[发明专利]与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长相关的SNP标记及其应用有效
申请号: | 201611155670.6 | 申请日: | 2016-12-14 |
公开(公告)号: | CN106701931B | 公开(公告)日: | 2020-09-18 |
发明(设计)人: | 李胜杰;樊佳佳;姜鹏;王俊杰;胡婕 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院珠江水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人: | 郑莹;胡辉 |
地址: | 510380 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 大口 优鲈 快速 生长 相关 snp 标记 及其 应用 | ||
1.与大口黑鲈“优鲈1号”快速生长相关的SNP标记,所述SNP标记分别如SEQ ID NO.1、SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.3所示;所述SEQ ID NO.1自5’端起第658位碱基为C或A;所述SEQID NO.2自5’端起第327位碱基为A或G;所述SEQ ID NO.3自5’端起第121位碱基为A或G。
2.根据权利要求1所述的SNP标记,其特征在于,序列为SEQ ID NO.1的SNP标记的CC基因型个体的生长速度显著高于AA基因型个体。
3.根据权利要求1所述的SNP标记,其特征在于,序列为SEQ ID NO.2的SNP标记的AA基因型个体的生长速度显著高于GG基因型个体。
4.根据权利要求1所述的SNP标记,其特征在于,序列为SEQ ID NO.3的SNP标记的AA基因型个体的生长速度显著高于GG基因型个体。
5.检测权利要求1-4任一项所述的SNP标记的特异性引物在检测大口黑鲈“优鲈1号”样本生长性状中的应用。
6.用于快速检测权利要求1-4任一项所述的SNP标记的引物对,其特征在于,用于检测SEQ ID NO.1所示SNP标记的引物对如SEQ ID NO.4和SEQ ID NO.5所示;用于检测SEQ IDNO.2所示SNP标记的引物对如SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8所示;用于检测SEQ ID NO.3所示SNP标记的引物对如SEQ ID NO.10和SEQ ID NO.11所示。
7.一种用于筛选快速生长大口黑鲈样本的试剂盒,其包括权利要求6所述的引物对。
8.一种快速生长大口黑鲈样本的筛选方法,其特征在于,对大口黑鲈样本SEQ IDNO.1、SEQ ID NO.2或SEQ ID NO.3SNP标记进行检测,所述SEQ ID NO.1自5’端起第658位碱基为C或A,所述SEQ ID NO.2自5’端起第327位碱基为A或G,所述SEQ ID NO.3自5’端起第121位碱基为A或G,选择SEQ ID NO.1SNP标记为CC基因型和/或SEQ ID NO.2SNP标记为AA基因型和/或SEQ ID NO.3SNP标记为AA基因型的个体。
9.根据权利要求8所述的筛选方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)提取待检样品基因组DNA;
(2)以提取得到的DNA为模板,利用权利要求6所述的引物对进行PCR扩增,得到PCR产物;
(3)对PCR扩增产物进行测序,根据测序结果确定样品的SNP标记的基因型来筛选快速生长样本。
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