[发明专利]CYP2C19基因检测引物组、试剂盒及检测方法

说明书

本发明涉及基因工程及分子生物学领域，提供一种CYP2C19基因检测引物组，用于对含待测位点的核酸片段进行特异性扩增，所述待测位点包括CYP2C19基因上的rs4244285位点、rs4986893位点以及rs12248560位点中的至少一种，所述引物组包括rs4244285引物组、rs4986893引物组以及rs12248560引物组中的至少一种。本发明还提供了一种基因检测试剂盒及检测方法。本发明的基因检测引物组能够对含上述待测位点的核酸片段进行特异性扩增，使得对CYP2C19基因突变检测灵敏度高、假阳性率低；本发明采用第二代高通量基因测序技术对待测位点的基因型进行检测，使得检测周期短，通量高。

技术领域

本发明涉及基因工程及分子生物学领域，更具体地说，涉及一种CYP2C19基因检测引物组、试剂盒及检测方法。

背景技术

肝脏是人体重要的解毒器官，许多药物都经肝脏代谢，细胞色素P450(cytochrome P450 )是主要的肝细胞Ⅰ相代谢酶之一。在CYP2C亚家族中，CYP2C19亚型对药物反应起着关键性的作用，因为它们的活性存在显著的个体差异，表现为遗传多态性，从而产生血药浓度的个体差异。CYP2C19基因多态性对酸相关性疾病及幽门螺杆菌感染的治疗疗效、慢性肝病及肝移植患者的药物选择、抗癫痫药物及抗抑郁药物剂量的调整以及肿瘤高危性的判断、免疫抑制剂不良反应的大小等均有影响。通过对患者的CYP2C19基因进行检测，得到特定位点的基因型，以基因检测结果作为中间结果的信息的方法，不属于疾病的诊断方法；以基因型的检测结果来确定药物的选择，就可以实现个体化用药，避免对免疫抑制剂不良反应。

目前常用的CYP2C19基因突变检测方法主要采用Taqman荧光探针法。但Taqman荧光探针法灵敏度低、假阳性率高、耗时较长，通量小。

因此，需要一种新的检测CYP2C19基因基因突变的引物组、试剂盒及检测方法，使得对CYP2C19基因突变的灵敏度高，假阳性率高，且检测周期短。

发明内容

本发明的目的在于提供一种CYP2C19基因检测引物组、试剂盒及检测方法，旨在解决现有技术中CYP2C19基因检测灵敏度低、假阳性率高、周期长，通量小的技术问题。

本发明提供了一种CYP2C19基因检测引物组，用于对含待测位点的核酸片段进行特异性扩增，所述待测位点包括CYP2C19基因上的rs4244285位点、rs4986893位点或rs12248560位点中的至少一种，所述引物组包括rs4244285引物组、rs4986893引物组以及rs12248560引物组中的至少一种；

所述rs4244285引物组用于特异性扩增含rs4244285位点的核酸片段，包括rs4244285上游引物SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3或SEQ ID NO:4，以及rs4244285下游引物SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7或SEQ ID NO:8；

所述rs4986893引物组用于特异性扩增含rs4986893位点的核酸片段，包括rs4986893上游引物SEQ ID NO:9、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11或SEQ ID NO:12，以及rs4986893下游引物SEQ ID NO:13、SEQ ID NO:14、SEQ ID NO:15或SEQ ID NO:16；

所述rs12248560引物组用于特异性扩增含rs12248560位点的核酸片段，包括rs12248560上游引物SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19或SEQ ID NO:20，以及rs12248560下游引物SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23或SEQ ID NO:24。