[发明专利]一种与奶山羊乳蛋白率性状相关的分子标记及其应用

权利要求书

1.一种与奶山羊乳蛋白率性状相关的分子标记，其特征在于，其核苷酸序列如下所示：

ATGCCCAAATGAGCCTCCACTATTTAGAAACTAAGATTTCACATTTCCTTCTCCAGATTT

TATATTATGTTGTGTTAATTTATTCTTGTGAAGAACTCGTTGTATTCAAATCCATGTGTT

TCTCAATGRATCTACTTTTATCAGTCTTCATTGCCCTTTCCTAATTATCTGAAGGTAATT

TAATACATAATTAATGAGGAAATATGTGGTTATAAGGAGAGTAAAACTGTTATTAATTAG

CTTCTTATCTATTTCACAGGACCAAGTAAACATGAAGTTCTTCATTTTTACCTGCCTTTT

GGCCGTTGCCCTTGCAAAGCATGTAAGTCTAATAAGATACAGATGATAATATATTATGTA

AATATAAGAATATTAAATTTTTTATGAGGATAATGTCAGGGGTAGACAGCAGGGAATAGA

GAGGAAGTGTATAAATTTTGAAACCTATAATCAAAGATGGCCTTGGCTCT

上述序列129位突变位点的R是A或G，该突变导致HinfⅠ-RFLP多态性。

2.一种检测与奶山羊乳蛋白率性状相关的基因片段突变的引物对，其特征在于，其DNA序列如下所示：

正向引物CSN1S2F6:ATGCCCAAATGAGCCTCCAC

反向引物CSN1S2R6:AGAGCCAAGGCCATCTTTGA。

3.权利要求1所述的与奶山羊乳蛋白率性状相关的分子标记的制备方法，其特征在于，包括如下步骤：

S1.以山羊CSN1S2基因序列为模板，设计引物对CSN1S2F6、CSN1S2R6，其DNA序列如SEQID NO.2-3所示；

S2.构建PCR反应体系，以奶山羊基因组DNA为模板利用S1所得引物进行PCR扩增；

S3.步骤S2所得PCR产物测序，测序序列与山羊CSN1S2基因比对，获得与奶山羊乳蛋白率性状相关的分子标记，其DNA序列如SEQ ID NO.1所示，所述序列129位突变位点的R是A或G，该突变导致HinfⅠ-RFLP多态性。

4.如权利要求3所述的与奶山羊乳蛋白率性状相关的分子标记的制备方法，其特征在于，步骤S2中所述PCR反应体系为：1μL的50ng/μL奶山羊外周血基因组DNA，12.5μL的2×PCRMix，0.75μL10mM的正向引物CSN1S2F6,0.75μL10mM的反向引物CSN1S2R6,10μL的ddH₂O。

5.如权利要求3或4所述的与奶山羊乳蛋白率性状相关的分子标记的制备方法，其特征在于，步骤S2中所述PCR扩增条件为：95℃5min；94℃30s，60℃30s，72℃30s，30个循环；72℃延伸10min。

6.如权利要求3所述的与奶山羊乳蛋白率性状相关的分子标记的制备方法，其特征在于，步骤S2中所述奶山羊基因组DNA为随机选取奶山羊群体3个及以上个体基因组DNA，等量混合所得。

7.如权利要求3或6所述的与奶山羊乳蛋白率性状相关的分子标记的制备方法，其特征在于，步骤S2中PCR扩增产物经HinfⅠ酶切后产生130bp和340bp两条带，说明该个体CSN1S2两个等位基因129位突变位点均为A,判定为AA基因型；经HinfⅠ酶切后产生470bp、340bp和130bp三条带，说明该个体CSN1S2两个等位基因129位突变位点分别为A和G，判定为AG基因型；经HinfⅠ酶切后产生470bp一条带，说明该个体CSN1S2两个等位基因129位突变位点均为G，判定为GG基因型。