[发明专利]一种基于DNA折纸术和纳米金属颗粒荧光探针的分子逻辑门有效
申请号: | 201711448514.3 | 申请日: | 2017-12-27 |
公开(公告)号: | CN108320023B | 公开(公告)日: | 2021-02-19 |
发明(设计)人: | 杨静;张成;陈奎廷 | 申请(专利权)人: | 华北电力大学 |
主分类号: | G06N3/12 | 分类号: | G06N3/12 |
代理公司: | 北京众合诚成知识产权代理有限公司 11246 | 代理人: | 陈波 |
地址: | 102206 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 dna 折纸 纳米 金属 颗粒 荧光 探针 分子 逻辑 | ||
1.一种基于DNA折纸术和纳米金属颗粒荧光探针的分子逻辑门,所述逻辑门包括:输入信号、信号转化器和输出信号,其特征在于,所述信号转化器包括:DNA Origami,位于DNAOrigami上的切割链和纳米金属颗粒,以及纳米金属颗粒表面与切割链识别并连接的荧光链;
所述切割链为DNA单链;
所述荧光链为一端含有荧光基团的DNA单链,所述DNA单链未固定的一端含有酶切位点;所述荧光链的另一端通过巯基化固定在纳米金属颗粒表面;
所述荧光链的具有酶切位点的一段与切割链远离DNA Origami的一端完全互补;
所述输入信号包括蛋白酶;所述蛋白酶特异性识别所述酶切位点,将酶切位点切开,使得荧光基团从纳米金属颗粒表面释放;
所述输出信号为荧光基团的释放;所述DNA Origami整体呈凹型哑铃状,其横切面为蜂巢结构;所述切割链位于DNA Origami“哑铃”两端的凹槽侧面上;所述纳米金属颗粒固定在DNA Origami“哑铃”的凹槽部位。
2.根据权利要求1所述的分子逻辑门,其特征在于,所述纳米金属颗粒为纳米金颗粒或纳米银颗粒。
3.根据权利要求1所述的分子逻辑门,其特征在于,所述荧光链的酶切位点与巯基之间有3-4个胸腺嘧啶脱氧核糖核苷酸。
4.根据权利要求1所述的分子逻辑门,其特征在于,所述分子逻辑门为与门,所述信号转化器还包括A链,所述A链为DNA单链,A链与切割链远离DNA Origami的一端部分互补;所述输入信号还包括A’链,所述A’链为DNA单链,A’链与A链完全互补。
5.根据权利要求1所述的分子逻辑门,其特征在于,所述分子逻辑门为或门,所述信号转化器包括切割链1和切割链2;所述荧光链包括荧光链1和荧光链2;所述荧光链1的具有酶切位点的一段与切割链1远离DNA Origami的一端完全互补;所述荧光链2的具有酶切位点的一段与切割链2远离DNA Origami的一端完全互补。
6.根据权利要求1所述的分子逻辑门,其特征在于,所述分子逻辑门为三输入逻辑门,所述切割链两端分别具有E区和e区,E-e区域互补,使切割链形成茎环结构;所述切割链E区域的下游为F区域,切割链e区域的下游为d区域;所述输入信号还包括B链和B’链;所述B链和B’链为DNA单链,B链由f、e、d区域组成,B’链由D、E、F区域组成,B链和B’链完全互补;所述B链的f、e区域与切割链E、F区域完全互补;所述B’链D、E区域与切割链e、d区域完全互补,相同字母大小写对应区域完全互补。
7.一种基于DNA折纸术和纳米金属颗粒荧光探针的分子逻辑门,其特征在于,所述逻辑门为与门,包括:输入信号、信号转化器和输出信号;
所述信号转化器包括:DNA Origami,位于DNA Origami上的切割链和纳米金属颗粒,A链,以及纳米金属颗粒表面与切割链识别并连接的荧光链;
所述切割链为DNA单链;
所述A链为DNA单链,A链与切割链远离DNA Origami的一端部分互补;
所述荧光链为含有荧光基团的DNA单链,所述DNA单链未固定的一端含有酶切位点;所述荧光链的DNA单链另一端通过巯基化固定在纳米金属颗粒表面;
所述荧光链的具有酶切位点的一段与切割链远离DNA Origami的一端完全互补;
所述荧光链的酶切位点与巯基之间有3-4个胸腺嘧啶脱氧核糖核苷酸;
所述输入信号为蛋白酶、A’链或其混合;所述A’链为DNA单链,A’链与A链完全互补;所述蛋白酶特异性识别所述酶切位点,将酶切位点切开,使得荧光基团从纳米金属颗粒表面释放;
所述输出信号为荧光基团的释放;
所述DNA Origami整体呈凹型哑铃状,其横切面为蜂巢结构;所述切割链位于DNAOrigami“哑铃”两端的凹槽侧面上;所述纳米金属颗粒固定在DNA Origami“哑铃”的凹槽部位。
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