[发明专利]检测饮用水中四种致病菌的四重荧光PCR引物组、探针组、试剂盒及方法有效
申请号: | 201711126058.0 | 申请日: | 2017-11-15 |
公开(公告)号: | CN108004334B | 公开(公告)日: | 2020-05-26 |
发明(设计)人: | 孙端方;罗绍楠;左泽彦;董睿;李春宇;田志强;张谦;黄家瑞 | 申请(专利权)人: | 贵州省产品质量检验检测院 |
主分类号: | C12Q1/689 | 分类号: | C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/10;C12Q1/04;C12N15/11 |
代理公司: | 广州瑞之凡知识产权代理事务所(普通合伙) 44514 | 代理人: | 黄爱君 |
地址: | 550016 贵*** | 国省代码: | 贵州;52 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 饮用 水中 致病菌 荧光 pcr 引物 探针 试剂盒 方法 | ||
1.检测饮用水中四种致病菌的四重荧光PCR引物组,其特征在于:包括针对大肠菌群、粪链球菌、铜绿假单胞菌、产气荚膜梭菌的四对引物:大肠菌群的上游引物为Seq.ID No.1,下游引物为Seq.ID No.2;粪链球菌的上游引物为Seq.ID No.3;下游引物为Seq.ID No.4;铜绿假单胞菌的上游引物为Seq.ID No.5;下游引物为Seq.ID No.6;产气荚膜梭菌的上游引物为Seq.ID No.7;下游引物为Seq.ID No.8。
2.检测饮用水中四种致病菌的四重荧光PCR探针组,其特征在于:包括针对大肠菌群、粪链球菌、铜绿假单胞菌、产气荚膜梭菌的四重荧光PCR探针组:大肠菌群的探针为Seq.IDNo.9,5’端用FAM荧光激发基团修饰;粪链球菌的探针为Seq.ID No.10,5’端用VIC荧光激发基团修饰;铜绿假单胞菌的探针为Seq.ID No.11,5’端用NED荧光激发基团修饰;产气荚膜梭菌的探针为Seq.ID No.12,5’端用Cy5荧光激发基团修饰,所述探针3’端分别用NFQ-MGB荧光淬灭基团修饰。
3.检测饮用水中四种致病菌的四重荧光PCR试剂盒,其特征在于:包括权利要求1所述的PCR引物组、权利要求2所述的PCR探针组、荧光PCR试剂、阳性对照、阴性对照。
4.根据权利要求3所述的检测饮用水中四种致病菌的四重荧光PCR试剂盒,其特征在于:所述阳性对照为用权利要求1所述的引物组进行扩增,并用权利要求2所述的探针组检测的混合DNA片段或基因组,浓度为105copies/μL级。
5.根据权利要求3所述的检测饮用水中四种致病菌的四重荧光PCR试剂盒,其特征在于:所述阴性对照为所述四种致病菌以外的细菌DNA。
6.根据权利要求3所述的检测饮用水中四种致病菌的四重荧光PCR试剂盒,其特征在于:所述大肠菌群、粪链球菌、铜绿假单胞菌、产气荚膜梭菌的上游引物、下游引物和探针的浓度均为10μmol/L。
7.检测饮用水中四种致病菌的四重荧光PCR方法,其特征在于:包括如下步骤:
①将水样过0.22μm滤膜,洗脱滤膜富集微生物并提取DNA,或将滤膜置于待测致病菌选择培养基增菌后提取DNA;
②建立包括权利要求1所述的PCR引物组和权利要求2所述的PCR探针组的四重荧光PCR反应体系,反应条件为:95℃ 20s–2min或10–15min;95℃ 5–60s,60℃ 20s–2min;40cycle并收集荧光信号。
8.根据权利要求7所述的检测饮用水中四种致病菌的四重荧光PCR方法,其特征在于:所述检测结果的判断包括:
①质控标准:阳性对照的FAM、VIC、NED、Cy5均有荧光对数增长,且Ct值≤30.0,阴性对照和空白对照均无荧光信号和荧光对数增长,Ct值≥40.0,可进行②的致病菌检测;
②结果判定:水样的FAM或/和VIC或/和NED或/和Cy5有荧光对数增长,且Ct值≤30.0时,则含有相应的大肠菌群或/和粪链球菌或/和铜绿假单胞菌或/和产气荚膜梭菌;若上述一种或多种荧光无信号及对数增长,且Ct值≥40.0,则不含相应的致病菌;若30.0Ct值40.0时,增加模板量复检,如果Ct值≥40.0,则检测结果为阴性,如果Ct值40.0,则检测结果为阳性。
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