[发明专利]一个NF‑κB1基因插入/缺失多态性位点在制备检测丙型肝炎易感性产品中的应用

说明书

技术领域

本发明涉及生物医药领域，特别是一种人基因组中NF-κB通路的NF-κB1基因rs28362491插入/缺失多态性位点在制备检测丙型肝炎易感性产品中的应用。

背景技术

基因多态性(genetic polymorphism)是指在一个生物群体的基因水平上，在同一位置存在一种以上的基因变异，不同的基因变异形式称为基因型(genotype)或等位基因(allele)。基因多态性包括以下几种：单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)、插入/缺失(insertion/deletion,InDel或I/D)多态性、DNA重复序列多态性。SNP指的是单个核苷酸突变而引起的核酸序列的改变。InDel多态性指的是基因组中特定DNA片段的插入或缺失，它和SNP多态性都是二等位基因遗传标记。根据DNA片段的大小，InDel多态性可分为以下五类：(1)1个碱基对(base pairs,bps)的InDel；(2)单一bp的InDel；(3)以2-15bps为重复单元的多bps的InDel；(4)转座子InDel；(5)任意DNA序列的InDel。InDel多态性可能导致功能蛋白的异常表达，进而与生物体的生理健康或疾病有关。人类基因组的各种多态性导致了不同种族、人群的染色体基因组具有多样性，也导致了人体对疾病的易感性、病程进展、转归，及药物治疗效果存在差异。目前InDel多态性已被视为一种遗传标记，可用于研究遗传变异与人类疾病的关系。

丙型病毒性肝炎是一种由丙型肝炎病毒(HCV)感染引起的病毒性肝炎。全球共有1.85亿HCV感染者，中国的HCV感染率约为1.6％，输血、注射吸毒、器官移植和血液透析已经成为国内主要的HCV传播途径。HCV急性感染可有两种不同的结局：病毒自限性清除和持续性感染。自限性清除者指的是HCV感染人体后，机体未经治疗、在感染后的12个月内自动清除HCV，从而免于持续性感染，表现为HCV RNA阴性，HCV抗体阳性。持续性感染指的是HCV感染人体后，机体未经治疗、在感染后的12个月内不能清除HCV，表现为HCV RNA阳性，HCV抗体阳性。超过70％的HCV感染者可发展为持续性感染，其中一部分患者还可能发展成为肝硬化、肝细胞肝癌(HCC)。

HCV感染者的病情发展和转归可受多种因素可影响，包括病毒、宿主免疫和遗传因素。在过去几年中，在全球多项大型临床试验中，新的直接抗病毒药物(direct-acting antiviral agents,DAAs)将慢性丙肝的治愈率显著提高到95％以上，已成为传统的聚乙二醇干扰素+利巴韦林治疗方案的更优选择。然而，随着DAAs药物的应用，不断有新问题涌现：HBV/HCV合并感染者使用DAA药物可致HBV再激活；在部分获得持续性病毒应答(SVR)的肝硬化患者中，DAAs的应用并不能降低HCC的发生率；DAAs治疗还可导致耐药的发生，目前已确认的耐药相关突变(resistance associated variants,RAVs)位点包括NS3/4A靶点相关、NS5A靶点相关和NS5B靶点相关的几十个RAVs。

考虑到阻止HCV传播的首要问题是筛查、识别易感人群。因此，进行中国人群遗传背景与HCV感染的关系的研究，对于深入探索遗传因素在丙肝病程进展的作用机制，为及时、有效防控丙肝流行提供有效的靶点、工具及理论基础，具有重要的现实意义。

NF-κB是核转录因子，具有和某些基因上启动子区的特定核苷酸序列结合而启动基因转录、调节细胞增殖、凋亡、炎症过程及免疫应答的功能。NF-κB可被细菌/病毒抗原、细胞因子等许多刺激物激活，继而调节150多种基因的表达。NF-κB/ReL家族成员有c-ReL、NF-κB1(P50)、NF-κB2(P52)、RelA(P65)、ReLB。这些蛋白都有一个大约由300个氨基酸组成的氨基末端，称为ReL同源区，包括DNA结合部位、二聚体化部位及与NF-κB抑制蛋白(IκB)结合位点。有活性的DNA结合的NF-κB是P50与P65二聚体。ReL蛋白成员间可形成同源或异源二聚体，不同的NF-κB/ReL蛋白二聚体具有不同的结合序列，而且各有特性，不同二聚体可识别不同的DNA靶目标，而对不同调节基因的表达能力得以提高。NF-κB蛋白P50/P65、P50/c-ReL、P65/c-ReL复合体具有转录激活作用，而P50/P50和P52/P52同源二聚体则具有转录抑制作用。