[发明专利]用于核酸高通量测序的方法

说明书

用于自动化高通量核酸测序的可扩展反应与检测系统，所述自动化高通量核酸测序涉及化学过程和独立于化学过程的观测过程的组合。分离的功能单元可以以如下方式配置，所述方式允许所述系统互换使用联合用于光学图像采集和/或分析的分离的设备组件的不同的测序反应组件。

相关申请的交叉引用

本申请根据美国法案35篇119条e项要求于2007年10月30日提交的题为“用于核酸高通量测序的装置(Apparatus For High Throughput Sequencing Of Nucleic Acids)”的第60/983,886号美国临时申请的权益，其内容通过其全文引用并入本文。

关于联邦资助研究或开发所完成发明的权利的声明

不适用

对光盘提交的《序列表》、表格或计算机程序表附件的引用

不适用

发明背景

本发明一般地涉及核酸的自动化光学检测领域。本发明一般涉及用于核酸自动化高通量测序的可扩展的反应和检测系统。

人类基因组计划的到来需要开发改进的方法，用于诸如DNA(脱氧核糖核酸)和RNA(核糖核酸)的核酸的测序。人类基因组全部的 3,000,000,000碱基序列的测定已为鉴定众多疾病的遗传基础提供了依据。然而，仍需要做大量工作以鉴定关联每种疾病的遗传变异，并且为每个个体(二倍体人类基因组大小)测序6,000,000,000碱基的现有成本不仅仍然极其困难，而且高不可攀。

随着DNA测序系统的发展，许多公司已经着手高通量DNA测序的挑战。虽然这样的系统已经降低了成本，并增加了DNA测序的效率，但这些系统通常是具有多个互相依赖的组件的整装单元。这样的单一单元测序系统有许多局限，包括有限的可扩展性，在特定组件上引入创新的时间延滞，和整个系统的功能对系统每个组件的直接依赖性。

已知用于测序反应和分析的流动池。这样的流动池的实例包括含有为测序反应性能所用的任意基质的那些流动池，诸如在本文中较为详尽叙述的那些，以及记载于美国专利号5,958,760、6,403,376、6,960,437、 7,025,935、7,118,910、7,220,549、7,244,559、7,264,929、WO01/35088和公开的美国专利申请号2007/0128610中的那些。

本发明解决了已知现有技术的局限。

定义

为了在当前技术上具备足够的背景，有助地是，理解下列技术术语。

“扩增子”指多核苷酸扩增反应的产物，即，自一条或多条起始序列复制得到的多核苷酸群。扩增子可以通过多种扩增反应来生成，包括但不限于聚合酶链式反应(PCR)，线性聚合酶反应，基于核酸序列的扩增，滚环扩增等等(参阅如美国专利号4,683,195、4,965,188、4,683,202、 4,800159、5,210,015、6,174,670、5,399,491、6,287,824和5,854,033；以及美国公开号2006/0024711)。