[发明专利]用于检测含有mecC的甲氧西林抗性的金黄色葡萄球菌的组合物和方法

权利要求书

1.一种检测样品中含有mecC的金黄色葡萄球菌(mecC-MRSA)的方法，所述方法包括：

- 执行扩增步骤，所述扩增步骤包括使所述样品与和orfX基因的一部分杂交的寡核苷酸引物和mecC-MRSA寡核苷酸引物接触，如果mecC-MRSA存在于所述样品中，则产生扩增产物；

- 执行杂交步骤，所述杂交步骤包括使所述扩增产物与可检测的mecC-MRSA寡核苷酸探针接触；和

- 检测所述扩增产物的存在或不存在，其中所述扩增产物的存在指示mecC-MRSA在所述样品中的存在，且其中所述扩增产物的不存在指示mecC-MRSA在所述样品中的不存在；

其中所述mecC-MRSA寡核苷酸引物由选自SEQ ID NO: 1、2、3、6和8的序列组成；

其中与orfX基因的一部分杂交的所述寡核苷酸引物由SEQ ID NO: 9的序列组成；并且

其中所述可检测的mecC-MRSA寡核苷酸探针由SEQ ID NO: 10的序列或其互补物组成。

2.根据权利要求1的方法，其中：

- 所述杂交步骤包括：使所述扩增产物与探针接触，所述探针用供体荧光部分和对应的受体荧光部分标记；且

- 所述检测步骤包括：检测探针的供体荧光部分和受体荧光部分之间的荧光共振能量转移(FRET)的存在或不存在，其中所述荧光的存在或不存在指示mecC-MRSA在所述样品中的存在或不存在。

3.根据权利要求1或2中任一项的方法，其中所述扩增采用具有5'至3' 核酸酶活性的聚合酶。

4.根据权利要求2的方法，其中所述供体荧光部分和对应的受体荧光部分在探针上彼此不超过8个核苷酸。

5.根据权利要求2或4中任一项的方法，其中所述受体荧光部分是猝灭剂。

6.根据权利要求1-2或4中任一项的方法，其中所述与orfX基因的一部分杂交的寡核苷酸引物和所述mecC-MRSA寡核苷酸引物具有40个或更少的核苷酸。

7.一种用于检测含有mecC的金黄色葡萄球菌(mecC-MRSA)的核酸的试剂盒，所述试剂盒包括：

- 第一寡核苷酸引物，其由选自SEQ ID NO: 1、2、3、6和8的序列组成；

- 第二寡核苷酸引物，其被构造成与orfX基因的一部分杂交并且由SEQ ID NO: 9的序列组成；和

- 可检测地标记的寡核苷酸探针，其被构造成与由所述第一寡核苷酸引物和所述第二寡核苷酸引物产生的扩增子杂交并且由SEQ ID NO: 10的序列或其互补物组成。

8.根据权利要求7的试剂盒，其中所述可检测地标记的寡核苷酸探针包含供体荧光部分和对应的受体荧光部分。

9.根据权利要求8的试剂盒，其中所述受体荧光部分是猝灭剂。

10.根据权利要求7-9中任一项的试剂盒，所述试剂盒还包含核苷三磷酸、核酸聚合酶和所述核酸聚合酶的功能所必需的缓冲液。

11.根据权利要求7-9中任一项的试剂盒，其中所述第一寡核苷酸引物和所述第二寡核苷酸引物和/或所述寡核苷酸探针具有40个或更少的核苷酸。