[发明专利]与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长相关的SNP标记及其应用

说明书

本发明公开了与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长相关的SNP标记及其应用。所述SNP标记分别如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.3所示；所述SEQ ID NO.1自5’端起第658位碱基为C或A，CC个体的生长速度显著高于AA个体；所述SEQ ID NO.2自5’端起第327位碱基为A或G，AA个体的生长速度显著高于GG个体；所述SEQ ID NO.3自5’端起第121位碱基为A或G，AA个体的生长速度显著高于GG个体。本发明所发现的3个SNP标记的应用，可大大降低大口黑鲈“优鲈1号”亲本筛选的盲目性，可以快速获得生长速度快且遗传稳定的大口黑鲈个体。

技术领域

本发明属于分子生物技术领域，具体涉及一种与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长相关的SNP标记及其应用。

背景技术

大口黑鲈(Micropterus salmoides L.)，俗名加州鲈，原产于北美洲，具有生长快、耐低温、肉质鲜美和易捕捞等特点，是重要的淡水养殖鱼类之一。1983年从台湾引种到广东省，现在全国大部分地区均有养殖。然而，目前我国养殖的大口黑鲈是由野生种家养驯化而成的，缺少定向选育，在亲本留种时经常选择个体小，性成熟早的个体作为亲本，致使我国大口黑鲈种质的下降，主要表现在生长速度下降、性成熟年龄普遍提前、饵料转化效率低、抗病力也大幅下降，其中，生长速度关系到大口黑鲈产量的高低，养殖效益的大小。养殖大口黑鲈生长速度慢、产量低直接影响大口黑鲈养殖业的健康稳定发展。因此，从分子遗传学角度加快改良大口黑鲈，提高其生长性能的工作势在必行。

大口黑鲈“优鲈1号”养殖新品种是以国内4个养殖群体为基础选育种群，采用传统的群体选育方法，以生长速度为主要指标，经连续5代选育获得的大口黑鲈选育品种。该新品种的生长速度比普通大口黑鲈快17.8%-25.3%，高背短尾的畸形率由5.2%降低到1.1%。该品种2010年通过全国水产原种和良种审定委员会审定，审定编号为GS01-004-2010。

挑选优质亲鱼是提高养殖鱼类生长速度的主要方法之一，其目的是为了改变养殖群体的遗传结构，使后代获得更快的生长速度、更好的抗病能力的遗传特点。在生产中，其传统方法是挑选个体较大、身体健壮的鱼作为留种亲本，即根据表型来决定亲鱼是否留种。这种方法方便、快捷、简单，但受人为因素影响很大，加上大口黑鲈属于肉食性为主的鱼类，掠食性强，饵料不足是会互相残食，致使其生长悬殊较大。如此可见，仅从表型判断大口黑鲈亲本质量往往达不到理想的效果。随着分子生物学和遗传学的发展，已涌现出很多种遗传标记，如AFLP、RAPD、SSR、SNP等标记，其中，SNP标记因分布广泛，适宜高通量自动化分析，遗传稳定，日益成为遗传育种研究中首选的遗传标记。若这些遗传标记能与生产性状相关联在一起，即可实现从DNA水平上进行选择育种，克服了传统方法受人为因素影响大的不利因素，提高了选择的准确性，并且可实现在早期鉴定出具有优良性状的个体，筛选出优良的后备亲本，从而缩短育种周期，加快育种进程。通过发现与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长有关的基因，提高快长亲本的筛选效率。

发明内容

本发明的目的在于提供一种与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长相关的SNP位点标记及其应用。

本发明所采取的技术方案是：

与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长相关的SNP标记，所述SNP标记分别如SEQ IDNO.1、SEQ ID NO.2 或SEQ ID NO.3所示；所述SEQ ID NO.1自5’端起第658位碱基为C或A；所述SEQ ID NO.2自5’端起第327位碱基为A或G；所述SEQ ID NO.3自5’端起第121位碱基为A或G。

其中：

序列为SEQ ID NO.1的SNP标记的CC基因型个体的生长速度显著高于AA基因型个体。

序列为SEQ ID NO.2的SNP标记的AA基因型个体的生长速度显著高于GG基因型个体。