[发明专利]一种鉴别阿拉伯鱚与印度鱚的分子标记引物及方法在审
申请号: | 201710888950.6 | 申请日: | 2017-09-27 |
公开(公告)号: | CN107858436A | 公开(公告)日: | 2018-03-30 |
发明(设计)人: | 杨天燕;陈治;高天翔;韩志强 | 申请(专利权)人: | 浙江海洋大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 杭州浙科专利事务所(普通合伙)33213 | 代理人: | 吴秉中 |
地址: | 316000 浙江省舟山市普陀海*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 鉴别 阿拉伯 印度 分子 标记 引物 方法 | ||
1. 一种鉴别阿拉伯鱚与印度鱚的方法,其特征在于:所述过程为:将提取所得DNA序列与分子标记SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4比对,分子标记SEQ ID NO.3为:CAGGCATGGTGGGCACCGCCCTGAGCTTGCTGATCCGAGCAGAACTTAGCCAACCCGGCGCTCTACTTGGAGACGATCAAATTTACAACGTCATTGTTACGGCACACGCCTTTGTAATAATTTTCTTTATAGTAATACCAATTCTAATTGGAGGCTTTGGGAACTGACTAGTTCCGCTTATGATCGGAGCCCCTGACATGGCATTCCCTCGAATGAATAACATGAGCTTCTGACTCCTGCCCCCTTCTTTCCTTCTCCTCTT;分子标记SEQ ID NO.4为:CAGGCATAGTGGGCACGGCCCTAAGCCTGCTAATCCGAGCAGAACTCAGCCAACCCGGCGCTCTGCTTGGTGATGACCAGATCTATAATGTTATCGTTACTGCACATGCCTTTGTAATGATTTTCTTTATAGTAATACCAATTTTAATCGGTGGCTTCGGAAACTGATTAGTTCCGCTAATGATCGGGGCGCCCGATATGGCATTCCCCCGGATAAATAATATGAGCTTCTGGCTTTTACCCCCTTCTTTCCTACTCCTCTT。
2.根据权利要求1所述的一种鉴别阿拉伯鱚与印度鱚的方法,其特征在于:所述分子标记的获取方法为:用标准酚-氯仿法提取阿拉伯鱚基因组总DNA和印度鱚基因组总DNA,以总DNA为模板,以引物进行PCR扩增,对扩增结果进行纯化、测序。
3. 根据权利要求2所述的一种鉴别阿拉伯鱚与印度鱚的方法,其特征在于:所述PCR扩增反应过程为:将2.5μL 10×buffer、2μL dNTPs、0.15uL rTaq酶、1μL上游引物、1μL下游引物、1μL模板DNA混合,再加入17.5μL灭菌水,将混合物在94℃预变性5min,然后94℃变性45s,50℃退火45s,72℃延伸45s,进行35个循环,最后72℃延伸10min,4℃保存∞。
4.根据权利要求2所述的一种鉴别阿拉伯鱚与印度鱚的方法,其特征在于:所述上游引物序列为:5’-TTTAGTATTCGGAGCCTGAG-3’;下游引物序列为:5’-CCTCAACACCTGATGAGGCC-3’。
5.根据权利要求1所述的一种鉴别阿拉伯鱚与印度鱚的方法,其特征在于:所述DNA提取过程为:用标准酚-氯仿法提取阿拉伯鱚基因组总DNA和印度鱚基因组总DNA,以总DNA为模板,以引物进行PCR扩增,对扩增结果进行纯化、测序。
6. 根据权利要求5所述的一种鉴别阿拉伯鱚与印度鱚的方法,其特征在于:所述PCR扩增反应过程为:将2.5μL 10×buffer、2μL dNTPs、0.15uL rTaq酶、1μL上游引物、1μL下游引物、1μL模板DNA混合,再加入17.5μL灭菌水,将混合物在94℃预变性5min,然后94℃变性45s,50℃退火45s,72℃延伸45s,进行35个循环,最后72℃延伸10min,4℃保存∞,所述上游引物序列为:5’-TTTAGTATTCGGAGCCTGAG-3’;下游引物序列为:5’-CCTCAACACCTGATGAGGCC-3’。
7.一种鉴别阿拉伯鱚与印度鱚的分子标记引物,其特征在于:所述上游引物序列为:5’-TTTAGTATTCGGAGCCTGAG-3’;下游引物序列为:5’-CCTCAACACCTGATGAGGCC-3’。
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