[发明专利]一种猕猴桃溃疡病菌活菌的检测方法在审
申请号: | 201610230023.0 | 申请日: | 2016-04-13 |
公开(公告)号: | CN105779608A | 公开(公告)日: | 2016-07-20 |
发明(设计)人: | 周大祥;熊书 | 申请(专利权)人: | 重庆三峡学院 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/04 |
代理公司: | 重庆弘旭专利代理有限责任公司 50209 | 代理人: | 文巍 |
地址: | 404000 重*** | 国省代码: | 重庆;85 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 猕猴桃 溃疡 病菌 检测 方法 | ||
技术领域
本发明涉及一种检测猕猴桃溃疡病菌活菌的方法。
背景技术
猕猴桃溃疡病是由丁香假单孢杆菌猕猴桃致病变种(Pseudomonassyringae pv.actinidiae,Psa)引起,是猕猴桃生产中最严重的病害之一。目前,猕猴桃疡病菌的检测 已广泛应用PCR技术,但是传统的PCR检测技术不仅能扩增活菌的DNA,自由状态的DNA或死 菌DNA也能被扩增,导致检测出现假阳性。而且,目前的检测方法是以菌体为检测样本,不能 直接以猕猴桃树为检测对象,以植株为对象进行检测目标菌不易被检测,难度大,干扰因素 多,不易操作和推广。
叠氮溴乙锭(Ethidiummonoazidebromide,EMA)是一种染料,能够与核酸结合, 当光解后生成的氮宾化合物能够穿过死菌的细胞膜,与菌体DNA发生不可逆共价结合,PCR 扩增被抑制,但不会抑制细胞膜完整的活菌PCR扩增。EMA-PCR方法仅以活菌DNA分子为检测 靶标,克服了传统PCR检测假阳性较高的缺点,使结果更加有效、可靠。
发明内容
本发明的目的在于提供一种能特异、快速、准确检测枝干样品中猕猴桃溃疡病菌 的方法,克服了常规PCR方法的假阳性和假阴性。
本发明的目的是通过以下措施实现的:
一种检测猕猴桃溃疡病菌活菌的方法,包括以下步骤:
(1)将待检猕猴桃枝干洗净后切成小块,无菌水清洗后,分别用1%的次氯酸钠和 70%乙醇消毒,再用无菌水冲洗;
(2)将样品在无菌条件下碾碎后加入无菌蒸馏水浸泡2h,再进行增殖培养,即取上 清液接种到LB液体培养基中,25℃250r/min摇床培养8h;
(3)取增殖培养后的培养液避光添加终浓度为3μg/mL的EMA,以增殖培养后的培养 液热致死处理,即100℃水浴加热10min后,再避光添加终浓度为3μg/mL的EMA作为对照;再 室温避光静置5min,再置于冰上,距离650W卤钨灯15cm,持续曝光10min;
(4)取步骤(3)曝光处理后的菌液8000r/min离心5min,弃上清液,加无菌蒸馏水混 匀,以菌液作为PCR模板;
(5)以引物PsaF1(5’-TTTTGCTTTGCACACCCGATTT-3’)和PsaR2(5’- CACGCACCCTTCAATCAGGATG-3’),以步骤(4)的菌液为模板,进行PCR扩增;反应体系为25μL, 其中包括5U/μL的Taq聚合酶0.3μL,2.5mmol/L的dNTPs2μL,10×reactionBuffer2.5μL, 引物PsaF1/PsaR2(10mmol/L)各0.5μL,25mmol/LMgCl21.5μL,模板2.5μl,加超纯水补至 25μL;PCR反应程序为:94℃预变性2min;94℃15s,58℃30s,72℃30s,32个循环,最后72℃延 伸5min;琼脂糖电泳检测,出现条带表明存在活菌(+),没有出现条带则表明没有活菌(-)。
上述检测猕猴桃溃疡病菌活菌的方法,包括以下步骤:
(1)将待检猕猴桃枝干洗净后切成4mm×4mm的小块,无菌水清洗3次后分别用1% 的次氯酸钠和70%乙醇消毒1min,再用无菌水冲洗3次;
(2)将样品在无菌条件下碾碎后加入无菌蒸馏水0.8mL浸泡2h,取上层浸泡液 0.4mL接种到10mLLB液体培养基中,25℃250r/min摇床培养8h;
(3)取增殖培养后的培养液避光添加终浓度为3μg/mL的EMA;以增殖培养后的培养 液热致死处理,即100℃水浴加热10min后,再避光添加终浓度为3μg/mL的EMA作为对照;再 室温避光静置5min,再置于冰上,距离650W卤钨灯15cm,持续曝光10min;(4)PCR模板制备: 取经EMA曝光处理后的菌液1mL,8000r/min离心5min,弃上清液,加0.01mL无菌蒸馏水混匀, 以菌液作为PCR模板;
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