[发明专利]唐氏综合征母体胎源性circRNA差异性表达谱图谱模型及其构建方法和构建系统

说明书

一种唐氏综合征母体胎源性circRNA差异性表达谱图谱模型及其构建方法和构建系统，其中构建方法包括如下步骤：设置疾病组与对照组，每组包括若干份相异人体的已经脱离人体的血标本；从血标本中分离单个核细胞；从单个核细胞的细胞悬液中提取总RNA；采用表达谱芯片分析疾病组和对照组总中RNA中的circRNA差异表达谱，得到circRNA差异数据；采用表达谱芯片分析疾病组和对照组中总RNA中的mRNA差异表达谱，得到mRNA差异数据；采用RT‑PCR验证疾病组和对照组中circRNA和mRNA的表达情况，得到对比数据；对circRNA差异数据、mRNA差异数据及对比数据进行数据分析，构建唐氏综合征母体胎源性circRNA差异性表达谱图谱模型。上述构建方法通过对血标本中的circRNA进行测序和分析，以探究circRNA在DS中的功能及其发生机制。

技术领域

本发明涉及生物医学技术领域，特别是涉及一种唐氏综合征母体胎源性circRNA差异性表达谱图谱模型及其构建方法和构建系统。

背景技术

唐氏综合征(Down Syndrome，DS)，即21-三体综合征，也可称作先天愚型或Down综合征，是由于第21号染色体异常而导致的出生缺陷类疾病，是出生缺陷疾病中最常见的一种染色体非整倍体遗传性疾病。该病在小儿中最为常见，在新生儿中的发病率约为1/800～1/600，患者的平均存活年龄为25岁。其主要特征为严重的先天性智力低下智力障碍、轻度至重度学习障碍、面容异常、身体发育迟缓，并常伴有先天性心脏病、免疫力低下、阿尔茨海默病等80多种疾病，DS患者罹患白血病的几率也比正常人高出20倍，DS患者通常生活不能自理，劳动能力低，社会适应能力较差，对家庭具有高度依赖性，因此给其所在的家庭和社会带来了沉重的负担。我国目前大约拥有DS患儿60万以上，而每年有27000例左右DS患儿出生。在国外，DS的发病数量占所有染色体疾病的91.60﹪，居于所有染色体异常疾病的首位。有关唐氏综合征的发病机制具体的发生机制目前仍不清楚，有待于进一步的探究。因此，需要进一步从分子水平上对唐氏综合征的发病机制作更深入的研究。

环状RNA(circular RNA，circRNA)作为最近被发现的一种特殊的新型内源非编码RNA，是RNA研究领域的研究热点。生物体内普遍存在着不能翻译为蛋白的功能性RNA分子，称为非编码RNA(non-coding RNAs，ncRNAs)。其中circRNA是一类通过反向剪接将3′和5′末端连接起来形成的环形RNA分子。按照剪接来源的不同，circRNA可分为内含子来源环状RNA以及外显子来源环状RNA。主要参与转录及转录后基因表达的调节。circRNA可能在疾病的发生和发展中发挥着重要的作用，有望成为某些疾病过程的潜在的生物标志物。介于某些circRNA含有一种或多种类型的miRNA结合位点，可充当竞争性内源RNA，从而调节miRNA的活性，并因此影响miRNA对靶基因的调节，因此通过circRNA与miRNA以及miRNA与疾病之间的关系表明circRNA可能在疾病的发生中具有调节作用(Ghosal S,Das S,Sen R,etal.Circ2Traits:a comprehensivedatabase for circular RNA potentiallyassociated with disease and traits[J].Frontiersin Genetics,2013,4(283):283)，例如癌症、心脏病、神经病症、动脉粥样硬化以及糖尿病等。

目前，避免DS患儿出生的唯一医疗手段是对孕妇进行全面的产前筛查和产前诊断。然而，传统的产前筛查具有检出率低、漏检率和假阳性率相对较高的缺点，胎儿染色体产前诊断相关方法则因为侵入式取样的手段容易产生出血、流产或患有其它并发症。而已有的无创性的产前诊断方法又存在步骤繁琐、成本较高等问题。因此，基于传统产前筛查和产前诊断的缺陷，以及已有无创性产前诊断方法不足的现状，探索新的无创性唐氏综合征胎儿产前诊断标志物具有非常重要的意义。

发明内容

基于此，有必要提供一种唐氏综合征母体胎源性circRNA差异性表达谱图谱模型及其构将方法和构建系统。