[发明专利]一种检测辣椒脉斑驳病毒专用引物及其检测方法有效
申请号: | 201711325020.6 | 申请日: | 2017-12-13 |
公开(公告)号: | CN107937609B | 公开(公告)日: | 2020-06-02 |
发明(设计)人: | 杨彩霞;高芳銮;付晶晶;韩彤;廖一鸣;李梁;侯秋实;石长玉 | 申请(专利权)人: | 沈阳大学 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 沈阳技联专利代理有限公司 21205 | 代理人: | 赵越 |
地址: | 110044 辽*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 检测 辣椒 斑驳 病毒 专用 引物 及其 方法 | ||
1.一种检测辣椒脉斑驳病毒的专用引物,其特征在于,所述引物的序列具体为:
上游引物:ChiVMV-CP-F:如SEQ ID NO.1 所示,即,5’- GCACCATACATTTCAGAAACAGC-3’,
下游引物:ChiVMV-CP-R:如SEQ ID NO.2 所示,即,5’- GAACCACACTGAAGAATATGRATG-3’,
所述的引物PCR扩增的产物如SEQ ID NO.3所示。
2.一种检测辣椒脉斑驳病毒方法,其特征在于,所述方法包括如下步骤:
(1)提取待检测龙葵和番茄样品的总RNA,备用;总RNA的提取方法如下:
采用TRIzol法对植物病叶的总RNA进行提取,实验步骤按照说明书进行:
称量花叶重症样品,于液态氮气中研磨至完全粉碎,转移Eppendorf管中;
立即加入TRIzol,室温放置以裂解细胞;离心15 min;
取上清液,加入等体积三氯甲烷混合旋涡振荡,室温下静置;离心15 min;
取上清液,加入体积异丙醇,混合均匀冷藏;离心15 min;
弃上清,用无水乙醇洗涤沉淀;离心15 min;
弃上清,室温干燥,加入RNase-free H2O溶解,冰上备用,-80℃冻存;
(2)依据TIANScript RT Kit cDNA第一条链合成试剂盒进行反转录;以cDNA为模板进行PCR扩增;
混合均匀,42℃温浴,反应结束后于95℃下温浴以终止反应,待温度降至室温后加入RNase-Free ddH2O稀释备用;
其中,PCR引物如权利要求1所示;
PCR扩增时采用25μL体系,体系设计如下:
cDNA,3μl;
上游引物,1μl;
下游引物,1μl;
dNTP,1μl;
10*Taq Buffer,2.5μl;
Taq,0.2μl;
补灭菌水至25μl;
反应程序为:95℃预变性5min,94℃变性30s,54℃退火40s,72℃延伸40s,实验进行40个循环,72℃终延伸7min;
(3)对(2)中的PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳检测,得到阳性条带,目的条带大小为1,103bp,经测序后进行Blast比对,表明样品中含有辣椒脉斑驳病毒;
(4)为进一步确定样品是否受到辣椒脉斑驳病毒侵染,将(3)中待检测PCR 产物样品进行回收,回收产物直接与PMD20-T载体进行连接,转化到DH-5α菌株中培养,挑取单菌落进行菌液复苏,并对复苏后的菌液进行菌液PCR初步鉴定,对阳性菌株进行进一步测序,依据测序结果进行比对,进一步确定样品是否被辣椒脉斑驳病毒侵染。
3.根据权利要求2所述的一种检测辣椒脉斑驳病毒方法,其特征在于,
cDNA第一条链合成的体系如下:
2μl M4-T18;
2μl Super Pure dNTPs,其浓度为2.5mmol;
3μl RNA;
补RNase-Free ddH2O至14.5μl;
4μl 5×First-Strand buffer;
0.5μl RNase抑制剂,其浓度为20 U•μL-1;
1μl TIANScript M-MLV反转录酶,其浓度为200U•L-1。
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