[发明专利]多重荧光定量PCR的方法有效
申请号: | 201710121610.0 | 申请日: | 2017-03-02 |
公开(公告)号: | CN106868140B | 公开(公告)日: | 2022-10-18 |
发明(设计)人: | 虞之龙;刘玚;邱海维 | 申请(专利权)人: | 北京酷搏科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851 |
代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人: | 赵囡囡;吴贵明 |
地址: | 100871 北京市海淀区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 多重 荧光 定量 pcr 方法 | ||
1.一种多重荧光定量PCR的方法,其特征在于,所述方法包括:
将多个目标片段的扩增引物对置于同一扩增体系中进行PCR扩增,所述PCR扩增包括N轮PCR热循环,10≤N≤50,且所述同一扩增体系中包括双链DNA染料;
每一轮PCR热循环后,对PCR产物进行程序升温;
在对所述PCR产物进行程序升温的过程中,对所述PCR产物的荧光强度进行采集,从而获得所述多个目标片段形成的混合片段的熔解曲线;
建立各单一目标片段的熔解曲线,利用公式(1)对各所述单一目标片段的熔解曲线进行拟合;
将各所述单一目标产物的熔解曲线的拟合公式进行叠加,得到所述公式(2);
在所述公式(1)中,x表示温度,y表示观测到的相对荧光强度,参数a表示对应的单一目标片段的含量所对应的荧光强度,参数b表示对应的单一目标片段产物的荧光强度随温度线性变化的系数,参数c表征对应的单一目标片段在温度为Tm±5℃范围内荧光强度的下降速率,参数d表示背景荧光强度,参数Tm表示对应的单一目标片段的熔解温度,e为自然常数;
在所述公式(2)中,x表示温度,y表示观测到的相对荧光强度,n表示目标片段的数量,n为≥2的整数,i为自然数,参数ai表示第i个的目标片段的含量所对应的荧光强度,参数bi表示第i个目标片段的荧光强度随温度线性变化的系数,参数ci表征第i个目标片段在温度为Tmi±5℃范围内荧光强度的下降速率,参数d表示背景荧光强度,参数Tmi表示第i个目标片段的熔解温度,e为自然常数;
利用公式(2)对所述混合片段的熔解曲线进行拟合的方式,计算所述每一轮PCR热循环后各单一目标片段的含量,进而建立各单一目标片段的含量随PCR热循环次数增加而变化的扩增曲线;
根据各单一目标片段的扩增曲线计算得到各单一目标片段对应的Ct值,进而根据所述Ct值计算得到各单一目标片段的起始浓度。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述程序升温是按照0.5~10℃/s的升温速率从起点温度升至终点温度。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述起点温度为40~90℃,所述终点温度为60~100℃。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,对所述PCR产物的荧光产物进行采集的速率为0.2~100点/秒。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,建立各单一目标片段的熔解曲线的步骤包括:利用各单一目标片段对应的单一引物对进行PCR扩增,所述PCR扩增包括N轮PCR热循环,10≤N≤50,其中,每一轮PCR热循环的步骤包括:85~100℃的解链以及解链之后的40~75℃的延伸。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,在最后一轮PCR热循环后,采集各单一目标片段的PCR产物的荧光强度,建立各所述单一目标片段的熔解曲线。
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