Buffer、2.5μL;dNTP Mix(10mM)、3-4μL;MgSO4(100mM)、0.1-2μL;FIP/BIP Primers(20μM)、0.5-2.5/0.5-2.5μL;F3/B3 Primers(10μM)、0.1-1/0.1-1μL;LF/LB Primers(10μM)、0.1-1/0.1-1μL;Bst2.0 Warmstart DNA PoLymerase、0.1-2μL;Warmstart RTx Reverse Transcriptase、0.1-2μL;EVA Green、0.1-2μL;补充DEPC H2O至23μL。

8.根据权利要求1所述的人类肠道病毒71型实时荧光恒温扩增核酸检测方法,其特征在于,在步骤S3中,使用ABI stepone荧光定量PCR仪,且选用SYBR通道。

9.根据权利要求1所述的人类肠道病毒71型实时荧光恒温扩增核酸检测方法,其特征在于,在步骤S3中,判读结果的依据为:阳性质控呈“S”型扩增曲线,阴性质控无“S”型扩增曲线,且同一次实验两者需同时满足;若待检样本呈“S”型或不完全“S”型扩增曲线,则判样本为EV71阳性;若待检样本无“S”型扩增曲线,则判样本为EV71阴性。

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