[发明专利]自闭症生物标志物及其应用在审

专利信息
申请号: 201710341200.7 申请日: 2017-05-04
公开(公告)号: CN107058561A 公开(公告)日: 2017-08-18
发明(设计)人: 王明帮;王艳;周家秀;周少明;何福生 申请(专利权)人: 深圳市英马诺生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 518019 广东省深圳*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 自闭症 生物 标志 及其 应用
【说明书】:

技术领域

发明属于生物医药领域,具体地,本发明涉及自闭症生物标志物及其应用。

背景技术

自闭症(ASD,Autism Spectrum Disorders)或称孤独症或者孤独症谱系障碍,是广泛性发育障碍的一种亚型,以男性多见,起病于婴幼儿期,主要表现为不同程度的言语发育障碍、人际交往障碍、兴趣狭窄和行为方式刻板,约有3/4的患者伴有明显的精神发育迟滞。据美国疾病监控与预防中心(CDC)数据,2015年其发病率1/45(即2.24%)。我国尚缺乏全国性流行病调查数据,若以1/100估算,预估我国ASDs患者将超过1000万。

自闭症(ASD)作为一种儿童精神疾病严重影响患儿的社会功能,给患儿家庭和社会带来沉重负担,但是目前自闭症通常根据量表进行评估,没有血液诊断方法和有效的治疗方案,这样诊断将依靠主观经验判断,不仅不能对自闭症的发病提供有效预警,而且诊断准确率很低。因此研究自闭症发病机理和可以体现其严重程度的生物标志物,并及时针对病因进行干预与治疗是治疗疾病、减轻社会负担的关键因素。

发明内容

本发明要解决的技术问题是提供了自闭症生物标志物;本发明还提供了用于诊断自闭症的试剂盒;本发明进一步还提供一种筛选易患自闭症的生物样品的系统。

本发明第一方面提供了自闭症生物标志物,包括肠道细菌的丰度和/或总数。

本发明第二方面提供了检测上述生物标志物的试剂组合在制备用于诊断自闭症的试剂盒中的用途。

本发明第三方面提供了一种自闭症诊断试剂盒,包括适用于检测所述的生物标志物的试剂组合;

在一优选例中,所述适用于检测权利要求1所述的生物标志物的试剂组合包括北京康为世纪的型号为CW2092S的StoolGen粪便DNA提取试剂盒;

在一优选例中,所述适用于检测权利要求1所述的生物标志物的试剂组合还包括美国赛默飞世尔公司提供的试剂盒和美国Illumina公司生产的Truseq DNA建库试剂盒;

在一优选例中,还包括分析所述生物标志物在体内是否异常的工具。

本发明第四方面提供了所述的生物标志物或所述的试剂盒在筛选易患自闭症的生物样品的系统中的应用。

本发明第五方面提供了一种筛选易患自闭症的生物样品的系统,包括:

核酸提取装置,所述核酸提取装置用于从所述生物样品和对照样品中提取核酸样本;

核酸序列确定装置,所述核酸序列确定装置与所述核酸提取装置相连,用于对所述核酸样本进行分析,以便确定所述核酸样本的序列;以及

判断装置,所述判断装置与所述测序装置相连,基于所述核酸样本的序列对生物样品和对照样品中肠道菌群所含的权利要求1的自闭症生物标志物进行分析,根据分析结果判断所述生物样品是否易患自闭症。

在一优选例中,所述核酸序列确定装置进一步包括:

文库构建单元,所述文库构建单元用于基于所述核酸样本,构建所述核酸的文库;以及

测序单元,所述测序单元与所述文库构建单元相连,对所述文库进行测序,以便确定所述核酸样本的序列,

在一优选例中,所述文库构建单元进一步包括:

PCR扩增模块,所述PCR扩增模块中设置特异性引物,以便利用所述特异性引物,对所述核酸样本进行扩增。

在本文中,术语“生物标志物”应做广义理解,其包括任何能够反映异常状态的任何可检测生物指标,可以包含基因标志物,物种标志物(种标志物/属标志物)以及功能标志物(KO/OG标志物),其具有非常广泛的用途,可用于疾病诊断、判断疾病分期或者用来评价新药或新疗法在目标人群中的安全性及有效性。

本发明具有以下有益效果:

本发明首次发现自闭症的致病与肠道细菌的丰度和/或总数有关,因此将肠道细菌的丰度和/或总数作为自闭症的检测标志物,这样自闭症的诊断将不依靠主观经验判断,不仅可以对自闭症的发病提供有效预警,而且可对其进行确诊,克服了自闭症的诊断较大程度的依赖于主观经验判断的缺陷,极大提高了诊断准确率。

附图说明

图1是第一期发现阶段自闭症组和对照组菌群丰度对比图,纵轴均取log10后的数据结果,每个点代表一个样品,**代表P值<0.01,T检验。

图2是第一期发现阶段自闭症组和对照组菌群种类(细菌数量)对比图,纵轴均取log10后的数据结果,每个点代表一个样品,**代表P值<0.01,T检验。

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