[发明专利]用于通过C9途径产生7‑碳化合物的方法和材料

权利要求书

1.产生8-羟基壬酸的方法，所述方法包括使用被归类于EC.1.14.14.1的单加氧酶将壬酸酶促转化为8-羟基壬酸。

2.权利要求1的方法，其中所述被归类于EC.1.14.14.1的单加氧酶与SEQ ID NO:18中示出的氨基酸序列具有至少70％的序列同一性。

3.权利要求1或2的方法，还包括使用仲醇脱氢酶、被归类于EC.1.14.13.-的单加氧酶，和酯酶将8-羟基壬酸酶促转化为7-羟基庚酸。

4.权利要求3的方法，其中所述酯酶被归类于EC.3.1.1.1或EC 3.1.1.3。

5.权利要求3的方法，其中所述酯酶与SEQ ID NO:22中示出的氨基酸序列具有至少70％的序列同一性。

6.权利要求1-5中任一项的方法，其中壬酸通过以下方法产生：使用硫酯酶将壬酰基-[acp]或壬酰基-CoA转化为壬酸。

7.权利要求6的方法，其中所述硫酯酶与SEQ ID NO:1、15、16或17中示出的氨基酸序列具有至少70％的同一性。

8.权利要求1-5中任一项的方法，其中使用脱羧酶和醛脱氢酶由2-氧代癸酸产生壬酸。

9.权利要求8的方法，其中所述脱羧酶与SEQ ID NO:23中示出的氨基酸序列具有至少70％的同一性。

10.权利要求3-9中任一项的方法，其中所述醇脱氢酶与SEQ ID NO:19中示出的氨基酸序列具有至少70％的同一性。

11.权利要求3-10中任一项的方法，其中所述被归类于EC.1.14.13.-的单加氧酶与SEQ ID NO:20或SEQ ID NO:21中示出的氨基酸序列具有至少70％的同一性。

12.用于生物合成7-羟基庚酸的方法，所述方法包括使用硫酯酶和被归类于EC.1.14.14.1的单加氧酶由壬酰基-CoA或壬酰基-[acp]酶促合成8-羟基壬酸，以及使用仲醇脱氢酶、被归类于EC.1.14.13.-的单加氧酶和酯酶将8-羟基壬酸酶促转化为7-羟基庚酸。

13.用于生物合成7-羟基庚酸的方法，所述方法包括使用脱羧酶、醛脱氢酶和被归类于EC.1.14.14.1的单加氧酶由2-氧代癸酸酶促合成8-羟基壬酸，以及使用仲醇脱氢酶、被归类于EC.1.14.13.-的单加氧酶和酯酶将8-羟基壬酸酶促转化为7-羟基庚酸。

14.权利要求12或13的方法，其中所述被归类于EC.1.14.14.1的单加氧酶与SEQ ID NO:18中示出的氨基酸序列具有至少70％的序列同一性。

15.权利要求12或14的方法，其中所述硫酯酶与SEQ ID NO:1、15、16或17中示出的氨基酸序列具有至少70％的同一性。

16.权利要求12-15中任一项的方法，其中所述酯酶与SEQ ID NO:22中示出的氨基酸序列具有至少70％的序列同一性。

17.权利要求12-16中任一项的方法，其中所述被归类于EC.1.14.13.-的单加氧酶与SEQ ID NO:20或SEQ ID NO:21中示出的氨基酸序列具有至少70％的序列同一性。

18.权利要求12-17中任一项的方法，其中所述仲醇脱氢酶与SEQ ID NO:19中示出的氨基酸序列具有至少70％的同一性。

19.权利要求13-18中任一项的方法，其中所述脱羧酶与SEQ ID NO:23中示出的氨基酸序列具有至少70％的同一性。

20.权利要求12-19中任一项的方法，所述方法还包括在一个或多个步骤中将7-羟基庚酸酶促转化为庚二酸、7-氨基庚酸、七亚甲基二胺或1,7-庚二醇。

21.权利要求20的方法，其中使用单加氧酶、伯醇脱氢酶、6-羟基己酸脱氢酶、7-氧代庚酸脱氢酶、6-氧代己酸脱氢酶、5-氧代戊酸脱氢酶或醛脱氢酶中的一种或多种将7-羟基庚酸转化为庚二酸。